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使用 OT-2 自動(dòng)化移液平臺(tái)進(jìn)行高效核酸提取
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簡介
高通量基因組分析是生命科學(xué)研究中不可或缺的重要工具,這項(xiàng)技術(shù)在推動(dòng)科研進(jìn)步方面發(fā)揮著
至關(guān)重要的作用很重要。為了滿足了科研領(lǐng)域?qū)Ω咝芰退?、?zhǔn)確制備方法的迫切需求,seqWell 的 Express Plex?
Library Kit 提供了一種專門用于高通量制備質(zhì)粒和擴(kuò)增子文庫的解決方案異常狀況。
在傳統(tǒng)的手工制備文庫方法中研究,完成 96 個(gè)樣品的制備需要耗費(fèi)長達(dá) 90 分鐘的時(shí)間,其中手動(dòng)操
作時(shí)間占據(jù)了 30 分鐘應用創新。這種方式不僅效率低下提高,還容易因?yàn)槿藶橐蛩匾胝`差。
為了改進(jìn)這一狀況逐漸完善,本文對(duì)比了兩種文庫制備方法,一種是在 Opentrons Flex? 移液工作站上使用
seqWell ExpressPlex? Library Kit 合理需求,另一種是手工制備文庫是目前主流。
通過結(jié)合 Flex 移液工作站與 seqWell ExpressPlex? Library Kit,我們可以顯著縮短文庫制備時(shí)
間高質量,提高樣本通量充分發揮。這種自動(dòng)化的解決方案不僅提升了制備效率,還降低了人為誤差的風(fēng)險(xiǎn)管理,為生命科學(xué)
研究提供了更為可靠設計、高效的工具。
材料與方法
ExpressPlex 工作流程:
根據(jù) Express Plex 的工作流程,我們?cè)?Flex 自動(dòng)化移液工作站上進(jìn)行文庫制備就此掀開。實(shí)驗(yàn)過程中長足發展,我們輸入
16 ng 的 pUC19 ,再將所有組分加入反應(yīng)板 穩步前行, 用 3000 rpm 的轉(zhuǎn)速混勻 90 秒結構不合理,然后進(jìn)行后續(xù)的文庫制
備和混合步驟。最終的文庫在 NextSeq 2000 測(cè)序儀上進(jìn)行 2X150 bp 測(cè)序逐步改善。
圖 1.
A ) Express Plex 工作流程包括將 index 和 DNA 加入 反應(yīng)板(已含有酶等混合物)意見征詢,然后進(jìn)行擴(kuò)增、混合
和 MAGwise 磁珠純化大大提高;
B ) Flex 工作站包括吸頭盒的必然要求、模塊、轉(zhuǎn)板抓手和其他配件取得了一定進展;
C ) Flex 工作站板位設(shè)置完善好,用于在擴(kuò)增后將 4 個(gè)反應(yīng)板進(jìn)行文庫混合。
結(jié)果
圖 2 . A ) 結(jié)果顯示 96 孔板中文庫數(shù)據(jù)變異系數(shù)( CV )為 12.7%可能性更大; B ) 95% 的文庫數(shù)據(jù)通過了數(shù)據(jù)預(yù)處
理部署安排,為高質(zhì)量數(shù)據(jù),且超過 90% 文庫質(zhì)量得分達(dá)到 Q30技術; C ) 由 Flex 制備的文庫比手動(dòng)制備的文庫濃度
更高推廣開來。
圖 3 . 利用錯(cuò)開的開始時(shí)間,可以在 Opentrons FlexTM 上 3 小時(shí)內(nèi)制備 8 個(gè)獨(dú)立的 96 混 1 文
庫相對較高。在 Flex 上設(shè)置第一塊反應(yīng)板后資源配置,可以在 24 小時(shí)內(nèi)完成 768 個(gè)文庫的制備。
結(jié)論
在 Flex 移液平臺(tái)上制備的 96 個(gè) pUC19 質(zhì)粒樣本文庫呈現(xiàn)出了高度均一的質(zhì)量大幅增加,充分證明了 Flex
平臺(tái)在自動(dòng)化文庫制備方面的卓越性能特性。
與手動(dòng)制備相比,自動(dòng)化文庫制備不僅穩(wěn)定性更佳等特點,而且文庫濃度更高建言直達。此外,超過95%的讀數(shù)成
功通過測(cè)序儀質(zhì)檢 PF將進一步,這進(jìn)一步驗(yàn)證了自動(dòng)化制備流程的高效性和準(zhǔn)確性充分發揮。
Flex 移液工作站支持在單次運(yùn)行中處理多達(dá) 384 個(gè)樣本,極大地提高了樣本處理效率成就。通過合理
安排時(shí)間重要方式,我們甚至可以在 24 小時(shí)內(nèi)處理高達(dá) 768 個(gè)樣本,從而滿足大規(guī)模高通量基因組分析的需求系統。
在 Flex 平臺(tái)上自動(dòng)化 ExpressPlex? Library Prep Kit 工作流程非常重要,我們實(shí)現(xiàn)了從提取的質(zhì)粒/擴(kuò)增
子 DNA 到數(shù)據(jù)生成的全流程自動(dòng)化進一步提升。這一解決方案不僅簡化了操作步驟,降低了人為誤差營造一處,而且顯著提
高了實(shí)驗(yàn)效率和數(shù)據(jù)質(zhì)量改革創新,為生命科學(xué)研究領(lǐng)域的發(fā)展注入了新的動(dòng)力。
經(jīng)驗(yàn)豐富的服務(wù)團(tuán)隊(duì)和強(qiáng)大的生產(chǎn)支持團(tuán)隊(duì)為客戶提供無憂的訂單服務(wù)資源優勢。