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如何使用自動化臺式熱循環(huán)儀節(jié)省實驗室時間

PCR 技術的省時演進

在液體處理器的平臺上使用和不平臺上使用自動熱循環(huán)儀的區(qū)別在于回收的時間開放以來。如果實驗室里有六個額外的小時落實落細,你會做什么創造?

與生命本身一樣,現代生物技術基于精確復制 DNA 的能力引領。生物學家劫持了細胞中內置的核酸復制機制,創(chuàng)建了聚合酶鏈式反應 (PCR)——這是現代分子生物學的基石方法,允許它們自己復制 DNA高端化。
1983 年穩定性,諾貝爾獎獲得者凱里·穆利斯 (Kary Mullis) 表明像一棵樹,您可以通過精確的溫度序列來協(xié)調樣本過程中,從而操縱目標 DNA 序列的復制。當時全面協議,進行 PCR 實驗意味著科學家需要花費數小時手動將試管移入和移出不同溫度的水浴重要部署,以實現這些溫度循環(huán)。
1988 年工具,Celtis 和 Perkin-Elmer 推出了一種名為熱循環(huán)儀的設備智慧與合力,用于自動執(zhí)行 PCR 實驗所需的精確溫度變化。
它比水浴法更快重要的角色、更高效開放要求,但成本超過 100,000 美元——遠遠超出了大多數生物學家的承受能力。直到 90 年代中期平臺建設,ML Laboratories 等公司開始制造價格更實惠的帶加熱蓋的機器服務機製,大多數實驗室才開始使用熱循環(huán)儀。

自動化臺式熱循環(huán)儀

PCR 技術的省時演進

如今使用,PCR 的省時創(chuàng)新似乎停滯不前大幅拓展。盡管已經創(chuàng)建了新型 PCR(如定量和數字 PCR),但自 20 世紀 90 年代中期以來足夠的實力,在省時方面并沒有取得重大進展緊迫性。大多數生物學家仍在使用與 20 年前發(fā)明的熱循環(huán)儀技術上類似的熱循環(huán)儀,并且每周仍要花費數小時手動準備反應更適合。Opentrons 熱循環(huán)儀代表了 PCR 用戶在省時方面的下一個重大飛躍高效。

為什么節(jié)省時間如此重要

機器人讓您可以并行工作,以更快完成更多工作——尤其是配備熱循環(huán)儀的機器人要素配置改革,它們可以處理更長的工作流程體系。

第一種節(jié)省時間的方式是基本的一對一任務完成的好處。如果一個人可以在一小時內準備 100 個樣本帶動產業發展,并在一小時內回復 10 封電子郵件責任製,那么他們需要 2 小時來完成這兩項任務。但如果他們讓機器人進行樣品準備倍增效應,他們可以在 1 小時內完成這兩項任務——這是一種相當簡單的提高生產率的方法促進善治。

但是,當您考慮更長的時間段時多樣性,節(jié)省的時間會成倍增加發揮效力。假設您有 600 個樣本需要準備,以每小時 100 個樣本的相同速度進行機器人運行明顯。還有一個六小時的會議安全鏈,您有機會出席。

您可以自動準備樣品并參加會議嗎?

理論上真正做到,當然可以:6 小時 x 100 個樣本/小時 = 600 個樣本科普活動。但是誰來裝載和卸載機器人?誰來在運行之間設置自動化強化意識?你可以自動化所有 6 小時的樣品準備長期間,但你只能在六個一小時的時間段內完成。所以現場,即使你可以為自己節(jié)省六個小時的生產力高端化,你也不能去參加會議。你需要的(在這個例子中)是一個可以在一次運行中完成所有 600 個樣本的機器人我有所應。這樣提單產,你就可以點擊“開始”,在六個小時后在會議上展示后回來至關重要,完成你所有的實驗室工作精準調控。一個六小時的時間段和六個一小時的時間段之間的差異可能是有意義的工作和忙碌的工作之間的差異。此外應用的因素之一,有些工作只需要長時間不間斷的時間來完成解決。在《制造者的時間表,經理的時間表》一文中敢於監督,保羅·格雷厄姆指出幅度,一些創(chuàng)造性的任務,如寫一篇文章或編寫一個算法更合理,最好以這種方式完成:一個小時是不夠的,不足以集中精力并取得有意義的進展更優美。只有兩個小時的時間來完成這些復雜的任務各方面,你幾乎沒有足夠的時間進入狀態(tài)——更糟糕的是,一旦你進入心流狀態(tài)成效與經驗,你就不得不放棄適應性。

臺式熱循環(huán)儀如何為您節(jié)省大量時間

如果您的實驗室已經實現了從基因分型和測序到克隆和基因編輯等工作流程的自動化,那么在液體處理機器人上添加一臺臺式熱循環(huán)儀可以將您的空閑時間增加 3 倍稍有不慎。充分利用集成熱循環(huán)儀的協(xié)議非常復雜重要作用,涉及孵育或 PCR 步驟之前和之后的多個子協(xié)議。讓我們以下一代測序 (NGS) 文庫制備協(xié)議為例最為顯著。通過僅自動化工作流程中的移液和磁珠處理步驟尤為突出,您可以減輕大約 2/3 的工作量。
這就是酶促制備(碎片化 + a-tailing 等)環境、清理空間載體、索引和池化步驟,這些步驟可以由帶有磁性模塊的 OT-2 機器人完成。
如果機器人的甲板上沒有熱循環(huán)儀重要組成部分,那么一個人(或另一個更昂貴的機器人)必須親自將準備好的反應物移入熱循環(huán)儀流程。擴增完成后,他們還需要親自取回樣品——將它們從熱循環(huán)儀上取下勃勃生機,然后放回機器人上助力各業,進行最后的磁性和移液步驟。

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