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2020 年 12 月 22 日

客戶訪談 | Fidabio 產(chǎn)品軟件與 OT-2 Python API 集成案例

Fidabio 使用 OT-2 和 Opentrons Python Protocol API 創(chuàng)建了分析蛋白質(zhì)相互作用的設(shè)備取得了一定進展,用于生物藥物開發(fā)狀況。

Fidabio是一家由哥本哈根大學(xué)的研究人員創(chuàng)立的生物技術(shù)公司,坐落于丹麥創造性,核心業(yè)務(wù)是幫助科研工作者推進(jìn)復(fù)雜的生物學(xué)項(xiàng)目解決問題,例如多重結(jié)合蛋白系列、脂質(zhì)體、外泌體和雙特異性研究項(xiàng)目相互配合。Fidabio發(fā)明的FIDA技術(shù)可在天然條件下對(duì)蛋白質(zhì)和納米顆粒進(jìn)行簡(jiǎn)單、準(zhǔn)確和快速的檢測(cè)和表征著力增加。

今天我們采訪的是 Fidabio 的 CEO Brian S?rensen 和 CSO Henrik Jensen智能化。為了創(chuàng)建一臺(tái)用于分析生物藥物開發(fā)過程中的蛋白質(zhì)間相互作用的設(shè)備。他們使用了 Opentrons OT-2 自動(dòng)化移液機(jī)器人Opentrons Python API 以及他們自己的軟件集成創(chuàng)建了用于樣品制備的復(fù)雜稀釋工作流程處理。Brian S?rensen 和 Henrik Jensen 會(huì)給大家分享他們的 OT-2 的使用體驗(yàn)建設。

Opentrons: 請(qǐng)您介紹一下您的研究背景

Brian S?rensen:?我們一直在哥本哈根大學(xué)工作助力各行,直到去年年底前來體驗。

Henrik Jensen:?在大學(xué)里,我們使用OT-2自動(dòng)化移液平臺(tái)進(jìn)行樣品制備工作流程中的梯度稀釋工作確定性。我認(rèn)為 OT-2 自動(dòng)化帶來(lái)的便利性能夠有助于在實(shí)驗(yàn)室內(nèi)進(jìn)行整體集成更加廣闊。

Opentrons: 您的研究項(xiàng)目是什么樣的?

Brian S?rensen:?我們的內(nèi)部試點(diǎn)通常是小型實(shí)驗(yàn)講故事,手動(dòng)移液也是可以滿足的非常完善。但是,當(dāng)我們的客戶需要進(jìn)行大型實(shí)驗(yàn)時(shí)全面革新,讓技術(shù)人員僅靠提升手動(dòng)移液速度來(lái)實(shí)現(xiàn)是不可行的作用。機(jī)器人可以代替人工移液,科研人員可以把這些時(shí)間節(jié)省下來(lái)用來(lái)做實(shí)驗(yàn)分析行業分類。一旦實(shí)驗(yàn)涉及更大的稀釋系列最為突出,或需要分裝更多樣品時(shí),就需要用到自動(dòng)化相結合。我舉一個(gè)例子高效化,我有一個(gè)客戶分析了附近醫(yī)院的數(shù)千個(gè)患者樣本技術先進,這么大批量的操作是需要通過自動(dòng)化來(lái)實(shí)現(xiàn)的。

Opentrons: 您為什么選擇 OT-2延伸?

Brian S?rensen:?我們購(gòu)買了獨(dú)立的液體處理機(jī)器人認為,但很快就發(fā)現(xiàn)我們可以將其與我們自己的軟件集成。

Henrik Jensen:?自動(dòng)化的優(yōu)勢(shì)我認(rèn)為有以下幾點(diǎn):第一新趨勢,可以幫助我們處理大量的樣本反應能力。第二,在實(shí)驗(yàn)室工作中學習,準(zhǔn)確性也很重要結構重塑。如果您能以標(biāo)準(zhǔn)化的方式進(jìn)行工作,則自動(dòng)化有利于改善結(jié)果應用優勢。

Brian S?rensen:?可重復(fù)性是關(guān)鍵高質量發展,您在實(shí)驗(yàn)室中人為因素越高,則可重復(fù)性就越低高效節能。

Henrik Jensen:?第三影響力範圍,如果您可以使用機(jī)器人,在整個(gè)工作流程中我們對(duì)操作員在知識(shí)和技能層面的要求將變得更小新創新即將到來。

Brian S?rensen:?如果您只是做一些常規(guī)分析邁出了重要的一步,那么您可以手動(dòng)完成所有工作。但這可能不是進(jìn)行整個(gè)檢測(cè)的最佳方式設施,且不能更好地發(fā)揮技術(shù)人員的最大價(jià)值需求。

Henrik Jensen:?使用自動(dòng)化移液平臺(tái),您可以更輕松地記錄您的研究組合運用,因?yàn)槟梢怨蚕硪埔耗_本更讓我明白了,研究人員可以重現(xiàn)數(shù)據(jù)。自動(dòng)化能夠詳細(xì)呈現(xiàn)您的下一步操作以及歷史操作積極。

Brian S?rensen:?如果您想將您的實(shí)驗(yàn)從實(shí)驗(yàn)室轉(zhuǎn)移到另一個(gè)實(shí)驗(yàn)室探索,并且實(shí)驗(yàn)中有手動(dòng)步驟?—

Henrik Jensen:?—自動(dòng)化要容易得多。這一因素也是我們將制備環(huán)節(jié)甚至整個(gè)工作流程都變成自動(dòng)化的根本原因之一集聚。

Brian S?rensen:?最初集成OT-2時(shí)競爭力,我們認(rèn)為它是一個(gè)不錯(cuò)的小眾應(yīng)用。但是哪些領域,當(dāng)我們看到更多客戶也有興趣將 OT-2 作為其 Fidabio 工作流程的一部分敢於挑戰。我們可以在軟件中看到無(wú)縫集成更多實(shí)驗(yàn)室的可能性。于是我們就把Fidabio的軟件和Opentrons連接在一起建立和完善。

Opentrons 集成到 Fidabio 的軟件平臺(tái)上提供了遵循。 圖片來(lái)源:Fidabio

Opentrons: 您的OT-2的實(shí)際使用體驗(yàn)怎么樣?

Henrik Jensen:?從硬件的角度來(lái)看,它即插即用服務效率,非常方便明確相關要求。不過在協(xié)議方面仍然有一些需要我們學(xué)習(xí)的地方,但其實(shí)這也不難統籌發展。我們的軟件工程師 Morten 自己編寫了腳本深化涉外。腳本的創(chuàng)建實(shí)際上非常簡(jiǎn)單。

Brian S?rensen:?OT-2 可以無(wú)縫融入我們的工作流程生產製造。它簡(jiǎn)化了生成結(jié)合曲線的工作開展試點。我們把大量重復(fù)移液的工作交給機(jī)器人完成而不是占用技術(shù)人員的時(shí)間,節(jié)省了人力成本和時(shí)間成本共同。同時(shí) OT-2 這非常適合我們的系統(tǒng)以及其他自動(dòng)化實(shí)驗(yàn)室系統(tǒng)推進一步。它是一個(gè)端到端的自動(dòng)化工作流程。

Henrik Jensen:?我們之前沒有這方面的經(jīng)驗(yàn)簡單化。但是力度,由于我們自己也是儀器開發(fā)人員,我們已經(jīng)對(duì)這個(gè)過程已經(jīng)有了很好的理解系統性。

Opentrons: 在購(gòu)買OT-2之前勇探新路,您使用過其他實(shí)驗(yàn)室自動(dòng)化設(shè)備嗎?您對(duì)實(shí)驗(yàn)室自動(dòng)化的過程有什么期望便利性?

Brian S?rensen:?當(dāng)我們開發(fā)自己的平臺(tái)時(shí)方法,高度自動(dòng)化對(duì)我們來(lái)說很重要。從這個(gè)意義上說提供有力支撐,OT-2 很好地增強(qiáng)了我們自己的一個(gè)關(guān)鍵賣點(diǎn)。它與我們自己平臺(tái)中的關(guān)鍵元素之一非常吻合保供。

Opentrons: 您使用 OT-2 的具體用途是什么自行開發,它如何融入您的工作流程?

Brian S?rensen:?對(duì)我們來(lái)說責任,我們銷售的儀器必須非常精確應用情況。我們知道我們的技術(shù)有能力提供非常準(zhǔn)確的數(shù)據(jù),但在生物學(xué)界應用前景,即使是很小的變化也會(huì)影響結(jié)果交流等。尤其是我們使用的應(yīng)用程序(例如藥物研發(fā))效率,我們必須確保我們盡可能多地控制實(shí)驗(yàn)。為保障更好的實(shí)驗(yàn)產(chǎn)出嚴(yán)格控制準(zhǔn)備過程。

Henrik Jensen:?在我們整合之前創造,我們有一個(gè)分析開發(fā)合作伙伴,它允許我們將信息輸入系統(tǒng)交流,系統(tǒng)會(huì)計(jì)算出您需要什么來(lái)制作解決方案拓展應用。以前我們是手動(dòng)進(jìn)行的。但接下來(lái)我們會(huì)用OT-2制作腳本推動,而不是手動(dòng)進(jìn)行相對較高。

Opentrons: 您是否有其他自動(dòng)化項(xiàng)目的計(jì)劃資源配置?

Brian S?rensen:?我們一直在尋找進(jìn)一步的發(fā)展。雖然我們公司還年輕相關,但我們正在快速發(fā)展期大力發展,未來(lái)可能會(huì)嘗試更多的整合和開發(fā)項(xiàng)目。

Opentrons: 關(guān)于使用 OT-2生產效率,您還有其他想要分享的嗎產能提升?

Henrik Jensen:?開放性以及與多個(gè)平臺(tái)集成的能力是 Opentrons 產(chǎn)品的一個(gè)非常重要的優(yōu)勢(shì)。

Brian S?rensen:?我們已經(jīng)與 Opentrons 的產(chǎn)品開發(fā)團(tuán)隊(duì)討論了我們產(chǎn)品之間進(jìn)一步集成的方式保持穩定,以便為我們的客戶提供無(wú)縫銜接的工作流程并提高用戶效率總之。這個(gè)需求目前在市場(chǎng)上需求量很大。我們?cè)诳蛻糁锌吹降内厔?shì)是:他們對(duì)量化和準(zhǔn)確性的需求與日俱增支撐作用;且越復(fù)雜的實(shí)驗(yàn)室工作流程研學體驗,要求就越多……而且消除錯(cuò)誤源的需求也越大。實(shí)驗(yàn)室自動(dòng)化的驅(qū)動(dòng)力不是自動(dòng)化本身最為突出,而是它可以提供最高質(zhì)量的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)落實落細。

Henrik Jensen:?自動(dòng)化不僅僅是為了給實(shí)驗(yàn)室創(chuàng)造更便宜、更易于使用的產(chǎn)品高效化。我們必須考慮如何實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化的方法製高點項目,必須考慮整個(gè)實(shí)驗(yàn)過程。

Brian S?rensen: 生物技術(shù)公司長(zhǎng)期以來(lái)一直在努力解決這個(gè)問題範圍和領域∮兴黾??蛻粽趯ふ铱梢詭椭麄冏龀鰶Q定的東西。他們能盡快找到解決方案更高要求,他們的開發(fā)過程就越高效估算。這是該過程中的一個(gè)重要突破。

點(diǎn)擊這里下載 Fidabio 的軟件說明Opentrons 集成信息的可能性。

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