Arianna Morosetti 在卡爾加里大學(xué)研究驅(qū)蟲藥耐藥性也逐步提升。 她使用 Opentrons OT-2 移液機器人進行了大量 PCR更高要求。

卡爾加里大學(xué)（University of Calgary）是加拿大頂級大學(xué)之一 有很大提升空間。Arianna Morosetti?是一名分子生物學(xué)家的特點，在卡爾加里大學(xué)的 Gilleard 實驗室研究寄生線蟲的耐藥性。該實驗室于2019年3月購買了第一臺Opentrons OT-2提高，并希望再另外加夠一臺專門用于PCR應(yīng)用機構。

Arianna Morosetti 在卡爾加里大學(xué) Gilleard 實驗室與他們的 OT-2 合影，圖片來源：Arianna Morosetti

Opentrons: 請介紹一下您的研究背景交流。

ARIANNA MOROSETTI:?我是一名分子生物學(xué)家基礎，受聘為卡爾加里大學(xué) Gilleard 實驗室的博士后研究員。我在一個大型研究小組工作還不大，我們小組的成員研究背景各不相同高產，有從事生物信息學(xué)工作的，也有剛接觸這個學(xué)術(shù)領(lǐng)域的，甚至還有從未接觸過移液器的良好。但是我們最終順利讓每個人都具備做分子生物學(xué)實驗的能力逐步顯現。

在這個職位之前，我曾在企業(yè)任職引領，所以我知道實驗室自動化方面的應(yīng)用情況自動化裝置。在卡爾加里大學(xué)任職工作中，我會使用OT-2來驗證新協(xié)議和簡化我們的標(biāo)準(zhǔn)程序勞動精神。

Opentrons: 請問您的研究項目是開展攻關合作？

AM:?我從事擴增子測序工作。我們利用分子遺傳學(xué)和基因組學(xué)方法來研究含有大量重要病原體的寄生線蟲動手能力。我們實驗室的核心項目是研究驅(qū)蟲藥的耐藥性，并研究潛在因果突變在寄生線蟲種群中的產(chǎn)生和傳播意見征詢。我們的目標(biāo)是改進診斷提升，確定新的控制目標(biāo)，并為耐藥性的可持續(xù)管理提供證據(jù)基礎(chǔ)的必然要求。

Opentrons: 請問您在實驗室的日常工作是怎樣的研究成果？

AM:?我們用于擴增測序的協(xié)議在非常具體的工作流程中有很多既定元素。我們經(jīng)歷了一個較復(fù)雜的 PCR 設(shè)置步驟：有時我們會使用 4 塊裝有 96 個樣品的孔板完善好，使用 96 種獨特的引物進行組合大面積。手動處理這樣的工作非常麻煩，也非常耗時問題分析，因此我們把這些手動工序交給 OT-2 移液機器人執(zhí)行培養。

Opentrons: 您為什么選擇OT-2？

AM:?我們實驗室已經(jīng)有一臺其他品牌的設(shè)備更加完善，我們考慮使用它形式，但用到它的次數(shù)不多，而且該公司在支持請求方面反應(yīng)不及時支撐作用。我們還需要購買一個額外的磁性模塊來執(zhí)行我們的方案日漸深入。由于我們在 PCR 前室和PCR 后室分開工作，這意味著我們將不得不購買一臺新的機器人和磁性模塊同時，這會產(chǎn)生很高的費用互動式宣講。Opentrons OT-2 和磁性模塊價格實惠，性價比高模式，能滿足我們所需要的實驗功能自動化，這是我們在比較多家產(chǎn)品后，最后選擇 OT-2 的重要原因通過活化。

Opentrons: 您具體使用OT-2進行哪些工作落地生根？它如何融入您的工作流程？

AM:?我們使用 OT-2 來分配少量的引物健康發展。我們有一個簡單的方案有效保障，是我用 Opentrons Protocol Designer 這個簡單的工具設(shè)計的〈髷祿?，F(xiàn)在它工作得很好，我們經(jīng)常使用它講實踐，但我們一開始就面臨缺少經(jīng)過驗證的濾芯吸頭的問題空間廣闊。我嘗試使用不同品牌的濾芯吸頭，但這給方案的開發(fā)造成了延誤「母飫撔?，F(xiàn)在濾芯吸頭已經(jīng)有了知識和技能，問題就解決了。

在我們的擴增子測序工作流程中新模式，我們使用磁珠來清理我們的PCR產(chǎn)物實現，這需要大量時間和手工工作。為了提升清理效率和節(jié)省人力成本組織了，我們使用了 Opentrons 磁性模塊進行自動化磁珠清理工作服務體系。我對 Python 進行一些研究之后，創(chuàng)建了我們的自動化協(xié)議搶抓機遇。我們對規(guī)避交叉污染的要求非常嚴(yán)格（因為這個環(huán)節(jié)對我們文庫制備環(huán)節(jié)的影響至關(guān)重要）分析，但 Opentrons 的支持團隊給了我們很多有用的幫助。我們提出了很多問題全面闡釋，但他們很有耐心幫我們解決問題非常激烈。下一步我們將使用 PCR 樣本驗證所有內(nèi)容。

Opentrons: 您的OT-2運行體驗如何引人註目？

AM:?我們的其中一個 P10 移液器出現(xiàn)了漏液問題領域，但 Opentrons 的客戶支持團隊很快給我更換了新的移液器，目前一切都很順利探索創新。除此之外帶來全新智能，我通過用各種顏色的食用色素對機器人做了很多測試，然后運行程序進行調(diào)整新產品。我就是這樣做的去完善，只是通過觀察并根據(jù)我們想要實現(xiàn)的目標(biāo)調(diào)整程序。

Opentrons: 在您使用 OT-2 之前長遠所需，您是否使用過其他實驗室自動化設(shè)備求索？您對實驗室自動化過程的期望是什么？

AM:?這是我第一次使用實驗室自動化設(shè)備規模。我原本預(yù)計會有一些挫折穩定發展，所以當(dāng)出現(xiàn)問題時，我深吸了一口氣聯動，然后再次嘗試增持能力。我不害怕新事物；通常當(dāng)有新設(shè)備出現(xiàn)時，我會非常樂于嘗試影響。

根據(jù)我的經(jīng)驗新的動力，設(shè)置任何移液機器人都需要時間。不管是什么機器發展契機，無論它操作軟件有多直觀廣泛關註，都需要一個人花時間學(xué)習(xí)他們實驗室機器人的所有功能，并真正了解軟件是如何工作的發力。

Opentrons: 您的 OT-2 有哪些優(yōu)缺點優勢領先？

AM:?OT-2 自動化使我們的生活變得更加輕松。對于專業(yè)研究員共創美好，使用 OT-2 有助于節(jié)省實驗時間推動並實現。

我們實驗室也有很多學(xué)生和訪客來學(xué)習(xí)我們小組使用的技術(shù)。我們將 OT-2 集成到我們的實驗室程序中覆蓋範圍，學(xué)生和訪客只需從冷凍室中取出預(yù)先分配好的孔板即可開始他們的實驗信息化。他們學(xué)習(xí)起來也很方便。

Opentrons: 當(dāng)前的模塊是否滿足您的需求實踐者？您是否考慮添加其他功能模塊？

AM:?我們已經(jīng)看過 Opentrons 的熱循環(huán)模塊約定管轄，我們認(rèn)為它將可以與我們的磁珠清理單元很好地集成到一起數據。熱循環(huán)模塊是我們計劃內(nèi)需要的，它可以提供更多功能發揮，同時可以有效利用甲板空間顯著。

我認(rèn)為對于我自己來說，為了運行常規(guī)的 DNA 提取開放以來，我可能需要加一個溫控模塊占，但限制因素是需要在機器人外執(zhí)行的離心步驟。對我們來說最重要的是處理我們工作流程中最耗時的部分提供了有力支撐，即PCR設(shè)置和清理步驟激發創作。

Opentrons: 關(guān)于機器人自動化，您的感受是怎樣的進一步意見？

AM:?為一名用戶增幅最大，我希望有更多關(guān)于使用API的教程。我對 Python 有一點經(jīng)驗生產能力，但經(jīng)驗還不夠充分標準，因為我的應(yīng)用更側(cè)重于使用對象來進行設(shè)計和編程。我認(rèn)為生物學(xué)領(lǐng)域的大多數(shù)專家都不精通Python處理方法，而且現(xiàn)有的教程沒有起到有效的幫助重要作用。我認(rèn)為網(wǎng)絡(luò)研討會或視頻會更有幫助。

我在使用 OT-2 時還有一個期望，就是能夠使用不同的實驗室器具和材料充足。如果我們使用的產(chǎn)品沒有在 OT-2上進行過測試進展情況，要讓它們工作就有點更成問題了。但我知道你們正在將 Labware Creator 整合進來方案，這將對我們有很大幫助應用的選擇。特別是我們的濾芯吸頭。

我認(rèn)為機器人非常有幫助左右。很多人認(rèn)為你必須在實驗室里受苦背景下，但我不同意。我在許多實驗室工作可靠保障，它們的資金能力各不相同自然條件，我經(jīng)常不得不手動操作。我很認(rèn)同刻苦學(xué)習(xí)研究的精神開展，但是隨著科技的進步互動互補，科研的工作效率應(yīng)該提升，自動化技術(shù)的發(fā)展也可以使我們研究過程也變得不那么乏味意向。

我認(rèn)為你不應(yīng)該花太多時間在重復(fù)的步驟上意料之外，這些步驟對你的研究沒有價值。如果你有一種方法可以做到這一點——移液——既干凈又實用形式，那么你應(yīng)該朝著使用它前進置之不顧，即使起步要投入的時間和勞動力投資可能很高。