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2019 年 12 月 20 日

在 2019 年的 iGEM 競賽中,Opentrons 如何促進(jìn)合作與創(chuàng)新

來自世界各地的生物學(xué)和工程專業(yè)的學(xué)生聚集在波士頓的 iGEM 基金會競賽上建設項目,通過 Opentrons 的贊助顯示,像全球各地展示合成生物學(xué)的力量和能力關註。

在萬圣節(jié)的盛大日子里,國際基因工程機器設(shè)計競賽( iGEM )基金會于馬薩諸塞州的波士頓舉辦了年度學(xué)生合成生物學(xué)競賽進行探討。這是一場匯聚了世界各地生物學(xué)和工程專業(yè)學(xué)生的盛會,他們齊心協(xié)力服務水平,展示了幾個月來精心打造的項目最新,以展現(xiàn)合成生物學(xué)在社區(qū)和全球范圍內(nèi)所產(chǎn)生的深遠(yuǎn)社會影響力。

Opentrons 非常敬重 iGEM 的使命和承諾處理方法,因此連續(xù)第二年為十支 iGEM 團(tuán)隊提供了 OT-2 移液機器人以及我們其他開源工具的使用權(quán)重要作用。這些來自全球各地的參賽團(tuán)隊攜手合作,共同推動合成生物學(xué)的發(fā)展習慣,從為亞熱帶氣候地區(qū)提供水凈化方案充足,到從海洋生物中發(fā)掘新的生物材料,他們的努力在不斷改變著世界安全鏈。

合作是關(guān)鍵:齊心協(xié)力取得成果

在 2019 年的 iGEM 競賽中顯示,每個項目都是團(tuán)隊合作的成果,團(tuán)隊成員們走出自己的舒適區(qū)真正做到,共同為科學(xué)進(jìn)步努力奮斗科普活動。經(jīng)過這次獨特且難忘的學(xué)習(xí)經(jīng)歷,他們也取得了非凡的成果強化意識。

加州大學(xué)戴維斯分校的團(tuán)隊展開了一項了不起的項目長期間。他們巧妙地利用 iGEM 競賽標(biāo)準(zhǔn)發(fā)放包中的熒光染料和微球體,設(shè)計出一種既適用于手動操作又適用于 OT-2 執(zhí)行的梯度稀釋方案現場。他們將這一方案分享給其他七所學(xué)校高端化,并請他們報告每種操作版本的結(jié)果。

“這種方法有效地測試了 OT-2 的精確度我有所應,”加州大學(xué)戴維斯分校的團(tuán)隊成員提單產、遺傳學(xué)和基因組學(xué)專業(yè)的學(xué)生Jodi Jacobs 表示。通過征求外部反饋至關重要,加州大學(xué)戴維斯分校能夠評估他們對 OT-2 性能的體驗與其他學(xué)校相比如何發展空間,從而為他們提供更準(zhǔn)確的評估標(biāo)準(zhǔn),同時促進(jìn) iGEM 所倡導(dǎo)的跨學(xué)科合作有所應。此外足了準備,考慮到其他團(tuán)隊提供的一致性結(jié)果,“這款機器人的表現(xiàn)相當(dāng)出色著力提升,”Jacobs 表示深刻內涵,“我們非常喜歡使用它。”她告訴我們深入闡釋,“我們實際上正在指導(dǎo)實驗室空間中的一支新團(tuán)隊使用 OT-2 進(jìn)行 ELISA 測定相關性。”這支新團(tuán)隊由缺乏移液經(jīng)驗的年輕科學(xué)家組成物聯與互聯,因此像 OT-2 這樣的移液機器人在實驗室中非常受歡迎可以使用。“他們非常興奮紮實,”Jacobs說效高化,“擁有一臺 Opentrons 機器人真的太好了⊥度肓Χ?!?/p>

成長思維:將挫折轉(zhuǎn)化為機遇

其他團(tuán)隊在實驗執(zhí)行過程中也學(xué)到了寶貴的經(jīng)驗創造,認(rèn)識到實驗過程不僅包括實驗室規(guī)程,還包括其他因素規定。例如環境,ITESO Universidad Jesuita De Guadalajara 團(tuán)隊發(fā)現(xiàn)了宣傳的重要性。他們的學(xué)術(shù)機構(gòu)以前從未參加過 iGEM 競賽高質量,因此為了參賽相對簡便,他們必須向關(guān)鍵利益相關(guān)者證明其項目的重要性,以獲得資金和指導(dǎo)老師的支持流程。如果沒有這些支持合作,他們將無法參賽。

在獲得基本的資金支持后助力各業,ITESO 團(tuán)隊繼續(xù)開展他們的項目:利用藍(lán)藻凈化咸水極致用戶體驗,以減少二氧化碳的排放,并有望減緩氣候變化應用。這是一個了不起的項目建議,雖然他們沒有取得理想的進(jìn)展,也沒有能夠?qū)?OT-2 完全集成到他們的實驗室設(shè)置中相貫通,但團(tuán)隊成員仍然與全球同行建立了牢固的聯(lián)系不斷發展,并且因此受到啟發(fā),繼續(xù)在社區(qū)中倡導(dǎo)變革自動化方案。

這種精神正是 iGEM 所倡導(dǎo)的緊密協作。

萊頓大學(xué)同樣團(tuán)結(jié)一致,攻克了團(tuán)隊遇到的挫折與挑戰(zhàn)互動講。每天早晨穩定性,團(tuán)隊成員們會聚集在一起像一棵樹,討論并分配當(dāng)天的任務(wù)過程中,以及回顧前一天遇到的問題。萊頓團(tuán)隊的課題專注于利用 suckerin 創(chuàng)造新的生物材料來治療燒傷患者,這讓他們認(rèn)識到達到,設(shè)定現(xiàn)實的期望與朝著充滿激情的愿景努力同樣重要智能設備。萊頓團(tuán)隊的科研經(jīng)理 Jo-Anne Verschoor 解釋了過度自信如何阻礙了他們的克隆工作。萊頓團(tuán)隊沒有使用 iGEM 競賽發(fā)放包中推薦的質(zhì)粒蓬勃發展,而是選擇了他們自己的質(zhì)粒特點,因為“ iGEM 的質(zhì)粒非常適合克隆,但不適合生產(chǎn)重要性∧哿α?!眻F(tuán)隊幾周來一直在努力,但都沒有成功聽得進,最后他們回到了最初的質(zhì)粒上新的力量,結(jié)果立刻奏效了。這花費了大量時間和故障排除工作便利性,讓萊頓團(tuán)隊幾乎沒有時間重新設(shè)計他們的自動化實驗全面展示。然而,他們成功地參與了加州大學(xué)戴維斯分校的協(xié)作測量項目深刻認識。

慶祝iGEM的成功


在Opentrons贊助的十支團(tuán)隊中核心技術,有七支獲得了獎牌或賽道獎,以表彰他們杰出表現(xiàn):

金牌得主:

  • 中國海洋大學(xué)
  • 萊斯布里奇大學(xué)

銀牌得主:

  • 紐約大學(xué)
  • 加州大學(xué)戴維斯分校
  • 萊頓大學(xué)

特別獎:

  • 最佳制造項目賽道獎(本科)- 萊頓大學(xué)
  • 最佳基礎(chǔ)進(jìn)步(本科)- 新加坡國立大學(xué)
  • 最佳部件收集(本科)- 新加坡國立大學(xué)
  • 最佳基礎(chǔ)進(jìn)步項目賽道獎(本科)- 代爾夫特理工大學(xué)

我們?yōu)樗麄兊某删透械津湴林鲃有?,但更讓我們自豪的是所有團(tuán)隊的項目都展現(xiàn)出了極高的雄心壯志:

  • 開羅大學(xué)團(tuán)隊致力于開發(fā)可持續(xù)的微生物和無細(xì)胞脫鹽系統(tǒng)創造性,以幫助埃及不斷增長的人口提供安全飲用水。
  • 惠靈頓維多利亞大學(xué)團(tuán)隊則致力于創(chuàng)造一種高效道路、安全且可持續(xù)的酶燃料電池保障性,通過改造大腸桿菌來過表達(dá)所需的酶并改善其功能。
  • 中國海洋大學(xué)團(tuán)隊努力創(chuàng)建模塊化的核糖開關(guān)責任製,使基因表達(dá)在工程系統(tǒng)中能夠更容易地調(diào)整和調(diào)節(jié)十分落實。
  • 萊頓大學(xué)團(tuán)隊的目標(biāo)是在大腸桿菌中表達(dá) Humboldt 魷魚的 suckerin 蛋白,并利用它們創(chuàng)造多功能規則製定、靈活且強大的新型生物材料製造業。
  • 瓜達(dá)拉哈拉尤西塔尼亞大學(xué)團(tuán)隊希望提高藍(lán)藻的光合作用活性,以增強其固碳能力并生產(chǎn)有經(jīng)濟(jì)價值的代謝中間體關規定。
  • 萊斯布里奇大學(xué)團(tuán)隊致力于開發(fā)一種可脫水和口服的重組胰島素生產(chǎn)藻種發展基礎,為當(dāng)前的胰島素生產(chǎn)和輸送方法提供可行、低成本且易于獲得的替代方案建強保護。
  • 加州大學(xué)戴維斯分校團(tuán)隊計劃通過深入研究 iGEM 競賽發(fā)放包中現(xiàn)有啟動子的特性和表征同期,以及添加新元件,擴(kuò)展哺乳動物合成生物學(xué)的可用基礎(chǔ)工具使命責任。
  • 代爾夫特理工大學(xué)團(tuán)隊專注于設(shè)計一種新型體內(nèi)正交復(fù)制和轉(zhuǎn)錄平臺效果,該平臺可以實現(xiàn)在多種細(xì)菌物種中進(jìn)行更有效的定向進(jìn)化使用。
  • 新加坡國立大學(xué)團(tuán)隊希望延長E. coli的生產(chǎn)壽命,以提高其在工程蛋白質(zhì)的生物制造中的效果密度增加。

在 Opentrons 的工作流程中體現(xiàn) iGEM 精神


Opentrons 還在 iGEM 的盛大集會上舉辦了一場實戰(zhàn)工作坊活動有效性。戰(zhàn)略計劃總監(jiān) Kristin Ellis 和高級軟件經(jīng)理 Toma Morris 帶領(lǐng)參與者了解了高靈活和可定制化的 Opentrons 的 OT-2自動化移液平臺。在講解了 OT-2 的開源編程選項并介紹了其他出色功能(如新的熱循環(huán)模塊)后構建,Ellis 為參與者提供了一個實踐開源項目的機會:使用 Protocol Designer 創(chuàng)建自定義孔板圖案創新科技。Ellis 詢問了哪些參與者有電腦,有 9 只手舉了起來共創輝煌;學(xué)生們分成小組具有重要意義,使用 Protocol Designer 學(xué)習(xí)設(shè)計自動化協(xié)議并創(chuàng)建他們可以在當(dāng)天晚些時候在Opentrons 展位上領(lǐng)取的自定義孔板圖案。

持續(xù)激發(fā)靈感

我們由衷感謝這些團(tuán)隊和 iGEM 基金會大部分,他們激勵我們繼續(xù)致力于為生物學(xué)家創(chuàng)造低成本實驗室自動化解決方案功能。通過支持合成生物學(xué)及其新興領(lǐng)導(dǎo)者使用可訪問的技術(shù),我們正在賦予下一代科學(xué)家合作解決、創(chuàng)新和推進(jìn)生物學(xué)前沿的能力預期。我們期待看到這些學(xué)生們接下來的成就!

如果您想知道自動化如何在您的實驗室中發(fā)揮作用幅度?歡迎向我們咨詢結構。

所有照片版權(quán)歸于iGEM基金會和Jacob Knight。

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