需要免疫沉淀的工作流程
- 蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用研究: 鑒定和驗證與相關(guān)蛋白質(zhì)相互作用的蛋白質(zhì)發展的關鍵。
- 翻譯后修飾分析: 富集具有特定修飾(如磷酸化或泛素化)的蛋白質(zhì)道路。
- 功能測定: 在受控環(huán)境中研究蛋白質(zhì)或蛋白質(zhì)復(fù)合物的活性。
免疫沉淀的最佳方法
免疫沉淀(Classic Immunoprecipitation, Classic IP)
從復(fù)雜混合物中分離出特定蛋白質(zhì)真諦所在,用于研究其特性指導、翻譯后修飾或進一步分析。
步驟:
- 使用裂解緩沖液裂解細胞以釋放蛋白質(zhì)充分。
- 將針對目標蛋白質(zhì)定制的特異性抗體附著在珠子(瓊脂糖或磁性)上進一步完善。
- 細胞裂解液與抗體-磁珠復(fù)合物孵育,使目標蛋白質(zhì)結(jié)合。
- 使用洗滌緩沖液洗去非特異性結(jié)合的蛋白質(zhì)調整推進。
- 然后使用洗脫緩沖液將目標蛋白質(zhì)從珠子上洗脫下來狀況。
- 使用離心機或磁力架從裂解液中分離出與抗體珠結(jié)合的蛋白質(zhì)。
免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation, Co-IP)
從復(fù)雜的生物樣本中分離出主要蛋白質(zhì)及其潛在的相互作用伙伴機製,從而研究蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)之間的相互作用全過程。
操作步驟:
- 細胞裂解以釋放蛋白質(zhì)。
- 將針對原生蛋白定制的特異性抗體附著在珠子上堅持先行。
- 細胞裂解液與抗體-珠子復(fù)合物一起孵育產業。
- 在此步驟中,與原生蛋白相互作用的蛋白質(zhì)會發(fā)生共沉淀情況較常見。
- 非特異性結(jié)合的蛋白質(zhì)會被洗去可持續。
- 原生蛋白及其相互作用蛋白被洗脫。
- 使用離心機或磁力架分離與抗體珠結(jié)合的蛋白質(zhì)體製。
串聯(lián)親和純化 (Tandem Affinity Purification, TAP)
實現(xiàn)蛋白質(zhì)復(fù)合物的高純度純化構建,尤其適用于研究低豐度或瞬時蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用。
步驟:
- 對感興趣的蛋白質(zhì)進行基因改造服務延伸,使其包含雙標記系統(tǒng)共創輝煌。
- 對表達這種修飾蛋白的細胞進行裂解。
- 首先將裂解液與與第一個標簽結(jié)合的珠子孵育進一步,分離出蛋白質(zhì)大部分。
- 使用特定的蛋白酶將第一個標簽裂解掉。
- 使用與第二個標簽結(jié)合的珠子進行第二輪純化實際需求。
- 經(jīng)過這一步驟后解決方案,蛋白質(zhì)復(fù)合物被洗脫出來,純度很高善謀新篇。
- 使用離心機分離與珠子結(jié)合的蛋白質(zhì)增產。
為什么免疫沉淀很困難:
- 特異性問題: 蛋白質(zhì)與珠子或抗體的非特異性結(jié)合會導(dǎo)致假陽性。
- 靈敏度問題: 低豐度蛋白質(zhì)可能無法被有效吸附方法,從而導(dǎo)致假陰性行動力。
- 維持蛋白質(zhì)相互作用: 有些蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)之間的相互作用是瞬時或微弱的,因此在 IP 過程中捕獲并維持這種作用具有挑戰(zhàn)性切實把製度。