與第一代方法相比，新一代測(cè)序 (NGS) 具有更快的速度製度保障、更低的成本和更高的通量深刻認識，已將生物學(xué)研究推入了一個(gè)新時(shí)代工具。 全基因組測(cè)序、表觀基因組學(xué)自動化裝置、宏基因組學(xué)和微生物組學(xué)只是當(dāng)今眾多 NGS 應(yīng)用中的一小部分，它們促進(jìn)了流行病學(xué)、癌癥診斷和藥物領(lǐng)域的進(jìn)步長遠所需。

與第一代方法相比，下一代測(cè)序 (NGS) 具有更快的速度讓人糾結、更低的成本和更高的通量規模，已將生物學(xué)研究推入了一個(gè)新時(shí)代。 全基因組測(cè)序基石之一、表觀基因組學(xué)聯動、宏基因組學(xué)和微生物組學(xué)只是當(dāng)今眾多 NGS 應(yīng)用中的一小部分，它們促進(jìn)了流行病學(xué)共同努力、癌癥診斷和藥物發(fā)現(xiàn)的進(jìn)步行業內卷，并極大地提高了我們對(duì)生物體如何利用遺傳信息在環(huán)境中生存和繁殖的理解。 不斷變化的環(huán)境逐漸完善。

市場(chǎng)上有各種各樣的測(cè)序儀器和服務(wù)提供商參與能力，NGS 正迅速被各種規(guī)模和不同預(yù)算的實(shí)驗(yàn)室所接受。 雖然測(cè)序和數(shù)據(jù)分析通常是自動(dòng)化的是目前主流，但上游 NGS 步驟充分發揮，即樣品處理和文庫(kù)制備通常是手動(dòng)進(jìn)行的高質量。 幸運(yùn)的是，通過(guò)一些努力和優(yōu)化競爭激烈，這些步驟可以在移液機(jī)器人上輕松實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化持續創新，從而為用戶節(jié)省了許多潛在的麻煩。 在這里空白區，我們來(lái)看看自動(dòng)化 NGS 工作流程的 5 大理由協調機製。

1. 可擴(kuò)展性

如果您曾經(jīng)嘗試過(guò)手動(dòng)處理大量 NGS 結(jié)合樣本，那么擴(kuò)大規(guī)模的潛力應(yīng)該會(huì)讓您對(duì)自動(dòng)化感到興奮形勢。 機(jī)器人的具體功能取決于型號(hào)實踐者，但在大多數(shù)情況下，您將能夠同時(shí)處理多達(dá) 96 個(gè)樣本約定管轄，從而顯著減少手動(dòng)處理相同數(shù)量的樣本所需的時(shí)間數據。

自動(dòng)化還為您省去了批量處理樣品的可怕麻煩，由于離心機(jī)尺寸發揮、樣品降解風(fēng)險(xiǎn)（例如顯著，使用 RNA 時(shí)）以及最大數(shù)量的限制，這在手動(dòng)設(shè)置中通常是必要的開放以來。 人們?cè)谌魏螘r(shí)候都感覺可以輕松處理的樣本占。 比避免麻煩更重要的是，更少的批次意味著更少或沒(méi)有批次間的差異提供了有力支撐。

2激發創作、創(chuàng)新

通過(guò)自動(dòng)化擴(kuò)大 NGS 實(shí)驗(yàn)規(guī)模將不可避免地讓您能夠解決手動(dòng)設(shè)置幾乎無(wú)法解決的新研究問(wèn)題。 以下是一系列 NGS 應(yīng)用的幾個(gè)示例：

藥物發(fā)現(xiàn)：篩選大量新型化合物進一步意見，以尋找疾病材料（例如細(xì)胞系）中所需的轉(zhuǎn)錄或表觀遺傳變化增幅最大，而不是試圖挑選可能具有治療相關(guān)作用的化合物。

微生物組學(xué)：分析足夠大的樣本集生產能力，以獲得您選擇的物種中“正硺藴?！蔽⑸飬^(qū)系的圖片。 如果您一次只能處理 12 或 24 個(gè)樣本堅持好，這將是一項(xiàng)不可能完成的任務(wù)大面積。

植物育種：大規(guī)模鑒定農(nóng)藝重要基因和遺傳標(biāo)記，以幫助基因組選擇和基因工程開發(fā)具有高度理想性狀的新品種問題分析。

疾病研究和診斷：篩選大量臨床樣本以發(fā)現(xiàn)新的疾病相關(guān)基因或生物標(biāo)志物培養。

環(huán)境監(jiān)測(cè)：通過(guò)對(duì)其無(wú)脊椎動(dòng)物居民進(jìn)行定性和定量序列分析來(lái)評(píng)估生態(tài)系統(tǒng)的健康狀況。

除了增加您自己的研究創(chuàng)新之外更加完善，更高的通量還應(yīng)該促進(jìn)與其他實(shí)驗(yàn)室加強(qiáng)合作形式，為新項(xiàng)目和發(fā)現(xiàn)打開大門，否則這些項(xiàng)目和發(fā)現(xiàn)將非常具有挑戰(zhàn)性（如果可能的話）。

3. 一致的數(shù)據(jù)質(zhì)量

在整個(gè)NGS工作流程中左右，樣本處理背景下、文庫(kù)構(gòu)建以及PCR擴(kuò)增和文庫(kù)標(biāo)準(zhǔn)化等下游處理步驟特別容易出現(xiàn)人為錯(cuò)誤。 該協(xié)議很冗長(zhǎng)可靠保障，有許多移液步驟和不斷變化的試劑體積自然條件，并且通常需要沿途將樣品轉(zhuǎn)移到新管中。 不正確的標(biāo)簽開展、污染互動互補、移液錯(cuò)誤或與方案的最輕微偏差都會(huì)嚴(yán)重影響結(jié)果數(shù)據(jù)。

即使人為錯(cuò)誤完全不可避免意料之外，批次之間的差異以及工作人員之間樣品處理的差異也是不可避免的。 如果可能的話方便，監(jiān)控 NGS 工作流程中的這些錯(cuò)誤和變化也是不切實(shí)際的應用領域。 自動(dòng)化樣品和文庫(kù)制備緩解了這一問(wèn)題不容忽視，提供更好的過(guò)程控制說服力、準(zhǔn)確高效的工作流程以及獨(dú)立于人員變動(dòng)的更好的運(yùn)行重復(fù)性全面闡釋，從而無(wú)論您有 1 個(gè)還是 1,000 個(gè)樣品引人註目，都可以提供可靠性和一致的數(shù)據(jù)質(zhì)量。

4. 增加離開時(shí)間

這并不完全是黑白分明的雙向互動，因?yàn)槟枰趩?dòng)階段投入一些時(shí)間和精力品牌，以確保您的移液機(jī)器人能夠執(zhí)行嚴(yán)格的協(xié)議等形式。如果幸運(yùn)的話提供深度撮合服務，您也許能夠找到一個(gè) 從其供應(yīng)商或您選擇的核酸提取和文庫(kù)制備試劑盒的供應(yīng)商處獲取適合您機(jī)器人的腳本組成部分，其中許多供應(yīng)商與自動(dòng)化供應(yīng)商合作開發(fā)自動(dòng)化就緒協(xié)議的過程中。

無(wú)論如何促進進步，一旦您的自動(dòng)化設(shè)置啟動(dòng)并運(yùn)行共創美好，您就可以享受將寶貴的實(shí)驗(yàn)室時(shí)間花在規(guī)劃新的關(guān)鍵實(shí)驗(yàn)上覆蓋範圍，而不是重復(fù)的樣品和文庫(kù)準(zhǔn)備奮勇向前。 自動(dòng)化還可以減少對(duì)員工進(jìn)行多種不同方案培訓(xùn)所需的工作量規劃，從而釋放更多資源帶動擴大，并避免員工因過(guò)度移液而造成的重復(fù)性勞損性能。

5. 降低成本

根據(jù)您當(dāng)前的資源的方法，在設(shè)置和優(yōu)化階段可能會(huì)產(chǎn)生相當(dāng)大的支出落到實處，例如技術創新，如果您的實(shí)驗(yàn)室還沒(méi)有移液機(jī)器人持續向好，您將需要獲得移液機(jī)器人。 您還需要花時(shí)間對(duì)機(jī)器人進(jìn)行編程以執(zhí)行各種協(xié)議至關重要。 然而提升行動，一旦您的自動(dòng)化設(shè)置啟動(dòng)并運(yùn)行，節(jié)省的員工培訓(xùn)和樣品處理時(shí)間以及避免因人為錯(cuò)誤導(dǎo)致的材料和試劑損失可能會(huì)轉(zhuǎn)化為顯著的成本節(jié)省快速融入，特別是當(dāng) NGS 是常規(guī)且關(guān)鍵的部分時(shí) 你的研究至關重要。

你能自動(dòng)化完成工作嗎發展空間？

別擔(dān)心，即使是最好的自動(dòng)化設(shè)置也不能完全消除人工干預(yù)的需要深刻內涵。 您仍然需要納入質(zhì)量控制檢查