冠狀病毒大流行為生命科學(xué)研究人員提供了前所未有的機(jī)會(huì)置之不顧。以下 9 種資源可幫助您最大限度地利用這些機(jī)會(huì)取得明顯成效。
冠狀病毒大流行改變了生命科學(xué)的格局，消耗了近期的大部分研究機(jī)會(huì)製造業。但它也為研究人員提供了前所未有的合作適應能力、創(chuàng)新和創(chuàng)造新知識(shí)的機(jī)會(huì)。

前所未有的機(jī)會(huì)帶來了前所未有的資源——其中許多資源都是免費(fèi)使用的重要的作用。從 Slack 頻道到 SOP更多可能性，這里有 9 種工具可以幫助任何希望建立測試實(shí)驗(yàn)室去創新、優(yōu)化工作流程或以其他方式參與這個(gè)全球科學(xué)項(xiàng)目的研究人員。

全球 Slack 頻道

來自全球各地的 13,000 多名研究人員參加了此次討論緊迫性，這是全球關(guān)于擴(kuò)大 COVID-19 測試規(guī)模的最大討論結構。它充滿了協(xié)作討論，涉及從排除 RNA 提取工作流程故障和確定供應(yīng)商到克服樣品和供應(yīng)鏈物流以及向 FDA 申請緊急使用授權(quán)等所有方面高效。您也可以加入對話溝通協調；只需單擊上面的鏈接并發(fā)送電子郵件至 [email protected] 即可獲得 24 小時(shí)邀請。

彈出式檢測實(shí)驗(yàn)室藍(lán)圖

創(chuàng)新基因組學(xué)研究所 (IGI) 提供了有關(guān)如何建立 CLIA 認(rèn)證的 SARS-CoV-2 檢測實(shí)驗(yàn)室的詳盡指南體系。IGI 是加州大學(xué)伯克利分校和加州大學(xué)舊金山分校的研究人員團(tuán)隊(duì)高效節能，他們組建了一支多元化、跨學(xué)科的團(tuán)隊(duì)深刻認識，晝夜不停地工作了 3 周核心技術，以擴(kuò)大灣區(qū)的冠狀病毒檢測規(guī)模。他們的指南包括從特定自動(dòng)化工作流程和協(xié)議到人員培訓(xùn)和合規(guī)指南等各方面的提示主動性。

學(xué)術(shù)合作診斷實(shí)驗(yàn)室的標(biāo)準(zhǔn)操作程序 (SOP)

克里克 COVID19 聯(lián)盟提供了有關(guān)他們?nèi)绾卧趯W(xué)術(shù)環(huán)境中與外部合作伙伴一起創(chuàng)建診斷實(shí)驗(yàn)室的分步指南創造性。克里克 COVID19 聯(lián)盟與倫敦大學(xué)學(xué)院醫(yī)院道路、衛(wèi)生服務(wù)實(shí)驗(yàn)室 (HSL)規模設備、癌癥研究所和弗朗西斯克里克研究所合作，在短短兩周多的時(shí)間內(nèi)創(chuàng)建了這一測試設(shè)置指導。他們的可下載指南涵蓋了從實(shí)驗(yàn)室安全信息和 2 類樣品滅活指南到 RNA 提取方案和制作自制緩沖液的所有內(nèi)容競爭力。

臨床研究測序測試平臺(tái)

Broad Institute 開放了有關(guān)其針對 SARS-CoV-2 的臨床研究測序平臺(tái) (CRSP) 的訪問權(quán)限。Broad Institute 是麻省理工學(xué)院 (MIT) 和哈佛大學(xué)研究人員之間的合作進一步完善，它使用他們的平臺(tái)運(yùn)行實(shí)時(shí)逆轉(zhuǎn)錄酶 (RT)-PCR 診斷檢測集聚。對于任何尋找測試設(shè)施的研究人員，Broad Institute 都開放了他們的設(shè)施調整推進。他們的說明包括標(biāo)本收集和運(yùn)輸指南狀況，以及針對患者和提供者的診斷測試和檢測情況說明書的常見問題解答。

基因組工程工具

Synthego 為基因組學(xué)研究人員提供了一系列工具機製，以提高開發(fā) COVID-19 診斷和治療的速度和有效性全過程。這些工具包括用于 RNA 收集的定制 Cas13 指南和針對與 SARS-CoV-2 蛋白相互作用的 330 個(gè)人類基因的多陣列 CRISPR sgRNA 基因敲除文庫。他們的網(wǎng)站上有所有這些工具的鏈接探討，以及他們用于創(chuàng)建這些工具的已發(fā)布測試數(shù)據(jù)不負眾望。

SwabSeq 測試概念驗(yàn)證

Octant 的 SwabSeq NGS 診斷工作流程概念驗(yàn)證。 Octant 是一家生物技術(shù)公司調解製度，使用專有技術(shù)結(jié)合合成生物學(xué)精準調控、基因組工程、下一代測序和計(jì)算工具，創(chuàng)建了一種協(xié)議來擴(kuò)大基于 COVID19 序列的測試機遇與挑戰，該協(xié)議簡??單廣泛關註、便宜且靈敏。 它被稱為 SwabSeq集成技術，他們的實(shí)驗(yàn)室筆記文檔包括從協(xié)議和測試代碼到數(shù)據(jù)圖表和內(nèi)部筆記本的所有內(nèi)容就能壓製。

大規(guī)模并行診斷測定概念驗(yàn)證

賓夕法尼亞州立大學(xué)合成生物學(xué)研究員 Howard Salis 的大規(guī)模并行 NGS 診斷測定概念驗(yàn)證。 Salis 發(fā)表了一份預(yù)印本大部分，詳細(xì)介紹了大規(guī)模并行診斷測定 (MPDA) 如何利用下一代測序在一次測定中同時(shí)進(jìn)行數(shù)千次病毒 RNA 測量強大的功能，并在每個(gè)工作流程中處理多達(dá) 19,200 個(gè)患者樣本。他的預(yù)印本詳細(xì)介紹了他的工作流程解決方案，結(jié)合了病毒 RNA 提取優勢、使用具有獨(dú)特條形碼的患者特異性引物的逆轉(zhuǎn)錄酶 (RT) 以及單池聚合酶鏈反應(yīng) (PCR)，然后進(jìn)行下一代測序 (NGS)增產。

移動(dòng)測試實(shí)驗(yàn)室

OpenCell 的大量藍(lán)圖便利性、協(xié)議和其他資源。OpenCell 是一家為生物技術(shù)初創(chuàng)公司提供移動(dòng)行動力、經(jīng)濟(jì)實(shí)惠的集裝箱實(shí)驗(yàn)室空間的公司提供有力支撐，在英國測試領(lǐng)域處于領(lǐng)先地位，正在迅速擴(kuò)展高通量測試