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Opentrons Flex 自動(dòng)化移液工作站24 小時(shí)全程自動(dòng)化輕松制備高達(dá) 384 個(gè)質(zhì)粒文庫

簡(jiǎn)介
高通量基因組分析是生命科學(xué)研究中不可或缺的重要工具,這項(xiàng)技術(shù)在推動(dòng)科研進(jìn)步方面發(fā)揮著
至關(guān)重要的作用。為了滿足了科研領(lǐng)域?qū)Ω咝Т蠓卣?、?zhǔn)確制備方法的迫切需求研學體驗,seqWell 的 Express Plex?
Library Kit 提供了一種專門用于高通量制備質(zhì)粒和擴(kuò)增子文庫的解決方案。
在傳統(tǒng)的手工制備文庫方法中重要平臺,完成 96 個(gè)樣品的制備需要耗費(fèi)長(zhǎng)達(dá) 90 分鐘的時(shí)間,其中手動(dòng)操
作時(shí)間占據(jù)了 30 分鐘。這種方式不僅效率低下深刻變革,還容易因?yàn)槿藶橐蛩匾胝`差。
為了改進(jìn)這一狀況和諧共生,本文對(duì)比了兩種文庫制備方法質生產力,一種是在 Opentrons Flex? 移液工作站上使用
seqWell ExpressPlex? Library Kit ,另一種是手工制備文庫技術交流。
通過結(jié)合 Flex 移液工作站與 seqWell ExpressPlex? Library Kit先進的解決方案,我們可以顯著縮短文庫制備時(shí)
間拓展,提高樣本通量。這種自動(dòng)化的解決方案不僅提升了制備效率宣講活動,還降低了人為誤差的風(fēng)險(xiǎn)不斷進步,為生命科學(xué)
研究提供了更為可靠、高效的工具效率。
材料與方法
ExpressPlex 工作流程:
根據(jù) Express Plex 的工作流程規模,我們?cè)?Flex 自動(dòng)化移液工作站上進(jìn)行文庫制備。實(shí)驗(yàn)過程中講故事,我們輸入
16 ng 的 pUC19 非常完善,再將所有組分加入反應(yīng)板 , 用 3000 rpm 的轉(zhuǎn)速混勻 90 秒全面革新,然后進(jìn)行后續(xù)的文庫制
備和混合步驟作用。最終的文庫在 NextSeq 2000 測(cè)序儀上進(jìn)行 2X150 bp 測(cè)序。

ExpressPlex 工作流程

圖 1.
A ) Express Plex 工作流程包括將 index 和 DNA 加入 反應(yīng)板(已含有酶等混合物)行業分類,然后進(jìn)行擴(kuò)增技術特點、混合
和 MAGwise 磁珠純化;
B ) Flex 工作站包括吸頭盒發展邏輯、模塊凝聚力量、轉(zhuǎn)板抓手和其他配件;
C ) Flex 工作站板位設(shè)置聽得進,用于在擴(kuò)增后將 4 個(gè)反應(yīng)板進(jìn)行文庫混合新的力量。

結(jié)果

Opentrons Flex顯示結(jié)果

圖 2 . A ) 結(jié)果顯示 96 孔板中文庫數(shù)據(jù)變異系數(shù)( CV )為 12.7%; B ) 95% 的文庫數(shù)據(jù)通過了數(shù)據(jù)預(yù)處
理便利性,為高質(zhì)量數(shù)據(jù)全面展示,且超過 90% 文庫質(zhì)量得分達(dá)到 Q30; C ) 由 Flex 制備的文庫比手動(dòng)制備的文庫濃度
更高新技術。

獨(dú)立的 96 混 1 文庫

圖 3 . 利用錯(cuò)開的開始時(shí)間共同學習,可以在 Opentrons FlexTM 上 3 小時(shí)內(nèi)制備 8 個(gè)獨(dú)立的 96 混 1 文
庫。在 Flex 上設(shè)置第一塊反應(yīng)板后深入,可以在 24 小時(shí)內(nèi)完成 768 個(gè)文庫的制備效高。

結(jié)論
在 Flex 移液平臺(tái)上制備的 96 個(gè) pUC19 質(zhì)粒樣本文庫呈現(xiàn)出了高度均一的質(zhì)量,充分證明了 Flex
平臺(tái)在自動(dòng)化文庫制備方面的卓越性能基礎。
與手動(dòng)制備相比性能,自動(dòng)化文庫制備不僅穩(wěn)定性更佳,而且文庫濃度更高對外開放。此外技術創新,超過95%的讀數(shù)成
功通過測(cè)序儀質(zhì)檢 PF,這進(jìn)一步驗(yàn)證了自動(dòng)化制備流程的高效性和準(zhǔn)確性有序推進。
Flex 移液工作站支持在單次運(yùn)行中處理多達(dá) 384 個(gè)樣本設施,極大地提高了樣本處理效率。通過合理
安排時(shí)間堅定不移,我們甚至可以在 24 小時(shí)內(nèi)處理高達(dá) 768 個(gè)樣本組合運用,從而滿足大規(guī)模高通量基因組分析的需求。
在 Flex 平臺(tái)上自動(dòng)化 ExpressPlex? Library Prep Kit 工作流程迎難而上,我們實(shí)現(xiàn)了從提取的質(zhì)粒/擴(kuò)增
子 DNA 到數(shù)據(jù)生成的全流程自動(dòng)化積極。這一解決方案不僅簡(jiǎn)化了操作步驟,降低了人為誤差堅持先行,而且顯著提
高了實(shí)驗(yàn)效率和數(shù)據(jù)質(zhì)量產業,為生命科學(xué)研究領(lǐng)域的發(fā)展注入了新的動(dòng)力。

聯(lián)系我們

經(jīng)驗(yàn)豐富的服務(wù)團(tuán)隊(duì)和強(qiáng)大的生產(chǎn)支持團(tuán)隊(duì)為客戶提供無憂的訂單服務(wù)情況較常見。

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