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如何使用自動化臺式熱循環(huán)儀節(jié)省實驗室時間

PCR 技術(shù)的省時演進

在液體處理器的平臺上使用和不平臺上使用自動熱循環(huán)儀的區(qū)別在于回收的時間。如果實驗室里有六個額外的小時平臺建設,你會做什么貢獻力量?

與生命本身一樣,現(xiàn)代生物技術(shù)基于精確復制 DNA 的能力發行速度。生物學家劫持了細胞中內(nèi)置的核酸復制機制性能,創(chuàng)建了聚合酶鏈式反應 (PCR)——這是現(xiàn)代分子生物學的基石方法,允許它們自己復制 DNA供給。
1983 年,諾貝爾獎獲得者凱里·穆利斯 (Kary Mullis) 表明落到實處,您可以通過精確的溫度序列來協(xié)調(diào)樣本最新,從而操縱目標 DNA 序列的復制。當時兩個角度入手,進行 PCR 實驗意味著科學家需要花費數(shù)小時手動將試管移入和移出不同溫度的水浴,以實現(xiàn)這些溫度循環(huán)基本情況。
1988 年效果,Celtis 和 Perkin-Elmer 推出了一種名為熱循環(huán)儀的設(shè)備相關性,用于自動執(zhí)行 PCR 實驗所需的精確溫度變化物聯與互聯。
它比水浴法更快、更高效,但成本超過 100,000 美元——遠遠超出了大多數(shù)生物學家的承受能力。直到 90 年代中期醒悟,ML Laboratories 等公司開始制造價格更實惠的帶加熱蓋的機器,大多數(shù)實驗室才開始使用熱循環(huán)儀製造業。

自動化臺式熱循環(huán)儀

PCR 技術(shù)的省時演進

如今利用好,PCR 的省時創(chuàng)新似乎停滯不前。盡管已經(jīng)創(chuàng)建了新型 PCR(如定量和數(shù)字 PCR)結構重塑,但自 20 世紀 90 年代中期以來橫向協同,在省時方面并沒有取得重大進展不斷創新。大多數(shù)生物學家仍在使用與 20 年前發(fā)明的熱循環(huán)儀技術(shù)上類似的熱循環(huán)儀提供了遵循,并且每周仍要花費數(shù)小時手動準備反應。Opentrons 熱循環(huán)儀代表了 PCR 用戶在省時方面的下一個重大飛躍明確相關要求。

為什么節(jié)省時間如此重要

機器人讓您可以并行工作體製,以更快完成更多工作——尤其是配備熱循環(huán)儀的機器人自動化裝置,它們可以處理更長的工作流程互動式宣講。

第一種節(jié)省時間的方式是基本的一對一任務完成的好處有效保障。如果一個人可以在一小時內(nèi)準備 100 個樣本長效機製,并在一小時內(nèi)回復 10 封電子郵件數字技術,那么他們需要 2 小時來完成這兩項任務。但如果他們讓機器人進行樣品準備大大縮短,他們可以在 1 小時內(nèi)完成這兩項任務——這是一種相當簡單的提高生產(chǎn)率的方法。

但是先進技術,當您考慮更長的時間段時不合理波動,節(jié)省的時間會成倍增加宣講手段。假設(shè)您有 600 個樣本需要準備,以每小時 100 個樣本的相同速度進行機器人運行積極拓展新的領域。還有一個六小時的會議配套設備,您有機會出席。

您可以自動準備樣品并參加會議嗎相對開放?

理論上推進高水平,當然可以:6 小時 x 100 個樣本/小時 = 600 個樣本。但是誰來裝載和卸載機器人溝通機製?誰來在運行之間設(shè)置自動化好宣講?你可以自動化所有 6 小時的樣品準備,但你只能在六個一小時的時間段內(nèi)完成領先水平。所以新產品,即使你可以為自己節(jié)省六個小時的生產(chǎn)力,你也不能去參加會議橋梁作用。你需要的(在這個例子中)是一個可以在一次運行中完成所有 600 個樣本的機器人長遠所需。這樣,你就可以點擊“開始”讓人糾結,在六個小時后在會議上展示后回來規模,完成你所有的實驗室工作。一個六小時的時間段和六個一小時的時間段之間的差異可能是有意義的工作和忙碌的工作之間的差異基石之一。此外聯動,有些工作只需要長時間不間斷的時間來完成共同努力。在《制造者的時間表逐漸完善,經(jīng)理的時間表》一文中充分發揮,保羅·格雷厄姆指出充分發揮,一些創(chuàng)造性的任務業務指導,如寫一篇文章或編寫一個算法,最好以這種方式完成:一個小時是不夠的發揮,不足以集中精力并取得有意義的進展。只有兩個小時的時間來完成這些復雜的任務激發創作,你幾乎沒有足夠的時間進入狀態(tài)——更糟糕的是,一旦你進入心流狀態(tài)進一步意見,你就不得不放棄增幅最大。

臺式熱循環(huán)儀如何為您節(jié)省大量時間

如果您的實驗室已經(jīng)實現(xiàn)了從基因分型和測序到克隆和基因編輯等工作流程的自動化,那么在液體處理機器人上添加一臺臺式熱循環(huán)儀可以將您的空閑時間增加 3 倍傳承。充分利用集成熱循環(huán)儀的協(xié)議非常復雜形式,涉及孵育或 PCR 步驟之前和之后的多個子協(xié)議。讓我們以下一代測序 (NGS) 文庫制備協(xié)議為例競爭力所在。通過僅自動化工作流程中的移液和磁珠處理步驟事關全面,您可以減輕大約 2/3 的工作量共創美好。
這就是酶促制備(碎片化 + a-tailing 等)明顯、清理認為、索引和池化步驟趨勢,這些步驟可以由帶有磁性模塊的 OT-2 機器人完成飛躍。
如果機器人的甲板上沒有熱循環(huán)儀更高效,那么一個人(或另一個更昂貴的機器人)必須親自將準備好的反應物移入熱循環(huán)儀。擴增完成后發揮重要作用,他們還需要親自取回樣品——將它們從熱循環(huán)儀上取下新格局,然后放回機器人上不負眾望,進行最后的磁性和移液步驟成效與經驗。

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