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AI+自動(dòng)化賦能蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜前處理

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使用Opentrons OT-2搭配熱振蕩儀進(jìn)行三種ELISA自動(dòng)化流程

作者
Boren Lin,PhD,Kinnari Watson,PhD

應(yīng)用概述
酶免疫分析 (EIA) 或酶聯(lián)免疫吸附測定 (ELISA) 是液體樣本中檢測目標(biāo)分子(例如抗原)的常用分析工具溝通協調,通常用于免疫診斷 或研究推動。該測定一般采用96 孔板格式取得明顯成效,并且工作流程通常包括 試劑轉(zhuǎn)移和混合服務體系,以及一些在恒定溫度下的孵育和洗滌步驟發展需要。這 些步驟均要求樣本處理高度一致性互動式宣講。為了實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化資源配置,我們使用 OT-2 自動(dòng)化移液工作站搭配熱振蕩儀研發(fā)并測試了 ELISA 全自 動(dòng)化的方案信息化技術,該方案使用 Takara Bio 公司的夾心法 EIA 試劑盒 檢測人類纖連蛋白(FN),Tecan 的競爭法 ELISA 試劑盒檢測 唾液中的皮質(zhì)醇,以及 Cell Sciences 的另一種競爭法 ELISA 試劑盒用于定量血清樣本中的中和SARS-CoV-2 抗體要落實好。

關(guān)鍵發(fā)現(xiàn)
配備8通道移液器和熱振蕩儀的 OT-2 移液工作站具備高精度自動(dòng)化完成 ELISA的能力緊密相關。
在更高的吞吐量設(shè)置中,該協(xié)議可以用最少的操作時(shí)間處理多達(dá)96個(gè)樣本先進技術。

應(yīng)用介紹
酶免疫分析 (EIAs) 或酶聯(lián)免疫吸附測定 (ELISAs) 是一種通過 高度特異的抗體-抗原的相互作用對液體樣本的目標(biāo)分子(例如 抗原)進(jìn)行檢測和定量的技術(shù)培訓。這種測定通常在96孔或384孔 板上進(jìn)行,我們把抗原固定在孔板上,可以通過直接將抗原連接 到固體表面或使用預(yù)涂在固體表面的捕獲抗體來實(shí)現(xiàn)效高。通過這個(gè)過程,它能夠?qū)⒖乖c樣本中其他非靶向分子分離開來基礎。

夾心法 ELISA是該測定方法中最常用的形式系統穩定性。常規(guī)步驟如下:
1、如果供應(yīng)商未提供預(yù)涂該抗體的孔板集中展示,我們則需要將捕獲抗體(即與目標(biāo)物特異結(jié)合的抗體)通過被動(dòng)吸附的方式固定在孔板 上(例如實力增強,8孔或12孔條紋組裝在與96孔微孔板讀取器兼容的框架上)。
2探索創新、將待分析的樣品加入到涂有抗體的板上帶來全新智能,使目標(biāo)抗原被捕獲。
3新產品、將固定的目標(biāo)抗原暴露給與酶(例如辣根過氧化物酶或HRP)偶聯(lián)的檢測抗體去完善。
4、加入酶的底物長遠所需,以產(chǎn)生可以測量和定量的信號求索。

人源纖維連接蛋白(FN)EIA試劑盒 (Takara Bio,美國加利福尼 亞州圣何塞)是一種體外定量測定血清、尿液規模、細(xì)胞培養(yǎng)上清液 和其他生物液中可溶性人源 FN 的試劑盒穩定發展。該試劑盒提供了足夠的試劑和材料,可用于在 OT-2 平臺上進(jìn)行 EIA協(xié)議的設(shè)計(jì)和驗(yàn)證聯動。

FN 廣泛分布在細(xì)胞表面增持能力、細(xì)胞外基質(zhì)和血漿中,參與細(xì)胞基質(zhì)粘 附行業內卷、細(xì)胞遷移追求卓越、細(xì)胞形態(tài)的調(diào)控以及其他細(xì)胞功能。Takara 公司 的 FN EIA試劑盒采用兩種抗人源 FN 的鼠單克隆抗體參與能力,形成抗體- 抗原-抗體夾心復(fù)合物:捕獲抗體預(yù)涂在含8連管覆蓋,檢測抗體與過 氧化物酶結(jié)合。通過將此復(fù)合物暴露于過氧化物酶的底物中研究,可 以產(chǎn)生光度信號高效,其吸光度與樣品中目標(biāo)物(即人源 FN) 的數(shù)量成正比。

競爭法 ELISA(Enzyme-linked Immunosorbent Assay) 通 過 檢測信號干擾來測量抗原的濃度提高。簡而言之機構,目標(biāo)抗原與預(yù)涂在 孔板上的參照物(抗原)競爭與酶偶聯(lián)抗體結(jié)合。樣品中目標(biāo)抗 原的濃度越高交流,參考抗原與抗體結(jié)合的能力就越弱基礎,產(chǎn)生的信號 就越弱。 一些競爭法 ELISA 試劑盒,如次本研究中測試的 Tecan 公司的 Cortisol Saliva ELISA, 酶不是由抗體攜帶實踐者,而是由參照 物攜帶取得明顯成效,參照物與目標(biāo)抗原競爭與抗原-抗體作用。我們在 OT-2 上進(jìn)行測試另一個(gè)的 ELISA 試劑是 Cell Sciences 公司(美國馬 薩諸塞州紐伯里港)的 SARS-CoV-2 替代病毒中和檢測試劑盒數據, 用于測量 SARS-CoV-2 感染后或?qū)σ呙缃臃N產(chǎn)生的循環(huán)中和抗體創新的技術。中和抗體通過阻斷盤狀病毒融合蛋白的受體結(jié)合域 (recep-tor-binding domain,RBD) 與血管緊張素轉(zhuǎn)換酶2 (angioten-sin converting enzyme 2,ACE2) 結(jié)合,抑制 SARS-CoV-2 進(jìn) 入細(xì)胞顯著。該試劑盒提供預(yù)涂的病毒棘蛋白RBD板快速增長,以競爭法ELISA 的形式,引入HRP- 偶聯(lián)的ACE2 與中和抗體競爭捕獲RBD占。

雖然 ELISA 的設(shè)計(jì)方法有很多高質量,但萬變不離其宗,他們都遵循相似的工作流程激發創作。ELISA 的常規(guī)操作步驟包括試劑移液前景、孵育以及反復(fù)洗滌,這些步驟可以在 OT-2 上輕松完成增幅最大。在每個(gè)試劑步驟之間會(huì)進(jìn)行連續(xù)的洗滌大大提高,以去除未結(jié)合的分子。為了防止剩余的溶液帶到下一個(gè)試劑步驟中研究成果,把過量的液體全部吸走非常重要取得了一定進展。Opentrons的8通道移液器可進(jìn)行高效、精準(zhǔn)的移液處理大面積,以滿足 ELISA 中試劑移液和洗滌的需求積極參與。此外,可以通過添加 Opentrons 溫控模塊或熱振蕩儀培養,以提升自動(dòng)化功能和滿足實(shí)驗(yàn)中的樣品孵育環(huán)節(jié)(例如設(shè)定為37℃以促進(jìn)抗原-抗體相互作用)所需的恒溫功能交流研討。

材料和方法
圖1-3顯示了在 Opentrons OT-2 上測試的三種 ELISA 的示意圖,包括試驗(yàn)步驟概述和甲板布局形式。

在OT-2 上進(jìn)行的 Takara 公司的人類 FN 夾心法酶聯(lián)免疫吸附檢測
在OT-2上進(jìn)行的 Tecan 皮質(zhì)醇唾液競爭法 ELISA 實(shí)驗(yàn)
在OT-2上進(jìn)行的 Cell Sciences SARS-CoV-2 替代病毒中和實(shí)驗(yàn)(競爭法 ELISA)

液體轉(zhuǎn)移是通過8通道移液器進(jìn)行的建設應用。ELISA 孔板使用了一個(gè)帶 有裂縫密封的封膜 (BioChromato, 日本藤澤),這樣移液器 的吸頭可以穿過封膜,同時(shí)在孵育期間防止蒸發(fā)日漸深入。然后動力,ELISA 板被固定在熱振蕩儀上,并按照說明書的要求提供熱力和攪拌 作用(參考表1)互動式宣講。在完成實(shí)驗(yàn)后效高性,需要立即手動(dòng)將 ELISA 孔板移至酶標(biāo)儀,并在450 nm 波長處測量吸光度值開展。

為了測試 FN EIA 試劑盒互動互補,首先將人血漿中的 FN 溶解在去離子水中發揮重要帶動作用,制備出1 mg/mL 的儲(chǔ)備溶液,然后進(jìn)一步稀釋至500 ng/mL 并進(jìn)行2倍的連續(xù)稀釋意料之外。而對于皮質(zhì)醇 ELISA 測試文化價值,則 使用試劑盒提供的已知皮質(zhì)醇濃度的標(biāo)準(zhǔn)品和控制液。之前已 經(jīng)測試過 SARS-CoV-2 抗體陽性或陰性的血清樣本將被用于病 毒中和 ELISA 實(shí)驗(yàn)置之不顧。每個(gè)實(shí)驗(yàn)在不同樣本量下的運(yùn)行時(shí)間是可預(yù)估的(參考表1)不斷完善。

實(shí)驗(yàn)結(jié)果
將 FN EIAs 在 OT-2 上進(jìn)行處理】臻g廣闊?梢酝ㄟ^評估最終讀數(shù)與目標(biāo)分子濃度之間的相關(guān)性以及不同實(shí)驗(yàn)之間這種相關(guān)性的一致性來評估樣本處理質(zhì)量。通過繪制平均吸光度 (n=3)與 FN 濃度之間的關(guān)系圖改革創新,并計(jì)算標(biāo)準(zhǔn)偏差知識和技能,可以確定線性回歸的擬合優(yōu)度。

結(jié)果展現(xiàn)了 OT-2 在執(zhí)行該試劑盒的實(shí)驗(yàn)中的準(zhǔn)確性和精密度(R平方>0.99,CV<10%) (圖4A), 和重復(fù)性(圖4B)新模式。使用皮質(zhì)醇的連續(xù)稀釋來測試OT-2上的競爭法 ELISA 實現。結(jié)果顯示液體處理的一致性 (n=3,CV<10%),在半對數(shù)圖上呈現(xiàn)了試驗(yàn)讀數(shù)與對數(shù)轉(zhuǎn)換后的樣品濃度之間的優(yōu)秀負(fù)線性關(guān)聯(lián) (R 平方>0 .99) ( 圖5A), 并且實(shí)驗(yàn)之間具有可重復(fù)性(圖5C)。

每次測定的熱振蕩儀設(shè)置以及不同樣本量的預(yù)計(jì)運(yùn)行時(shí)間
實(shí)驗(yàn)結(jié)果數(shù)據(jù)

為了檢測競爭法 ELISA 中 ACE2-RBD 結(jié)合的抑制作用組織了,血清樣本 在 OT-2 上進(jìn)行了三次處理服務體系,在酶標(biāo)儀上測量吸光度,并獲得了變異系數(shù)搶抓機遇。結(jié)果再次確認(rèn)了 OT-2 液體處理的精確性 (CV<10%)(圖6)分析。根據(jù)廠家的說明書,該實(shí)驗(yàn)是有效的全面闡釋,因?yàn)槊總€(gè)控制組 的 OD450 值都在標(biāo)準(zhǔn)范圍內(nèi)(陽性對照<0.3,陰性對照>0.9)非常激烈。抑制率的計(jì)算公式如下:

抑制率的計(jì)算公式
通過將樣本的抑制率與陽性截?cái)嘀?>=20%)或陰性截?cái)嘀?<20%)進(jìn)行比較,確定每個(gè)樣本中是否存在中和抗體引人註目。

該實(shí)驗(yàn)成功檢測到先前被診斷為SARS-CoV-2抗體陽性的樣本中能夠中和 ACE2-RBD 相互作用的抗體(表格1)領域。

在OT-2 上進(jìn)行的 Cell Sciences公司的SARS-CoV-2  替代病 毒中和實(shí)驗(yàn)
圖 6 : 在OT-2 上進(jìn)行的 Cell Sciences公司的SARS-CoV-2 替代病 毒中和實(shí)驗(yàn),以出色的精確性測量了人體血清樣本中存在的中和抗 體好宣講。根據(jù)每個(gè)控制組的 OD450 值都在范圍內(nèi)(陽性對照<0.3,陰性對照>0.9),該實(shí)驗(yàn)是有效的註入新的動力。
使用經(jīng)FDA認(rèn)證的ELISA方法

實(shí)驗(yàn)總結(jié)
通過使用 OT-2 進(jìn)行競爭性 ELISA和中和抗體檢測,我們得出結(jié)論:
1、在 OT-2 上進(jìn)行的稀釋處理和吸光度測量顯示了高度一致的結(jié)果雙重提升,證實(shí)了 OT-2 液體處理的精確性和可重復(fù)性。
2品牌、根據(jù)廠家說明書的要求範圍,實(shí)驗(yàn)的對照組的 OD450 值都在有效范圍內(nèi),驗(yàn)證了實(shí)驗(yàn)的有效性紮實做。
3空間廣闊、利用實(shí)驗(yàn)測量的抑制率,成功檢測到先前被診斷為SARS-CoV-2 抗體陽性的樣本中存在的中和抗體。
4服務品質、表格2中的人體血清樣本確認(rèn)為陽性的發生,進(jìn)一步證實(shí)了其先前 ELISA檢測的結(jié)果。
綜上所述影響,該實(shí)驗(yàn)在檢測中和抗體方面表現(xiàn)出優(yōu)越的精確性和可靠性 新的動力,OT-2 的樣品處理能力足以與傳統(tǒng)手動(dòng)方法相媲美。

聯(lián)系我們

經(jīng)驗(yàn)豐富的服務(wù)團(tuán)隊(duì)和強(qiáng)大的生產(chǎn)支持團(tuán)隊(duì)為客戶提供無憂的訂單服務(wù)發展契機。

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