Kristin Ellis 最近訪問了位于加州圣拉斐爾的 Biomarin 制藥公司總部。在那里，她與 Biomarin 蛋白質生物化學的高級研究助理 Elaine Phan 進行了交談自行開發。Elaine Phan 一直在使用 OT-1 PRO進行蛋白質定量分析基石之一。

（為了給您提供更簡潔易懂的閱讀體驗生產效率， 本篇報導已經(jīng)過編輯優(yōu)化）作用。

Kristin:?我非常高興聽到Biomarin如何利用 OT-1 PRO應用的因素之一，那么行業分類，首先技術特點，能否分享一下您使用 Opentrons 的體驗？

Elaine:?非常棒發展邏輯！你們提供的協(xié)議讓我得以順利執(zhí)行凝聚力量。目前為止，我主要是根據(jù)你們給我的自動化 Bradford Assay 的說明進行操作聽得進，然后在你們的網(wǎng)站上查找如何編寫協(xié)議的細節(jié)新的力量。我想你們有一個專門的頁面供人學習吧？

Kristin:?您是指Opentrons的開源API文檔嗎便利性？

Elaine:?對去創新，還有 Artyom 推薦的 Python 學習平臺 SoloLearn。起初緊迫性，我是根據(jù) Will 在博客上分享的 JSON協(xié)議進行學習的結構，這讓我更容易理解 Python 的相關內容更適合。

Kristin:?哦，真的溝通協調？您為什么這么認為要素配置改革？

Elaine:?因為開始時，我覺得 Python 看起來更復雜保障性。但通過閱讀你們提供的 JSON 說明影響力範圍，我能夠更好地理解并編寫各種命令。當我拿到硬件后新創新即將到來，我能夠迅速組裝機器邁出了重要的一步，并調整已有的 Bradford Assay 代碼。對我而言設施，我已經(jīng)進行了十多年的加樣工作需求，這款設備真的減輕了我手臂的負擔。

Kristin:?你能否簡要介紹一下你們團隊的工作內容組合運用？

Elaine:?我們專注于蛋白質純化更讓我明白了，屬于蛋白質科學研究團隊。我們的工作流程非常龐大積極，而我還處于研究的初級階段探索。我們獲取許多餾分，并需要確定每個餾分的純度產業。這意味著我們需要進行凝膠電泳滿意度、Bradford實驗等操作，然后集中所有所需的材料可持續。接下來機製性梗阻，我們要制備足夠的材料，用于臨床前樣本全過程，以展示藥物的療效集成應用。簡而言之，我們需要制備足夠的藥物不負眾望，以便提供給其他團隊進行實驗高效流通。一旦完成這些實驗，我們將藥物用于小鼠模型精準調控，觀察其效果功能。擁有 Opentrons 機器人可以大大加快這一流程，使其更加高效解決。

Kristin:?你們測試的蛋白質最初是從哪里獲得的預期？

Elaine:?我們有另一個團隊專門進行細胞培養(yǎng)。他們?yōu)槲遗囵B(yǎng)所需的細胞幅度。我們使用哺乳動物細胞和 E.coli 兩種細胞結構。目前重要的作用，我主要研究 E. coli，并在其上表達 His-tag簡單化。這個過程相對簡單力度。通過 His 結合柱將蛋白質結合，然后洗脫系統性，再將其放入餾分中勇探新路，就可以觀察到蛋白質的位置。

Kristin:?這樣你們就能觀察到蛋白質的表達情況了傳遞。

Elaine:?是的試驗，流程大致是這樣的。首先開展攻關合作，進行加載步驟製度保障，將樣本裝入儀器中，未與柱子結合的物質會流出自行開發。這樣，所有不需要的雜質都可以被去除責任。接下來是洗滌步驟應用情況，用于沖洗柱子。然后通過咪唑梯度將材料洗脫出來組建，最終只有我想要結合的物質才會與柱子結合表現。將這些與柱子結合的物質收集起來，并分成多個餾分深刻變革。然后通過凝膠電泳分析其純度結論。我還要進行 Bradford 實驗，以量化所有蛋白質并顯示回收率質生產力。之后適應性強，可以對每個餾分進行凝膠電泳，或者將幾個餾分合并后進行凝膠電泳先進的解決方案，然后通過 Western blot 觀察蛋白質的位置拓展。這就是我們通常所做的工作！

我們最終的目標是讓 OT-1 能夠進行 ELISAs 實驗宣講活動。我們需要展示活性等數(shù)據(jù)不斷進步。我個人不從事 ELISAs 方面的工作，但其他人會進行這方面的研究效率。因此規模，一旦他們確定了工作流程，我就可以從他們那里獲得 ELISAs和其他活性檢測方法適應性，并嘗試將其應用于機器人上節點。

Kristin:?是的通過活化，這也是我們目前與其他幾個團隊合作的項目之一——我們希望實現(xiàn)各種類型的 ELISAs 的自動化。不僅是單一的 ELISA 支撐作用，還包括 MSD 板研學體驗、Luminex 等我們可以開發(fā)的任何東西。這是我們想要進入的一個領域最為突出。

Elaine: 很好落實落細！一旦我決定開始這方面的研究，我將向您咨詢更多問題高效化。

Kristin:?當然製高點項目！這就是我們存在的意義，也是我們建立這個社區(qū)的原因範圍和領域！

你已經(jīng)使用 OT-1 PRO 一個半月了有所增加。你說你已經(jīng)從事生物學和手動移液工作 10 年了。然后你得到了OT-1 PRO更高要求，并開始學習如何編程和如何圍繞自動化構建實驗越來越重要的位置。與手工操作相比，編程實驗對你的實驗室工作體驗有何影響共同學習？

Elaine:?這臺機器完全顛覆了我的認知順滑地配合。我一直從事生物學和手動移液工作 10 年，從未想過能接觸到這個全新的領域⌒Ц?，F(xiàn)在前沿技術，這臺機器幾乎成了我的實驗助手。它幫我處理了很多日常的實驗工作性能，比如運行Bradfords 和其他一些常規(guī)實驗多種方式，這為我節(jié)省了大量時間。現(xiàn)在技術創新，我可以把更多精力投入到閱讀文獻深入交流研討、理解實驗原理和改進實驗方法上。此外廣泛應用，學會編程后需求，我仿佛打開了新世界的大門。我現(xiàn)在腦海中充滿了各種想法組合運用，只是還沒有完全表達出來更讓我明白了，因為還有許多東西需要學習。

而且這臺機器有如此多的可能性——比如使用不同的移液器脫穎而出。即使你們說這臺機器可能無法與Rainin 移液器配合使用拓展應用，我還是想嘗試一下。我不會輕易放棄，總是想挑戰(zhàn)新事物管理！

Kristin:?我們當然不會阻止你優化上下！這也是我們讓 Opentrons 平臺保持開源的原因之一，這樣當我們對你說“哦模樣，你知道嗎生產體系，我們這邊不這么做”時，你就可以自己解決很重要！

我知道你覺得編程部分很酷能力和水平，而且你已經(jīng)開始調整硬件了。那么異常狀況，你對硬件模塊化以及可以隨意組合東西有什么看法研究？

Elaine:?這真是太棒了，因為我可以把任何東西放在平臺上應用創新！我以前甚至都沒有考慮過這些好用的東西（指著裝有 Beckman Coulter 儲液池的吸頭架）提高，因為我們通常使用一次性的塑料吸頭架，但現(xiàn)在我可以想到一百萬種可以放在那里的液體的特性。

Biomarin 公司已經(jīng)將 Opentrons 的吸頭架重新利用交流，改造成了 Beckman Coulter 儲液池的支架。

Elaine:?我還想認識其他從事這方面工作的人提供堅實支撐，了解他們的想法還不大。我知道你們在 Slack 頻道上有小型的社區(qū)，但如果我能與人們見面簡單化，解釋我正在做的事情力度，同時他們也向我解釋他們在做什么明確了方向，那么這些想法真的會匯聚在一起系統性。

Kristin:?聽起來你對社區(qū)方面也很感興趣。作為一名在科學領域經(jīng)驗豐富的人單產提升，你認為這種社區(qū)對于發(fā)展和建設非常重要嗎傳遞？

Elaine:?我認為是的，尤其對我而言勞動精神，因為現(xiàn)在我是公司里唯一一個使用它的人開展攻關合作。所以除了你們，我真的不知道該和誰討論這臺機器能做些什么更廣泛的事情動手能力。比如逐步改善，你今天提到有人在使用磁珠、亞馬遜的 Alexa等提升。實際上大大提高，我的編程水平還處于初級階段。我能進行多少更多的編程工作？我應該如何開始學習取得了一定進展？

Kristin:?這就是我們Protocol Library背后的理念完善好。最近我們重新推出了這個庫，我們之所以說“我們與Biomarin 合作開發(fā)了 Bradford Assay”積極參與，部分原因是為了讓人們可以在圖書館中看到這個方案問題分析。然后，如果他們對這個方案有疑問交流研討，可以進入社區(qū)頻道問你們：“嘿更加完善，你是如何開發(fā)這個方案的？”此外相對較高，用戶越多資源配置，我們添加的方案就越多。然后相關，你可以下載它們查看代碼并開始理解大力發展，就像你最初開始時那樣。

Elaine:?是的生產效率，那將會非常有幫助產能提升。能夠在看到方案后向他們提問，使得 Protocol Library 也成為對話的起點節點。我們實際上計劃引入一個平臺通過活化，而我開始意識到你們可以做他們能做的所有事情。他們有一些很好的想法的特點，而他們只是拖放操作健康發展，這對于不懂編程的人來說真的很簡單……但如果我能學習編程，我就可以讓OT-1 來完成它大數據，而且它的成本非常低廉長效機製，這讓我感到非常興奮。

Kristin:?這個觀點其實很有趣空間廣闊！那么營造一處，如果你回顧一下職業(yè)生涯的起點，假設你一開始就擁有像 OT-1 這樣的工具知識和技能，比如這個和一臺 3D 打印機取得顯著成效，那會帶來哪些可能性呢？

Elaine:?那將會是太棒了實現！我現(xiàn)在想想不容忽視，如果當時有這個工具，我可以用它來寫很多實驗服務體系。很多事情說服力，尤其是分離……你知道服務為一體，有時候你不得不加班到很晚才能完成某些工作，因為不能等待逐漸顯現，也不能放入冰箱全會精神，否則蛋白質會沉淀。所以拓展基地，你只能完成到某個階段集中展示，然后停下來或冷凍起來。在很多這樣的情況下體系流動性，如果有一個助手幫忙探索創新，那就太棒了。

Kristin:?你是如何決定從 Bradford Assay 開始的實現了超越？這是你們實驗室的迫切需求嗎新產品？

Elaine:?是的，這是每個人都要運行的實驗橋梁作用，也是每個新來的人都要學習的基礎知識長遠所需，因為每個人都需要時刻知道蛋白質的濃度。所以我們想讓人糾結，如果機器能運行這個 Bradford Assay規模，那么它也能運行 ELISAs，可以做凝膠制備基石之一，可以做標準曲線聯動。Bradford Assay 只是每個人在實驗室開始時必須做的基本移液實驗。如果你能非常準確地完成這些共同努力，那么你可能就能完成我們實驗室需要的所有實驗行業內卷。

Elaine 最初沒有編程經(jīng)驗，但通過學習新的動力，她現(xiàn)在已經(jīng)成長為 Opentrons 的超級用戶的過程中！她的反饋幫助我們改善了用戶體驗，她對 Protocol Library 的貢獻使科學對每個人來說都更具可重復性廣泛認同。