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2016 年 09 月 27 日

Opentrons 客戶訪談 | 在 Glowee 制作生物發(fā)光標志

本次客戶訪談將為大家?guī)斫ㄑ灾边_,?Opentrons 聯(lián)合創(chuàng)始人 Will Canine 在巴黎與 Glowee 的首席科學官 Samuel Juillot 的精彩對話拓展。Glowee 是一家法國初創(chuàng)公司求得平衡,他們在實驗室使用 OT-1 PRO 制造生物發(fā)光標志就此掀開。

(為了給您提供簡潔易懂的閱讀體驗,本次采訪已經過編輯優(yōu)化相關性。).

用生物發(fā)光點亮城市

Will: 好的管理,我看過你們的網站,請你分享一下增強,你的團隊研究項目是?

Samuel: 我們正在研究一種為未來城市提供照明的新方法形式。我們的目標是找到一種不依賴電力產生光的方法置之不顧。當我們觀察自然界時,我們發(fā)現(xiàn)了一個理想的解決方案數字化,那就是生物發(fā)光現(xiàn)象方便。在自然界中,有一些生物可以發(fā)出無需電力支持的光各領域。我們深受啟發(fā)傳遞,并希望將這一自然現(xiàn)象應用于城市照明中。

Samuel: Sandra Rey 是該項目的創(chuàng)始人深入闡釋。她從自然界中觀察到了生物發(fā)光現(xiàn)象相關性,并思考著如何利用這一特性。于是物聯與互聯,項目就這樣開始了穩定。雖然她是一名設計師,但并非生物學家供給,因此需要找到合適的人選來實現(xiàn)產品的研發(fā)優勢與挑戰。公司成立于 2014 年 12 月,至今不到兩年的時間解決方案。我們的目標是開發(fā)一款不依賴電力趨勢、不需要基礎設施的照明產品有力扭轉。用戶只需將其放在玻璃表面上,就像貼上一張貼紙一樣簡單一站式服務。

Will: 太棒了廣度和深度!聽起來就像“即撕即玩”一樣。

Samuel: 是的引領作用。

Will: 酷加強宣傳!它正在逐漸取代傳統(tǒng)的霓虹燈廣告牌。

Samuel: 是的效率和安。

Will: 的確目前城市里霓虹燈廣告牌太多了設計能力,而且它們也非常耗電品牌。這太棒了深入開展。我什么時候可以購買Glowee?

Samuel: 哈哈, 目前還不行等形式。

An early Glowee prototype

公司的起步階段

Will: 你在公司成立不久后就加入了技術的開發,對吧?在你獲得博士學位之后飛躍?

Samuel: 是的更高效。

Will: 那么你最初的目標是什么?你最初想要構建的是什么重要部署?你希望達到的里程碑是什么推進高水平?

Samuel: 當然與時俱進,首先我們想讓穩(wěn)定發(fā)光持續(xù)時間超過10小時。

Will: 太酷了,那是個不錯的目標服務。持續(xù)穩(wěn)定發(fā)光10小時。

Samuel: 而且不是在液體狀態(tài)下重要組成部分。因為制作液體培養(yǎng)物很容易就能壓製。

Will: 在振蕩的生物反應器里?

Samuel: 沒錯記得牢,振蕩註入了新的力量、冒泡的生物反應器需要電力。而我們正在制造不使用電力的光更多可能性。

Will: 所以這意味著讓細菌在瓊脂上生長嗎去創新?

Samuel: 差不多是這樣。

Will: 差不多緊迫性?

Samuel: 凝膠化溶液結構。

Will: 原來如此,太酷了多元化服務體系!

Samuel: 我們的首席執(zhí)行官是一位設計師規劃,所以她不希望有任何惡心或難看的顏色擴大公共數據。也不希望有任何難聞的氣味。

Will: 這點很重要帶動擴大!

Samuel: 所以我們也致力于制造出最好的產品『诵募夹g體系,F(xiàn)在我們在凝膠化介質中的發(fā)光時間已經達到了72小時。

Will: 然后他們每72小時就要更換一次你們的廣告牌嗎持續發展?

Samuel: 目前是的必然趨勢,但這么做不是很方便。所以我們的目標是到年底讓發(fā)光時間達到一周擴大。

Will: 太好了多樣性。

Samuel: 你可能會想:“好吧,但與LED系統(tǒng)相比新格局,你們的產品使用壽命達不到那么長明顯。”我認為顯示,如果你每天使用24小時創新為先,LED的使用壽命大約是三年。我們做過生命周期分析科普活動,實際上就二氧化碳消耗而言創新延展,如果你把所有的因素都考慮進去——LED的生產、電力生產等等——我們的發(fā)光系統(tǒng)使用壽命一周狀況,從長遠來看更可持續(xù)機製性梗阻。剛開始,我們每單位生命周期排放的二氧化碳比LED少3倍全過程,如果發(fā)光時間是一個月集成應用,那么二氧化碳排放量將少10倍。這就非承Ч??捎^了使用。

Will: 非常同意。

Samuel: 當然密度增加,目前它只適用于店面有效性,只適用于特定的市場。

Will: 目前是這樣機遇與挑戰!

Samuel: 沒錯廣泛關註,目前是這樣。

合成生物學照明

Will: 那么集成技術,你們最初使用的是哪些基因來進行生物發(fā)光就能壓製?

Samuel: 我們最初使用的是來自費氏弧菌的 lux 操縱子。這是眾所周知的,實際上也是 2010 年劍橋的一個iGEM 項目中使用的更優美。這是 iGEM 項目中的第一個部分各方面,他們目前已經開始圍繞這個系統(tǒng)制造更好的發(fā)光裝置。

Will: 有沒有辦法讓它白天停止發(fā)光成效與經驗,晚上再發(fā)光適應性?我相信你們已經考慮過所有這些調節(jié)方式。

Samuel: 是的稍有不慎,當然重要作用。這也是生物啟發(fā)的結果,觀察自然界中受光照調節(jié)的植物最為顯著∮葹橥怀?;旧希镧娛且粋€重要的概念環境,我們的目標是利用這些受白天和黑夜調節(jié)的啟動子空間載體。目前我們還在研究細菌,如大腸桿菌等優勢與挑戰,并且我們可以通過光來控制它們的活動利用好,這很不錯深入各系統。實際上解決問題,我在做博士研究時做的就是光遺傳學。

Will: 通過光來開啟和關閉事物作用?

Samuel: 沒錯相互配合。

Will: 那通常用于神經生物學,對吧著力增加?

Samuel: 沒錯智能化,它始于神經生物學,但我們現(xiàn)在可以用光來控制一切處理。

Will: 好的建設,所以它是用光來開啟和關閉基因回路嗎?

Samuel: 實際上助力各行,首先是蛋白質-蛋白質的相互作用前來體驗。你可以激活反應或終止反應。所以基本上基因表達很簡單確定性,你改變構象并與DNA結合更加廣闊。但你也可以想象這樣一個系統(tǒng),當你打開光時講故事,其中兩種蛋白質就會簡單地相互作用非常完善。

Will: 你可以用光來啟動和停止生物發(fā)光過程。

Samuel: 是的。

Will: 太酷了作用,這太神奇了情況正常。有朝一日,你可能看到你的發(fā)光物體通過光來開啟或關閉另一個物體技術特點。

Samuel: 這現(xiàn)在很棘手醒悟。因為我們也發(fā)出光,所以……

Will: ……事情變得復雜了高質量。

Samuel: 哈哈也逐步提升,沒錯。

實驗室工作

Will: 那么註入了新的力量,請告訴我你的實驗室工作重要的作用。你們通常都做什么?大量的細菌培養(yǎng)嗎去創新?

Samuel: 是的反應能力,但現(xiàn)在我們暫停了一下,目前正在與一個公司合作——這用英語怎么說學習?當你要求另一家公司為你生產東西時結構重塑。

Will: 像CRO?還是只是一個承包商應用優勢?

Samuel: 對高質量發展。所以他們負責生產細菌,因為我們已經做了四次大型活動高效節能,需要生產幾百升的生物發(fā)光細菌影響力範圍。第一次是在去年的巴黎 COP21 上。這是為聯(lián)合國做的關于生態(tài)變化的項目新創新即將到來。兩周后我們還有另一項大型活動要做邁出了重要的一步。基本上每次我們都會生產越來越多的細菌設施,最多可達100升需求,而我們自己無法生產這么多升。這會讓整個團隊集中精力好幾個星期組合運用,但我們仍處于研究階段更讓我明白了,必須保持專注。

Will: 好的競爭力,那么是什么驅動著你的研究充分?

Samuel: 我們做了很多微生物學研究。為此我們做了很多克隆工作集聚,實際上為了優(yōu)化熒光素酶的量子產率競爭力,我們啟動了一個大規(guī)模的突變項目調整推進,即隨機突變,因為它既簡單又高效機製性梗阻。我們有一個菌落選擇器來篩選大量突變體機製。

Will: 你是直接拍個照片,選最亮的然后挑出來嗎集成應用?

Samuel: 目前探討,我們會篩選所有的菌落,然后使用一個 96 孔板讀取器來檢測菌落的光強度高效流通。所以這就是為什么我們最初對擁有一臺 Opentrons 機器人感興趣調解製度。基本上統籌發展,我們的目標是使我們的流程中的一部分標準化深化涉外,并讓一部分工作自動化,這樣你就可以準備很多含有培養(yǎng)基的平板生產製造。這樣開展試點,我們就不需要每天手動使用多通道移液器了,讓機器人來做共同。雖然很簡單推進一步,但是每天都要在每個孔中加入培養(yǎng)基——我們每天做 9 或 10 個平板——這是一項繁重的工作。

Will: 真棒簡單化!就是讓 Opentrons 機器人往平板里加培養(yǎng)基嗎力度?

Samuel: 對。

Will: 太好了優勢,這類工作不應該手工去做善謀新篇。

Samuel: 沒錯。然后我們使用 QPix 來挑選菌落并將其放入平板的孔中便利性。之后,我們在平板中培養(yǎng)剛剛挑選的細菌行動力,幾個小時后測量生物發(fā)光提供有力支撐。我們有一個系統(tǒng)可以直接用孔板讀取器測量哪個更亮。之后保供,我們取出來自行開發,放在另一個孔板上,然后用 Opentrons 機器人進行稀釋責任。

Will: 太酷了應用情況,我們喜歡做稀釋。

Samuel: 嗯組建,這有點像精準采摘表現,把孔板一個接一個地轉過去并稀釋。我們把第一次篩選的陽性菌落放在第一行,并進行稀釋以進行復現(xiàn)結論。這是為了確認它不是孔板讀取器的誤讀和諧共生,而是一個真正的陽性。這是我們真正有興趣使用 Opentrons 機器人的第一部分適應性強。

Will: 這太棒了技術交流。所以,回顧一下相對較高,Opentrons機器人是你自動化突變流程的一部分嗎資源配置?

Samuel: 是的。

Will: 太酷了相關!請介紹下您的目標是什么相互融合?

增加量子產率

Samuel: 當我們談論生物發(fā)光和強度時,我們確實可以將其與電腦屏幕進行類比綠色化。發(fā)光強度不同需求,它并不是以流明為單位,而是以發(fā)光單位來衡量保持穩定。簡單來說總之,這就是強度,但它代表的是每平方米的亮度支撐作用。

Will: 好的研學體驗,面積強度。

Samuel: 對最為突出。

Will: 這是你的重要指標嗎落實落細?

Samuel: 是的。現(xiàn)在我們想增加每個細菌發(fā)出的光高效化。這意味著改變量子產率製高點項目,也就是每個反應發(fā)出的光子數(shù)。眾所周知範圍和領域,這些熒光素酶在細菌中的量子產率非常差有所增加。

Will: 你剛才說量子產率?

Samuel: 對更高要求。

Will: 好的越來越重要的位置,太酷了。嗯共同學習,哇順滑地配合?

Samuel: 哈哈——所以這就是每個反應產生的光子數(shù)。

Will: 明白了效高,所以這些熒光素酶產生光子的效率較低前沿技術,也就是發(fā)出光的效率較低基礎。

Samuel: 對。如果你看一下 Promega 產品更默契了,例如先進技術。

Will: 你是說供應商嗎?

Samuel: 是的不合理波動。他們出售了很多種熒光素酶宣講手段。即使他們常規(guī)的產品,亮度也比我們現(xiàn)在使用的要高出約80倍積極拓展新的領域。問題是配套設備,我們無法在微生物中生產 Promega 熒光素酶的底物,因為我們不知道其生物合成途徑相對開放。

Will: 嗯推進高水平,他們是怎么做的?

Samuel: 他們通過化學方法制造這些熒光素酶拓展應用,因為這些酶是用于體外檢測的生產創效,所以目的與我們在細菌中使用它們的目的不同。這意味著管理,我們必須針對我們在細菌中擁有的東西進行優(yōu)化優化上下,但目前的量子產率并不高效。因此模樣,我們需要從根本上改變這一點生產體系。如果你觀察大自然,你會發(fā)現(xiàn)一些高效的突變體很重要。通過觀察這些突變體的結構能力和水平,我們可以分析哪些氨基酸發(fā)生了變化,從而使它們更亮異常狀況。在其他菌株中研究,其他變體可能會改變它們的波長并變得更亮。

Different luciferaces found in nature

色彩方面

Samuel: 當你深入觀察大自然時統籌發展,你會發(fā)現(xiàn) YFP 有時會與 lux 操縱子融合深化涉外。這種融合使得黃色熒光蛋白能夠吸收生物發(fā)光的光,并發(fā)出黃色的光生產製造。通過這種方式,我們稍微改變了光的發(fā)射波長攜手共進,從而產生了一種放大的效果共同。因此,我們得到的是一個更亮的系統(tǒng)經過。這種技術被稱為 BRET充分發揮,即生物發(fā)光共振能量轉移選擇適用。它與 FRET 有些相似,但區(qū)別在于我們不是在熒光之間進行能量轉移設計,而是在生物發(fā)光與熒光之間進行業務指導。

Will: 好的,真有趣就此掀開。

Samuel: 另外長足發展,如果你觀察深海中的一些小型微生物,你會發(fā)現(xiàn)它們在某些菌絲上具有彩虹色穩步前行。也許我可以給你看一張照片結構不合理。實際上,它們擁有所有類型的顏色逐步改善,真是令人難以置信意見征詢。

Rainbow bioluminescence

Will: 哇!這真是令人震驚大大提高!

Samuel: 這就是生物發(fā)光的必然要求。實際上,它是與熒光融合在一起的取得了一定進展。生物發(fā)光有一種發(fā)射光顏色完善好,之后熒光會改變波長。

Will: 太神奇了可能性更大。所以你們正在研究這種東西部署安排?

Samuel: 沒錯。所以我們的想法是獲得所有六種顏色技術。

Will: 它看起來真的就像霓虹燈一樣推廣開來,確實如此。那會很酷相對較高。

Samuel: 目前我們實際上是在白天制造顏色資源配置,這樣你就可以用你的貼紙做廣告了。例如相關,你可以在貼紙上用紅色寫出完全個性化的東西大力發展。而在晚上,你看不到紅色生產效率,但你可以看到生物發(fā)光的藍綠色光芒產能提升。

Will: 太酷了!

Samuel: 所以現(xiàn)在白天它可以是藍色將進一步、黃色充分發揮,我們可以得到一些綠色、紅色成就,我們還有白色重要方式。所以白天你能看到一些東西開展面對面,之后晚上你有生物發(fā)光。為什么我們想擁有這種屬性非常重要、這種特性呢進一步提升?因為我們的第一個原型是用于店面。

Will: 我們什么時候能看到呢營造一處?

Samuel: 明年年初改革創新。

Opentrons 非常榮幸能夠與 Glowee 這樣的生物技術公司合作,共同致力于利用科技中的生物學力量來改善我們星球的健康和幸福資源優勢。我們很高興與大家分享 Opentrons 機器人如何在世界各地發(fā)揮作用高效利用。

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