Arianna Morosetti 在卡爾加里大學研究驅(qū)蟲藥耐藥性廣度和深度。 她使用 Opentrons OT-2 移液機器人進行了大量 PCR順滑地配合。

卡爾加里大學（University of Calgary）是加拿大頂級大學之一 。Arianna Morosetti?是一名分子生物學家，在卡爾加里大學的 Gilleard 實驗室研究寄生線蟲的耐藥性線上線下。該實驗室于2019年3月購買了第一臺Opentrons OT-2事關全面，并希望再另外加夠一臺專門用于PCR應用取得了一定進展。

Arianna Morosetti 在卡爾加里大學 Gilleard 實驗室與他們的 OT-2 合影高質量，圖片來源：Arianna Morosetti

Opentrons: 請介紹一下您的研究背景。

ARIANNA MOROSETTI:?我是一名分子生物學家資源優勢，受聘為卡爾加里大學 Gilleard 實驗室的博士后研究員高效利用。我在一個大型研究小組工作，我們小組的成員研究背景各不相同估算，有從事生物信息學工作的講理論，也有剛接觸這個學術(shù)領(lǐng)域的的可能性，甚至還有從未接觸過移液器的。但是我們最終順利讓每個人都具備做分子生物學實驗的能力各領域。

在這個職位之前應用領域，我曾在企業(yè)任職，所以我知道實驗室自動化方面的應用情況進行培訓。在卡爾加里大學任職工作中發展機遇，我會使用OT-2來驗證新協(xié)議和簡化我們的標準程序。

Opentrons: 請問您的研究項目是組織了？

AM:?我從事擴增子測序工作。我們利用分子遺傳學和基因組學方法來研究含有大量重要病原體的寄生線蟲說服力。我們實驗室的核心項目是研究驅(qū)蟲藥的耐藥性搶抓機遇，并研究潛在因果突變在寄生線蟲種群中的產(chǎn)生和傳播。我們的目標是改進診斷表示，確定新的控制目標全面闡釋，并為耐藥性的可持續(xù)管理提供證據(jù)基礎(chǔ)。

Opentrons: 請問您在實驗室的日常工作是怎樣的競爭力所在？

AM:?我們用于擴增測序的協(xié)議在非常具體的工作流程中有很多既定元素引人註目。我們經(jīng)歷了一個較復雜的 PCR 設(shè)置步驟：有時我們會使用 4 塊裝有 96 個樣品的孔板，使用 96 種獨特的引物進行組合好宣講。手動處理這樣的工作非常麻煩事關全面，也非常耗時，因此我們把這些手動工序交給 OT-2 移液機器人執(zhí)行新的動力。

Opentrons: 您為什么選擇OT-2迎來新的篇章？

AM:?我們實驗室已經(jīng)有一臺其他品牌的設(shè)備，我們考慮使用它實施體系，但用到它的次數(shù)不多再獲，而且該公司在支持請求方面反應不及時。我們還需要購買一個額外的磁性模塊來執(zhí)行我們的方案生產能力。由于我們在 PCR 前室和PCR 后室分開工作標準，這意味著我們將不得不購買一臺新的機器人和磁性模塊，這會產(chǎn)生很高的費用堅持好。Opentrons OT-2 和磁性模塊價格實惠重要作用，性價比高，能滿足我們所需要的實驗功能習慣，這是我們在比較多家產(chǎn)品后充足，最后選擇 OT-2 的重要原因。

Opentrons: 您具體使用OT-2進行哪些工作的積極性？它如何融入您的工作流程綠色化發展？

AM:?我們使用 OT-2 來分配少量的引物至關重要。我們有一個簡單的方案，是我用 Opentrons Protocol Designer 這個簡單的工具設(shè)計的∮蒙狭?，F(xiàn)在它工作得很好提升行動，我們經(jīng)常使用它，但我們一開始就面臨缺少經(jīng)過驗證的濾芯吸頭的問題關註。我嘗試使用不同品牌的濾芯吸頭研究進展，但這給方案的開發(fā)造成了延誤。現(xiàn)在濾芯吸頭已經(jīng)有了連日來，問題就解決了快速融入。

在我們的擴增子測序工作流程中，我們使用磁珠來清理我們的PCR產(chǎn)物系統，這需要大量時間和手工工作增強。為了提升清理效率和節(jié)省人力成本，我們使用了 Opentrons 磁性模塊進行自動化磁珠清理工作形式。我對 Python 進行一些研究之后置之不顧，創(chuàng)建了我們的自動化協(xié)議不斷完善。我們對規(guī)避交叉污染的要求非常嚴格（因為這個環(huán)節(jié)對我們文庫制備環(huán)節(jié)的影響至關(guān)重要）數字化，但 Opentrons 的支持團隊給了我們很多有用的幫助。我們提出了很多問題基礎上，但他們很有耐心幫我們解決問題各領域。下一步我們將使用 PCR 樣本驗證所有內(nèi)容。

Opentrons: 您的OT-2運行體驗如何保持競爭優勢？

AM:?我們的其中一個 P10 移液器出現(xiàn)了漏液問題進行培訓，但 Opentrons 的客戶支持團隊很快給我更換了新的移液器，目前一切都很順利長效機製。除此之外法治力量，我通過用各種顏色的食用色素對機器人做了很多測試，然后運行程序進行調(diào)整分享。我就是這樣做的供給，只是通過觀察并根據(jù)我們想要實現(xiàn)的目標調(diào)整程序。

Opentrons: 在您使用 OT-2 之前經驗分享，您是否使用過其他實驗室自動化設(shè)備解決方案？您對實驗室自動化過程的期望是什么？

AM:?這是我第一次使用實驗室自動化設(shè)備有力扭轉。我原本預計會有一些挫折上高質量，所以當出現(xiàn)問題時，我深吸了一口氣廣度和深度，然后再次嘗試深入交流。我不害怕新事物引領作用；通常當有新設(shè)備出現(xiàn)時，我會非常樂于嘗試雙向互動。

根據(jù)我的經(jīng)驗效率和安，設(shè)置任何移液機器人都需要時間。不管是什么機器品牌，無論它操作軟件有多直觀深入開展，都需要一個人花時間學習他們實驗室機器人的所有功能，并真正了解軟件是如何工作的等形式。

Opentrons: 您的 OT-2 有哪些優(yōu)缺點技術的開發？

AM:?OT-2 自動化使我們的生活變得更加輕松。對于專業(yè)研究員飛躍，使用 OT-2 有助于節(jié)省實驗時間更高效。

我們實驗室也有很多學生和訪客來學習我們小組使用的技術(shù)。我們將 OT-2 集成到我們的實驗室程序中重要部署，學生和訪客只需從冷凍室中取出預先分配好的孔板即可開始他們的實驗具體而言。他們學習起來也很方便。

Opentrons: 當前的模塊是否滿足您的需求智慧與合力？您是否考慮添加其他功能模塊喜愛？

AM:?我們已經(jīng)看過 Opentrons 的熱循環(huán)模塊，我們認為它將可以與我們的磁珠清理單元很好地集成到一起開放要求。熱循環(huán)模塊是我們計劃內(nèi)需要的向好態勢，它可以提供更多功能，同時可以有效利用甲板空間服務機製。

我認為對于我自己來說貢獻力量，為了運行常規(guī)的 DNA 提取，我可能需要加一個溫控模塊更多可能性，但限制因素是需要在機器人外執(zhí)行的離心步驟去創新。對我們來說最重要的是處理我們工作流程中最耗時的部分，即PCR設(shè)置和清理步驟緊迫性。

Opentrons: 關(guān)于機器人自動化結構，您的感受是怎樣的？

AM:?為一名用戶多元化服務體系，我希望有更多關(guān)于使用API的教程規劃。我對 Python 有一點經(jīng)驗，但經(jīng)驗還不夠充分深度，因為我的應用更側(cè)重于使用對象來進行設(shè)計和編程帶動擴大。我認為生物學領(lǐng)域的大多數(shù)專家都不精通Python，而且現(xiàn)有的教程沒有起到有效的幫助持續發展。我認為網(wǎng)絡(luò)研討會或視頻會更有幫助明顯。

我在使用 OT-2 時還有一個期望創新延展，就是能夠使用不同的實驗室器具和材料。如果我們使用的產(chǎn)品沒有在 OT-2上進行過測試密度增加，要讓它們工作就有點更成問題了集成技術。但我知道你們正在將 Labware Creator 整合進來，這將對我們有很大幫助。特別是我們的濾芯吸頭環境。

我認為機器人非常有幫助優勢與挑戰。很多人認為你必須在實驗室里受苦，但我不同意解決方案。我在許多實驗室工作趨勢，它們的資金能力各不相同，我經(jīng)常不得不手動操作上高質量。我很認同刻苦學習研究的精神一站式服務，但是隨著科技的進步，科研的工作效率應該提升深入交流，自動化技術(shù)的發(fā)展也可以使我們研究過程也變得不那么乏味智能化。

我認為你不應該花太多時間在重復的步驟上，這些步驟對你的研究沒有價值處理。如果你有一種方法可以做到這一點——移液——既干凈又實用建設，那么你應該朝著使用它前進，即使起步要投入的時間和勞動力投資可能很高助力各行。