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2021 年 05 月 18 日

Opentrons 客戶訪談 | 生物技術(shù)公司Parhelia Bio

本期客戶訪談將為大家介紹一家正在顛覆自動(dòng)化染色行業(yè)的生物技術(shù)公司Parhelia Bio,他們使用Opentrons創(chuàng)造了一臺(tái)靈活且價(jià)格實(shí)惠的載玻片和蓋玻片染色設(shè)備奮戰不懈。

生物技術(shù)公司 Parhelia Bio 的聯(lián)合創(chuàng)始人Nikolay Samusik 和 Yury Goltsev 開發(fā)了一個(gè)插件模塊(并已獲得專利)機製性梗阻。這個(gè)模塊可將任何自動(dòng)化移液平臺(tái)轉(zhuǎn)變?yōu)轱@微鏡樣本的自動(dòng)染色機(jī)。現(xiàn)在,他們使用 Opentrons OT-2 自動(dòng)化移液平臺(tái)和 Opentrons Python 協(xié)議 API 來自動(dòng)化常規(guī)免疫熒光持續創新、Akoya 的 CODEX 以及 IHC 與FFPE 樣本上的抗原恢復(fù)等染色方案。

Opentrons: 你們是如何想到讓 Parhelia 設(shè)備使用液體處理器自動(dòng)染色載玻片這個(gè)想法的服務品質?

Nikolay Samusik:  Parhelia PAR2 設(shè)備的想法和需求源于我們?cè)谒固垢4髮W(xué) Garry Nolan 實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行的研究背景下,當(dāng)時(shí)我們正在研究一種名為 CODEX 的超高多重發(fā)現(xiàn)組織染色方案綜合措施。CODEX 及其臨床級(jí)高通量伙伴OPAL 目前由我們創(chuàng)立的另一家公司—— Akoya Biosciences 進(jìn)行分銷可靠保障。

Yury Goltsev: 在開發(fā) CODEX、OPAL 和其他先進(jìn)的組織染色方法的過程中設計標準,我們了解到像 RNA FISH 和多重 IHC 這樣的復(fù)雜方案雖然對(duì)我們這些開發(fā)人員來說很容易開展,但對(duì)使用者來說卻很困難,學(xué)習(xí)曲線可能相當(dāng)高發揮重要帶動作用。多步驟處理需要花費(fèi)很多時(shí)間意向,根據(jù)抗體/探針的孵育時(shí)間,整個(gè)程序很容易需要超過一天的時(shí)間文化價值,而且對(duì)于新手學(xué)生和經(jīng)驗(yàn)豐富的技術(shù)人員來說形式,很難避免手工移液錯(cuò)誤。我們意識(shí)到我們需要一種特殊的設(shè)備來自動(dòng)化進(jìn)行染色不斷完善,但是市面上大部分自動(dòng)化的起步價(jià)超過 15 萬美元數字化,我們實(shí)驗(yàn)室負(fù)擔(dān)不起。我們也找不到可以處理蓋玻片的自動(dòng)染色機(jī)——就是 CODEX 中使用的平面支撐介質(zhì)基礎上。

Opentrons: 為什么組織染色如此困難各領域?

Yury Goltsev: 因?yàn)樵诮M織染色過程中,多步驟的處理和學(xué)習(xí)新的染色方案需要大量的實(shí)踐和努力保持競爭優勢。要運(yùn)行涉及大量組織樣本處理的調(diào)查項(xiàng)目進行培訓,您必須擁有一個(gè)專職的技術(shù)人員(或甚至一個(gè)技術(shù)團(tuán)隊(duì))勤勉地遵循所有步驟進(jìn)行操作。一個(gè)處理復(fù)雜的多色染色的博士后將花費(fèi)大部分時(shí)間在實(shí)驗(yàn)臺(tái)上不容忽視,沒有時(shí)間來閱讀和分析數(shù)據(jù)組織了。這導(dǎo)致了很多不必要的體力勞動(dòng),并導(dǎo)致了實(shí)驗(yàn)是否可重復(fù)的問題說服力,我們認(rèn)為只有通過有效的自動(dòng)化才能解決這些問題搶抓機遇。

Opentrons: 您是如何將 OT-2 整合到您的實(shí)驗(yàn)室中的?

Yury Goltsev:  我們沒有花費(fèi) 25 萬美元購買市面上的全自動(dòng)染色機(jī)表示,而是購買了一臺(tái) 200 美元的 3D 打印機(jī)全面闡釋,它基本上可以完成同樣的工作,實(shí)現(xiàn) XYZ 工具定位的自動(dòng)化競爭力所在。但是貢獻法治,當(dāng)我們看到 OT-2 時(shí),我們認(rèn)為它是我們的理想選擇:它具備我們所需的功能發展需要,外觀漂亮攻堅克難,性價(jià)比高,而且我們可以將其與我們的設(shè)備整合到一起顯示。

Opentrons: 在使用 OT-2 之前雙向互動,您是否了解過其他自動(dòng)液體處理設(shè)備?

Nikolay Samusik:  不是很了解,但我們有具備編程知識(shí)品牌,OT-2 平臺(tái)具備獨(dú)特的開源性深入開展,所以我們可以使用Python 輕松地與 OT-2 交互和進(jìn)行開發(fā)。

Opentrons: 您的 OT-2 啟動(dòng)和運(yùn)行的情況如何等形式?

Yury Goltsev:  對(duì)我們來說技術的開發,OT-2 運(yùn)行體驗(yàn)非常好。OT-2 的優(yōu)點(diǎn)是它能夠支持至少三種方式與它互動(dòng)飛躍,例如 Jupyter notebooks更高效、SSH shell 和 Opentrons Python API 。而且讓我覺得了不起的一點(diǎn)是組成部分,協(xié)議是在設(shè)備上運(yùn)行的影響,而不是在電腦上運(yùn)行,所以如果電腦與機(jī)器人斷開連接或出現(xiàn)問題的過程中,設(shè)備仍然會(huì)繼續(xù)運(yùn)行協(xié)議發展契機。

Opentrons: 在設(shè)置您的 OT-2 時(shí),您遇到過什么困難嗎促進進步?

Yury Goltsev:? 我們發(fā)現(xiàn)發力,根據(jù) Opentrons?APP 的固件版本指引,初始校準(zhǔn)的過程可能會(huì)有點(diǎn)困難迎來新的篇章。但是Opentrons 的客戶支持團(tuán)隊(duì)一直以來都能做到快速響應(yīng)共創美好,幫助我們解決問題。綜合而言我們認(rèn)為這是一個(gè)非常出色的設(shè)備薄弱點,運(yùn)行過程非常順利覆蓋範圍,我們喜歡它。

Opentrons: 請(qǐng)與我們分享一下關(guān)于使用 OT-2 自動(dòng)化 FFPE 抗原修復(fù)的情況積極性。

Nikolay Samusik:  到目前為止奮勇向前,我們最大的成就之一是在 IHC 方案中自動(dòng)化 FFPE 抗原修復(fù)(一種需要精確高溫處理的表位去掩蔽步驟)。我們通過使用 Parhelia PAR2 設(shè)備與 Opentrons 溫度模塊 實(shí)現(xiàn)了這一點(diǎn)多元化服務體系。市場(chǎng)上很少有其他染色機(jī)能夠同時(shí)進(jìn)行熱處理和染色規劃,而大型儀器供應(yīng)商對(duì)于具備能單一儀器中實(shí)現(xiàn)抗原修復(fù)與抗體染色能力的設(shè)備收取的費(fèi)用會(huì)更高。OT-2 不一樣深度,它使我們能夠利用機(jī)載溫度模塊運(yùn)行溫度控制的實(shí)驗(yàn)帶動擴大,并為我們打開了全新的協(xié)議范圍,現(xiàn)在我們可以做高端自動(dòng)染色機(jī)可以做的一切開拓創新。

Opentrons: 告訴我們關(guān)于使用 OT-2 對(duì)實(shí)驗(yàn)液體進(jìn)行的一系列操作和處理的體驗(yàn)如何持續發展。

Yury Goltsev:  我們的設(shè)備非常精巧且易于攜帶,因此我們能夠?qū)⑺袞|西放入96孔板的板位(SBS板位)中促進善治,并使其與所有自動(dòng)化移液設(shè)備兼容供給。其次的方法,我們希望所有液體都放在盒子里實事求是,因?yàn)檫@有助于保持濕度并防止生物危害泄漏進行探討。對(duì)于危險(xiǎn)樣本,它們也完全可以使用我們的設(shè)備進(jìn)行密封服務水平,您可以做任何事情最新,并在需要時(shí)安全地丟棄盒子。我們相信這在處理高度傳染性疾蔡幚矸椒?。ㄈ鏑OVID-19)方面尤為重要重要作用。

Opentrons: 您目前對(duì)市場(chǎng)拓展有哪些愿景?

Yury Goltsev:  我們非沉晳T?春冒l(fā)展中國家市場(chǎng)充足,因?yàn)槲覀兊漠a(chǎn)品比其他自動(dòng)染色機(jī)便宜很多,實(shí)際上便宜了20 倍的積極性。對(duì)于非洲或拉丁美洲或任何研究預(yù)算緊湊的地方來說綠色化發展,這是一個(gè)很好的選擇。

Opentrons: 關(guān)于使用 OT-2不久前,您還有其他想跟大家分享的嗎用上了?

Nikolay Samusik: OT-2 和 Opentrons 給我們帶來了巨大的啟發(fā)。這家公司顛覆了液體處理市場(chǎng)能力建設,并且與我們想要顛覆自動(dòng)染色市場(chǎng)的方式不謀而合關註。大多數(shù)實(shí)驗(yàn)室沒有自動(dòng)化移液設(shè)備,正是因?yàn)樗麄兊念A(yù)算無法負(fù)擔(dān)無障礙,而且大部分自動(dòng)化移液設(shè)備都非常復(fù)雜且難以使用連日來。但我們使用了 OT-2 之后,實(shí)際經(jīng)驗(yàn)告訴我們 OT-2 與傳統(tǒng)的自動(dòng)化移液設(shè)備不一樣善於監督。

Yury Goltsev:?我們有一個(gè)宏偉的計(jì)劃集成技術。坦白說,我們的設(shè)備不僅僅是一個(gè)載玻片染色機(jī)至關重要。我們計(jì)劃將其與顯微鏡結(jié)合使用發展空間。例如,蓋玻片在染色組織以外的各種研究背景下都有使用有所應。我們的設(shè)備可以自動(dòng)處理排列在玻璃上的蛋白質(zhì)足了準備、DNA 或化學(xué)物質(zhì)。你可以放入任何需要層流液交換的樣本著力提升,然后讓我們的設(shè)備與 OT-2 一起為系統(tǒng)創(chuàng)建層流情況來處理它深刻內涵。Opentrons 為我們打開了無限可能。

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