謝菲爾德大學(xué)是英國(guó)極具影響力的研究型大學(xué)之一,建校歷史悠久範圍和領域,在 2022 QS 世界大學(xué)排名第 95 名簡單化。Oscar Swindley 是謝菲爾德大學(xué)化學(xué)與生物工程系博士力度,從事單克隆抗體折疊和組裝工作。他使用Opentrons OT-2 移液機(jī)器人進(jìn)行滴度測(cè)定以進(jìn)行細(xì)胞培養(yǎng)開(kāi)發(fā)系統性。今天他將為大家分享他對(duì) OT-2 的使用體驗(yàn)勇探新路。
Oscar Swindley 是謝菲爾德大學(xué)化學(xué)與生物工程系的博士生,合成生物學(xué)平臺(tái)開(kāi)發(fā)團(tuán)隊(duì)的一員傳遞。該實(shí)驗(yàn)室于2019年8月購(gòu)買了首臺(tái) Opentrons OT-2試驗,用于細(xì)胞培養(yǎng)開(kāi)發(fā)的滴度測(cè)定自動(dòng)化,Oscar 就是負(fù)責(zé)操作 OT-2 的深度用戶開展攻關合作。
Opentrons: 請(qǐng)介紹一下您的研究背景製度保障?
Oscar Swindley:?我從事的研究方向是單克隆抗體折疊和組裝過(guò)程的遺傳及化學(xué)操作,以及自動(dòng)化程序的優(yōu)化和集成的有效手段。我們使用 OT-2 在我們的實(shí)驗(yàn)室中執(zhí)行大量的細(xì)胞培養(yǎng)操作統籌推進。我剛剛完成了我們的第一個(gè)大型篩選項(xiàng)目方案,其中所有細(xì)胞培養(yǎng),轉(zhuǎn)染保護好,樣品收集和滴度測(cè)定都在 OT-2 上進(jìn)行組建。
Opentrons: 如何形容您在實(shí)驗(yàn)室的一天?
OS:?最近我正在處理在 OT-2 上完成的第一次大規(guī)模細(xì)胞培養(yǎng)篩選的結(jié)果特點。我一直在使用 OT-2 進(jìn)行滴度測(cè)定深刻變革。OT-2 支持并簡(jiǎn)化了整個(gè)流程。除此之外和諧共生,我的常規(guī)日常工作包括在搖瓶和孔板上進(jìn)行常規(guī)的細(xì)胞培養(yǎng)質生產力,以及在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行其他實(shí)驗(yàn)。
Opentrons: 您為什么選擇 OT-2先進的解決方案?
OS:?在我們的實(shí)驗(yàn)室引入 OT-2 的目的是提高我們平臺(tái)的可重復(fù)性。我們?cè)趯?shí)驗(yàn)室使用 24 孔和 96 孔板進(jìn)行高通量篩選創造更多。我們面臨的主要困難是轉(zhuǎn)染宣講活動,因?yàn)楫?dāng)我們以非常高的密度重新懸浮細(xì)胞時(shí),溶液會(huì)變得粘稠工藝技術,細(xì)胞會(huì)迅速沉降效率。我們需要準(zhǔn)確地把樣品分配到整個(gè)孔板上,以便在每個(gè)孔中種植相同數(shù)量的細(xì)胞產能提升。這是一個(gè)大量重復(fù)的過(guò)程適應性,且處理的液體體積非常小。我們面臨的最大問(wèn)題是如何在細(xì)胞隨著時(shí)間推移會(huì)逐漸沉降的情況下通過活化,始終保持液體充分混合并成功種植細(xì)胞落地生根。
Opentrons: 您具體使用 OT-2 做什么,它如何適應(yīng)您的工作流程健康發展?
OS:?我們使用 OT-2 來(lái)設(shè)置和運(yùn)行我們的96孔電轉(zhuǎn)染平臺(tái)有效保障,從多種培養(yǎng)板格式取樣,并執(zhí)行板基測(cè)定落實落細。特別是對(duì)于我們的電轉(zhuǎn)染平臺(tái)相結合,OT-2 將 DNA、緩沖液和細(xì)胞結(jié)合在一起製高點項目,然后將混合物分配到電轉(zhuǎn)染板中為產業發展。轉(zhuǎn)染后,OT-2 進(jìn)行稀釋有所增加、混合和為細(xì)胞提供養(yǎng)分各項要求,然后將其種入 24 孔培養(yǎng)板中。3 天后我們將用機(jī)器人對(duì)培養(yǎng)物進(jìn)行測(cè)定。這包括混合和從培養(yǎng)板取樣進(jìn)行各種下游測(cè)定新技術。最后共同學習,OT-2 能夠?qū)颖炯虞d到玻璃片上,用于我們的高通量細(xì)胞計(jì)數(shù)器深入,并收獲上清液進(jìn)行滴度分析效高。在最近的一組篩選實(shí)驗(yàn)中,OT-2 幫助我們進(jìn)行了 22 個(gè)電轉(zhuǎn)染板和相關(guān)的取樣基礎。OT-2 只需 20 分鐘就能運(yùn)行一次滴度分析性能,這太棒了。我可以全天讓機(jī)器人持續(xù)運(yùn)行對外開放。
Opentrons: 使用你們的 OT-2 開(kāi)始實(shí)驗(yàn)是什么感覺(jué)技術創新?
OS:?我編寫(xiě)第一個(gè)協(xié)議腳本大約花費(fèi)了 2 個(gè)月的時(shí)間。但是腳本一旦完成資料,所有的信息都在腳本里廣泛應用,我就可以快速地繼續(xù)進(jìn)行更復(fù)雜的實(shí)驗(yàn)。我把我的所有腳本都上傳到了我的 GitHub 頁(yè)面上新產品,如果有興趣的話去完善,大家都可以去看看。
Opentrons: 在使用 OT-2 之前長遠所需,您是否使用過(guò)其他實(shí)驗(yàn)室自動(dòng)化設(shè)備脫穎而出?
OS:?沒(méi)有。我以前使用過(guò) BioMek生產創效,并設(shè)置了 SOP。為了更好地對(duì) OT-2 進(jìn)行編程管理,我在 8 月至 11 月期間學(xué)習(xí)了 Python優化上下。
Opentrons: 您還有關(guān)于 OT-2 的其他體會(huì)要跟大家分享的嗎?
OS:?總體來(lái)說(shuō)這是一臺(tái)好設(shè)備模樣,但它沒(méi)有安全保障裝置生產體系,也就是說(shuō),它無(wú)法識(shí)別障礙物很重要,也無(wú)法意識(shí)到吸頭是否掉落能力和水平。我們現(xiàn)在遇到的問(wèn)題是如能能夠在故障發(fā)生時(shí)進(jìn)行追蹤。另一個(gè)困難是設(shè)備與 24 孔板的兼容性不強(qiáng)異常狀況,因此我不得不想辦法騙過(guò)它研究,方法是每隔一行取出吸頭。但是如果你知道如何編程控制機(jī)器人應用創新,你總是可以找到解決方案的提高。總的來(lái)說(shuō),我認(rèn)為它非常適合用于研究交流,在你的每次實(shí)驗(yàn)中你可以根據(jù)你的需求調(diào)整實(shí)驗(yàn)方案基礎。
經(jīng)驗(yàn)豐富的服務(wù)團(tuán)隊(duì)和強(qiáng)大的生產(chǎn)支持團(tuán)隊(duì)為客戶提供無(wú)憂的訂單服務(wù)。