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2019 年 03 月 04 日

開源在生物學中的力量 – DAMP 實驗室的 10,000 美元生物工廠

一個強大的生物工廠不需要數(shù)百萬美元的投資——經(jīng)濟實惠的開源工具讓每個實驗室都有可能實現(xiàn)這些功能。

DAMP 實驗室是波士頓大學生物設計中心內(nèi)一個初創(chuàng)的生物工廠。該實驗室僅使用不到 10,000 美元的開源軟件和硬件狀況,就為科學界提供了 30 種合成生物學方案(如DNA組裝等地、轉(zhuǎn)化、測序和質(zhì)粒純化等)著力增加,并以此收取服務費更加廣闊。任何科學家都可以通過訪問 DAMP 實驗室的網(wǎng)頁界面遠程指定實驗計劃新創新即將到來,其自動化系統(tǒng)能夠設計生產製造、構建和測試該計劃。

他們是如何做到的呢?

通過整合一系列開源工具綠色化,DAMP實驗室能夠快速開發(fā)一個復雜的系統(tǒng)不同需求,該系統(tǒng)能夠高效且優(yōu)雅地自動化執(zhí)行生物回路測試。其中一些關鍵的開源工具包括:

  • Cello 使用Verilog編程語言實現(xiàn)生物回路的自動化設計保持穩定。
  • Aquarium 用于實驗室信息管理系統(tǒng)(LIMS)總之,實現(xiàn)作業(yè)排隊和庫存管理。
  • Opentrons 的OT-2移液機器人:用于自動化DNA組裝支撐作用、轉(zhuǎn)化和其他許多方案研學體驗。

您可以在 Synbiobeta 博客上了解更多關于 DAMP 實驗室技術堆棧的信息。

為什么DAMP實驗室的生物工廠和開源技術如此重要最為突出?

DAMP實驗室在視頻中談到了開源技術和它賦予的能力落實落細。

該項目展示了開源軟件和硬件在實驗室中的力量。如果手動執(zhí)行所有這些過程高效化,DAMP實驗室需要一周時間來設計製高點項目、構建和測試10個基因回路。通過在開源技術上投入相對較少的資金範圍和領域,DAMP實驗室的吞吐量提高了10倍有所增加。

結(jié)果就是,DAMP實驗室能夠用相同的設施和團隊執(zhí)行10倍的實驗更高要求。開源工具提高了生產(chǎn)效率越來越重要的位置,大大降低了執(zhí)行復雜實驗的成本。

一個強大的生物工廠不需要數(shù)百萬美元的投資——經(jīng)濟實惠的開源工具讓每個實驗室都有可能實現(xiàn)這些功能共同學習。

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