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Opentrons Flex 自動化移液工作站24 小時全程自動化輕鬆製備高達 384 個質(zhì)粒文庫

簡介高通量基因組分析是生命科學研究中不可或缺的重要工具,這項技術(shù)在推動科研進步方面發(fā)揮著至關(guān)重要的作用充足。為了滿足了科學研究領域?qū)Ω咝滓蝿?、準確製備方法的迫切需求創新科技,seqWell 的 Express Plex?Library Kit 提供了一種專門用於高通量製備質(zhì)粒和擴增子文庫的解決方案。在傳統(tǒng)的手工製備文庫方法中重要意義,完成 96 個樣品的製備需要花費長達 90 分鐘的時間基礎,其中手動操作時間佔據(jù)了 30 分鐘。這種方式不僅效率低下,還容易因為人為因素而引入誤差管理。為了改善此一狀況優化上下,本文比較了兩種文庫製備方法,一種是在 Opentrons Flex? 移液工作站上使用seqWell ExpressPlex? Library Kit 模樣,另一種是手工製備文庫生產體系。透過結(jié)合 Flex 移液工作站與 seqWell ExpressPlex? Library Kit,我們可以大幅縮短文庫製備時間很重要,提高樣本通量能力和水平。這種自動化的解決方案不僅提升了製備效率覆蓋,也降低了人為誤差的風險,為生命科學研究提供了更可靠研究、更有效率的工具高效。 材質(zhì)與方法ExpressPlex 工作流程:根據(jù) Express Plex 的工作流程,我們在 Flex 自動化移液工作站上進行文庫製備提高。實驗過程中機構,我們輸入16 ng 的 pUC19 ,再將所有組分加入反應板 空白區, 用 3000 rpm 的轉(zhuǎn)速混勻 90 秒協調機製,然後進行後續(xù)的文庫製備和混合步驟。最終的文庫在 NextSeq 2000 定序儀上進行 2X150 bp 定序形勢。

ExpressPlex 工作流程

圖1.A ) Express Plex 工作流程包括將index 和DNA 加入反應板(已含有酵素等混合物)實踐者,然後進行擴增、混合和MAGwise 磁珠純化約定管轄;B ) Flex 工作站包括吸頭盒數據、模組、轉(zhuǎn)板抓手和其他配件業務指導;C ) Flex 工作站板位設置改進措施,用於在擴增後將4 個反應板進行文庫混合。

結(jié)果

Opentrons Flex顯示結(jié)果

圖2 . A ) 結(jié)果顯示96 孔板中文庫數(shù)據(jù)變異係數(shù)( CV )為12.7%長足發展; B ) 95% 的文庫數(shù)據(jù)通過了數(shù)據(jù)預處理今年,為高質(zhì)量數(shù)據(jù),且超過90% 文庫質(zhì)量得分達到Q30結構不合理; C ) 由Flex 製備的文庫比手動製備的文庫濃度更高動手能力。

獨立的 96 混 1 文庫

圖 3 . 利用錯開的開始時間,可以在 Opentrons FlexTM 上 3 小時內(nèi)製備 8 個獨立的 96 混 1 文庫意見征詢。在 Flex 上設定第一塊反應板後提升,可以在 24 小時內(nèi)完成 768 個文庫的製備。

結(jié)論在 Flex 移液平臺上製備的 96 個 pUC19 質(zhì)粒樣本文庫呈現(xiàn)出了高度均一的質(zhì)量的必然要求,充分證明了 Flex平臺在自動化文庫製備方面的卓越性能研究成果。與手動製備相比,自動化文庫製備不僅穩(wěn)定性較佳完善好,而且文庫濃度更高大面積。此外,超過95%的讀取成功通過定序儀質(zhì)檢 PF問題分析,這進一步驗證了自動化製備流程的高效率和準確性培養。 Flex 移液工作站支援在單次運行中處理多達 384 個樣本,大大提高了樣本處理效率。透過合理安排時間形式,我們甚至可以在 24 小時內(nèi)處理高達 768 個樣本建設應用,從而滿足大規(guī)模高通量基因組分析的需求。在 Flex 平臺上自動化 ExpressPlex? Library Prep Kit 工作流程日漸深入,我們實現(xiàn)了從提取的質(zhì)粒/擴增子 DNA 到資料生成的全流程自動化動力。這個解決方案不僅簡化了操作步驟,降低了人為誤差傳承,而且顯著提高了實驗效率和數(shù)據(jù)質(zhì)量等特點,為生命科學研究領域的發(fā)展注入了新的動力。

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