冠狀病毒大流行為生命科學(xué)研究人員提供了前所未有的機(jī)會(huì)。以下 9 種資源可協(xié)助您最大限度地利用這些機(jī)會(huì)最為顯著。冠狀病毒大流行改變了生命科學(xué)的格局推動，消耗了近期的大部分研究機(jī)會(huì)。但它也為研究人員提供了前所未有的合作調整推進、創(chuàng)新和創(chuàng)造新知識(shí)的機(jī)會(huì)。

前所未有的機(jī)會(huì)帶來(lái)了前所未有的資源——其中許多資源都是免費(fèi)使用的。從 Slack 頻道到 SOP選擇適用，這裡有 9 種工具可以幫助任何希望建立測(cè)試實(shí)驗(yàn)室高效利用、優(yōu)化工作流程或以其他方式參與這個(gè)全球科學(xué)計(jì)畫(huà)的研究人員特征更加明顯。

全球 Slack 頻道

來(lái)自全球各地的 13,000 多名研究人員參加了此次討論，這是全球關(guān)於擴(kuò)大 COVID-19 測(cè)試規(guī)模的最大討論講理論。它充滿了協(xié)作討論的可能性，涉及從排除 RNA 提取工作流程故障和確定供應(yīng)商到克服樣品和供應(yīng)鏈物流以及向 FDA 申請(qǐng)緊急使用授權(quán)等所有方面。您也可以加入對(duì)話服務為一體；只需點(diǎn)擊上面的連結(jié)並發(fā)送電子郵件至 [email protected] 即可獲得 24 小時(shí)邀請(qǐng)問題。

彈出式偵測(cè)實(shí)驗(yàn)室藍(lán)圖

創(chuàng)新基因組學(xué)研究所 (IGI) 提供了有關(guān)如何建立 CLIA 認(rèn)證的 SARS-CoV-2 檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室的詳盡指南。 IGI 是加州大學(xué)柏克萊分校和加州大學(xué)舊金山分校的研究人員團(tuán)隊(duì)全會精神，他們組建了一支多元化系統穩定性、跨學(xué)科的團(tuán)隊(duì)，晝夜不停地工作了 3 週集中展示，以擴(kuò)大灣區(qū)的冠狀病毒檢測(cè)規(guī)模實力增強。他們的指南包括從特定自動(dòng)化工作流程和協(xié)議到人員培訓(xùn)和合規(guī)指南等各方面的提示。

學(xué)術(shù)合作診斷實(shí)驗(yàn)室的標(biāo)準(zhǔn)作業(yè)程序 (SOP)

克里克 COVID19 聯(lián)盟提供了有關(guān)他們?nèi)绾卧趯W(xué)術(shù)環(huán)境中與外部合作夥伴一起創(chuàng)建診斷實(shí)驗(yàn)室的逐步指南宣講手段≈匾ぞ?？死锟?COVID19 聯(lián)盟與倫敦大學(xué)學(xué)院醫(yī)院、健康服務(wù)實(shí)驗(yàn)室 (HSL)配套設備、癌癥研究所和弗朗西斯克里克研究所合作更優質，在短短兩週多的時(shí)間內(nèi)創(chuàng)建了這項(xiàng)測(cè)試設(shè)定。他們的可下載指南涵蓋了從實(shí)驗(yàn)室安全資訊和 2 類樣本滅活指南到 RNA 萃取方案和製作自製緩衝液的所有內(nèi)容引人註目。

臨床研究定序測(cè)試平臺(tái)

Broad Institute 開(kāi)放了有關(guān)其針對(duì) SARS-CoV-2 的臨床研究定序平臺(tái) (CRSP) 的存取權(quán)限領域。 Broad Institute 是麻省理工學(xué)院 (MIT) 和哈佛大學(xué)研究人員之間的合作，它使用他們的平臺(tái)運(yùn)行即時(shí)逆轉(zhuǎn)錄酶 (RT)-PCR 診斷檢測(cè)好宣講。對(duì)於任何尋找測(cè)試設(shè)施的研究人員註入新的動力，Broad Institute 都開(kāi)放了他們的設(shè)施。他們的說(shuō)明包括標(biāo)本收集和運(yùn)輸指南，以及針對(duì)患者和提供者的診斷測(cè)試和檢測(cè)情況說(shuō)明書(shū)的常見(jiàn)問(wèn)題解答雙重提升。

基因組工程工具

Synthego 為基因組學(xué)研究人員提供了一系列工具，以提高 COVID-19 診斷和治療的速度和有效性。這些工具包括用於 RNA 收集的客製化 Cas13 指南和針對(duì)與 SARS-CoV-2 蛋白相互作用的 330 個(gè)人類基因的多陣列 CRISPR sgRNA 基因敲除文庫(kù)表現明顯更佳。他們的網(wǎng)站上有所有這些工具的鏈接狀態，以及他們用於創(chuàng)建這些工具的已發(fā)布測(cè)試數(shù)據(jù)。

SwabSeq 測(cè)試概念驗(yàn)證

Octant 的 SwabSeq NGS 診斷工作流程概念驗(yàn)證指導。 Octant 是一家生物技術(shù)公司廣泛認同，使用專有技術(shù)結(jié)合合成生物學(xué)、基因組工程流動性、下一代定序和計(jì)算工具鍛造，創(chuàng)建了一種協(xié)議來(lái)擴(kuò)大基於 COVID19 序列的測(cè)試，該協(xié)議簡(jiǎn)單持續創新、便宜且靈敏改善。 它被稱為 SwabSeq，他們的實(shí)驗(yàn)室筆記文件包括從協(xié)議和測(cè)試程式碼到資料圖表和內(nèi)部筆記本的所有內(nèi)容合理需求。

大規(guī)模平行診斷測(cè)定概念驗(yàn)證

賓州州立大學(xué)合成生物學(xué)研究員 Howard Salis 的大規(guī)模平行 NGS 診斷測(cè)定概念驗(yàn)證是目前主流。 Salis 發(fā)表了一份預(yù)印本充分發揮，詳細(xì)介紹了大規(guī)模平行診斷測(cè)定(MPDA) 如何利用次世代定序在一次測(cè)定中同時(shí)進(jìn)行數(shù)千次病毒RNA 測(cè)量高質量，並在每個(gè)工作流程中處理多達(dá)19,200 個(gè)患者樣本。他的預(yù)印本詳細(xì)介紹了他的工作流程選擇適用，結(jié)合了病毒RNA 提取管理、使用具有獨(dú)特條碼的患者特異性引子的逆轉(zhuǎn)錄酶(RT) 以及單池聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)，然後進(jìn)行下一代測(cè)序(NGS)業務指導。

行動(dòng)測(cè)試實(shí)驗(yàn)室

OpenCell 的大量藍(lán)圖改進措施、協(xié)定和其他資源。 OpenCell 是一家為生物技術(shù)新創(chuàng)公司提供移動(dòng)長足發展、經(jīng)濟(jì)實(shí)惠的貨櫃實(shí)驗(yàn)室空間的公司今年，在英國(guó)測(cè)試領(lǐng)域處?kù)额I(lǐng)先地位，正在迅速擴(kuò)展高通量測(cè)試