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NGS自動(dòng)化建庫是指利用自動(dòng)化技術(shù)和設(shè)備足夠的實力,對(duì)DNA或RNA樣本進(jìn)行高通量自然條件、高效率行動力、高精度的文庫建構(gòu)過程精準調控。這個(gè)過程涵蓋了從樣本處理、DNA/RNA提取適應性、文庫建構(gòu)到品管等多個(gè)環(huán)節(jié)各項要求,旨在減少人工操作不斷創新,並提高實(shí)驗(yàn)效率和準(zhǔn)確性。
一綠色化、樣本準(zhǔn)備與DNA/RNA萃取
1不同需求、樣本收集:收集目標(biāo)樣本,如細(xì)胞拓展、組織創造更多、血液等,確保樣本的完整性和代表性不斷進步。
2.樣本處理:依樣本類型選擇適當(dāng)?shù)奶幚矸椒üに嚰夹g,如?xì)胞裂解、組織研磨等生產效率,以釋放DNA或RNA產能提升。
3.DNA/RNA萃取:採用適當(dāng)?shù)妮腿》椒ǎㄈ绶勇确路ü濣c、磁珠法通過活化、柱法等)從樣本中純化出高品質(zhì)的DNA或RNA。
二的特點、文庫構(gòu)建
文庫建置是NGS自動(dòng)化建庫的核心步驟健康發展,通常包括以下子步驟:
1、DNA/RNA片段化:
1>將DNA或RNA分子切割成較小的片段大數據,以便進(jìn)行後續(xù)的定序反應(yīng)長效機製。片段化可以透過物理方法(如超音波破碎)或化學(xué)方法來實(shí)現(xiàn)。
2>片段大小通常在100-1000鹼基對(duì)之間數字技術,取決於定序平臺(tái)和實(shí)驗(yàn)需求奮戰不懈。
2市場開拓、末端修復(fù)和加A尾:
1>對(duì)片段化的DNA或RNA進(jìn)行末端修復(fù),以去除末端損傷並添加磷酸基團(tuán)和3’末端A尾大大縮短。這些修復(fù)步驟有助於後續(xù)的連接適配體和文庫擴(kuò)增要落實好。
3、連接適配體:
1>將經(jīng)過修復(fù)的DNA或RNA片段連接到特定的適配體(也稱為接頭)更默契了。適配體是含有特定序列的DNA或RNA片段先進技術,用於後續(xù)的PCR擴(kuò)增和定序反應(yīng)。
2>在自動(dòng)化建庫過程中不合理波動,此步驟通常透過自動(dòng)化的移液和連接反應(yīng)來實(shí)現(xiàn)深入。
4、文庫擴(kuò)增:
1>透過PCR擴(kuò)增將連接了適配體的DNA或RNA片段擴(kuò)增至足夠數(shù)量前沿技術,以形成可用於定序的資料庫基礎。
2>擴(kuò)增過程中使用具有適配體序列的引子進(jìn)行特異性擴(kuò)增。
三多種方式、文庫品控
文庫品管是確保文庫品質(zhì)和定序結(jié)果可靠性的重要步驟對外開放。常用的文庫品管方法包括:
1.定量PCR:用於檢測(cè)文庫的濃度及擴(kuò)增效率。
2.聚丙烯醯胺凝膠電泳:用於評(píng)估文庫片段的大小分佈深入交流研討。
3.質(zhì)譜分析:用於進(jìn)一步驗(yàn)證文庫的品質(zhì)和純度資料。
四、功能:
1.自動(dòng)化操作:透過自動(dòng)化設(shè)備實(shí)現(xiàn)樣本處理關註度、文庫建置等步驟的自動(dòng)化新產品,減少人工幹預(yù)。
2.提高效率:自動(dòng)化流程縮短了實(shí)驗(yàn)週期橋梁作用,提高了實(shí)驗(yàn)效率長遠所需。
3.降低誤差:減少人為操作帶來的誤差,提高實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確度與穩(wěn)定性讓人糾結。
經(jīng)驗(yàn)豐富的服務(wù)團(tuán)隊(duì)和強(qiáng)大的生產(chǎn)支援團(tuán)隊(duì)為客戶提供無憂的訂單服務(wù)規模。