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2021 年 22 月 18 日

Opentrons 客戶訪談 | 生技公司Parhelia Bio

本期客戶訪談將為大家介紹一家正在顛覆自動化染色產(chǎn)業(yè)的生物技術(shù)公司Parhelia Bio讓人糾結,他們使用Opentrons創(chuàng)造了一臺靈活且價格實惠的玻片和蓋玻片染色設(shè)備。

生技公司Parhelia Bio 的共同創(chuàng)辦人Nikolay Samusik 和 Yury Goltsev 開發(fā)了一個插件模組(並已獲得專利)明確了方向。這個模組可將任何自動化移液平臺轉(zhuǎn)變?yōu)轱@微鏡樣本的自動染色機(jī)∮浀美?,F(xiàn)在力量,他們使用Opentrons OT-2 自動化移液平臺和Opentrons Python 協(xié)議API 來自動化常規(guī)免疫螢光持續發展、Akoya 的CODEX 以及IHC 與FFPE 樣本上的抗原恢復(fù)等染色方案優勢與挑戰。

Opentrons: 你們是如何想到讓 Parhelia 設(shè)備使用液體處理器自動染色載玻片這個想法的經驗分享?

Nikolay Samusik:  Parhelia PAR2 設(shè)備的想法和需求源於我們在史丹佛大學(xué) Garry Nolan 實驗室進(jìn)行的研究,當(dāng)時我們正在研究一種名為 CODEX 的超高多重發(fā)現(xiàn)組織染色方案趨勢。 CODEX 及其臨床級高通量夥伴OPAL 目前由我們創(chuàng)立的另一家公司- Akoya Biosciences 進(jìn)行分銷有力扭轉。

Yury Goltsev: 在開發(fā)CODEX、OPAL 和其他先進(jìn)的組織染色方法的過程中設備製造,我們了解到像RNA FISH 和多重IHC 這樣的複雜方案雖然對我們這些開發(fā)人員來說很容易發展需要,但對使用者來說卻很困難,學(xué)習(xí)曲線可能相當(dāng)高管理。多步驟處理需要花費很多時間顯示,根據(jù)抗體/探針的孵育時間,整個程序很容易需要超過一天的時間效率和安,而且對於新手學(xué)生和經(jīng)驗豐富的技術(shù)人員來說勃勃生機,很難避免手動移液錯誤。我們意識到我們需要一種特殊的設(shè)備來自動化染色極致用戶體驗,但是市面上大部分自動化的起始價超過 15 萬美元提供有力支撐,我們實驗室負(fù)擔(dān)不起。我們也找不到可以處理蓋玻片的自動染色機(jī)——就是 CODEX 中使用的平面支撐介質(zhì)建議。

Opentrons: 為什麼組織染色如此困難品率?

Yury Goltsev: 因為在組織染色過程中,多步驟的處理和學(xué)習(xí)新的染色方案需要大量的實踐和努力不斷發展。要運行涉及大量組織樣本處理的調(diào)查項目積極影響,您必須擁有一個專職的技術(shù)人員(或甚至一個技術(shù)團(tuán)隊)勤勉地遵循所有步驟進(jìn)行操作。一個處理複雜的多色染色的博士後將花費大部分時間在實驗臺上,沒有時間閱讀和分析數(shù)據(jù)越來越重要。這導(dǎo)致了許多不必要的體力勞動線上線下,並導(dǎo)致了實驗是否可重複的問題,我們認(rèn)為只有透過有效的自動化才能解決這些問題醒悟。

Opentrons: 您是如何將 OT-2 整合到您的實驗室中的數據顯示?

Yury Goltsev:  我們沒有花費25 萬美元購買市面上的全自動染色機(jī),而是購買了一臺200 美元的3D 列印機(jī)也逐步提升,它基本上可以完成相同的工作記得牢,實現(xiàn)XYZ 工具定位的自動化。但是不可缺少,當(dāng)我們看到 OT-2 時蓬勃發展,我們認(rèn)為它是我們的理想選擇:它具備我們所需的功能,外觀漂亮積極回應,性價比高重要性,而且我們可以將其與我們的設(shè)備整合到一起。

Opentrons: 在使用 OT-2 之前多種場景,您是否了解其他自動液體處理設(shè)備多元化服務體系?

Nikolay Samusik:  不是很了解,但我們有具備程式設(shè)計知識擴大公共數據,OT-2 平臺具備獨特的開源性深度,所以我們可以使用Python 輕鬆地與 OT-2 互動和進(jìn)行開發(fā)。

Opentrons: 您的 OT-2 啟動和運作的情況如何核心技術體系?

Yury Goltsev:  對我們來說開拓創新,OT-2 運作體驗非常好。 OT-2 的優(yōu)點是它能夠支援至少三種方式與它互動應用提升,例如Jupyter notebooks主動性、SSH shell 和 Opentrons Python API 。而且讓我覺得了不起的一點是發展的關鍵,協(xié)議是在設(shè)備上運行的道路,而不是在電腦上運行,所以如果電腦與機(jī)器人斷開連接或出現(xiàn)問題真諦所在,設(shè)備仍然會繼續(xù)運行協(xié)議指導。

Opentrons: 在設(shè)定您的 OT-2 時,您遇到過什麼困難嗎充分?

Yury Goltsev:  我們發(fā)現(xiàn)進一步完善,根據(jù) Opentrons APP 的韌體版本指引,初始校準(zhǔn)的過程可能會有點困難競爭力。但Opentrons 的客戶支援團(tuán)隊一直以來都能快速回應(yīng)調整推進,幫助我們解決問題發展基礎。綜合而言我們認(rèn)為這是一個非常出色的設(shè)備,運行過程非常順利建強保護,我們喜歡它。

Opentrons: 請與我們分享一下關(guān)於使用 OT-2 自動化 FFPE 抗原修復(fù)的情況國際要求。

Nikolay Samusik:  到目前為止情況正常,我們最大的成就之一是在 IHC 方案中自動化 FFPE 抗原修復(fù)(一種需要精確高溫處理的抗原表位去掩蔽步驟)重要作用。我們透過使用 Parhelia PAR2 設(shè)備與 Opentrons 溫度模組 實現(xiàn)了這一點。市面上很少有其他染色機(jī)能夠同時進(jìn)行熱處理和染色合規意識,而大型儀器供應(yīng)商對於具備能單一儀器中實現(xiàn)抗原修復(fù)與抗體染色能力的設(shè)備收取的費用會更高。 OT-2 不一樣有效性,它使我們能夠利用機(jī)載溫度模組運行溫度控制的實驗創新內容,並為我們打開了全新的協(xié)議範(fàn)圍,現(xiàn)在我們可以做高端自動染色機(jī)可以做的一切廣泛關註。

Opentrons: 告訴我們關(guān)於使用 OT-2 對實驗液體進(jìn)行的一系列操作和處理的體驗如何善於監督。

Yury Goltsev:  我們的設(shè)備非常精巧且易於攜帶,因此我們能夠?qū)⑺袞|西放入96孔板的板位(SBS板位)中就能壓製,並使其與所有自動化移液設(shè)備兼容更合理。其次,我們希望所有液體都放在盒子裡更優美,因為這有助於保持濕度並防止生物危害洩漏各方面。對於危險樣本,它們也完全可以使用我們的設(shè)備進(jìn)行密封優勢,您可以做任何事情善謀新篇,並在需要時安全地丟棄盒子。我們相信這在處理高度傳染性疾脖憷?。ㄈ鏑OVID-19)方面尤其重要方法。

Opentrons: 您目前對市場拓展有哪些願景?

Yury Goltsev:  我們非骋幠W畲??春冒l(fā)展中國家市場穩中求進,因為我們的產(chǎn)品比其他自動染色機(jī)便宜很多,實際上便宜了20 倍最深厚的底氣。對於非洲或拉丁美洲或任何研究預(yù)算緊湊的地方來說協同控製,這是一個很好的選擇。

Opentrons: 關(guān)於使用 OT-2品質,您還有其他想跟大家分享的嗎利用好?

Nikolay Samusik: OT-2 和 Opentrons 為我們帶來了巨大的啟發(fā)。這家公司顛覆了液體處理市場解決問題,並且與我們想要顛覆自動染色市場的方式不謀而合系列。大多數(shù)實驗室沒有自動化移液設(shè)備作用,正是因為他們的預(yù)算無法負(fù)擔(dān),而且大部分自動化移液設(shè)備都非常複雜且難以使用慢體驗。但我們使用了 OT-2 之後著力增加,實際經(jīng)驗告訴我們 OT-2 與傳統(tǒng)的自動化移液設(shè)備不一樣。

Yury Goltsev: 我們有一個宏偉的計劃科技實力。坦白說處理,我們的設(shè)備不只是一個載玻片染色機(jī)。我們計劃將其與顯微鏡結(jié)合使用在此基礎上。例如助力各行,蓋玻片在染色組織以外的各種研究背景下都有使用。我們的設(shè)備可以自動處理排列在玻璃上的蛋白質(zhì)自主研發、DNA 或化學(xué)物質(zhì)確定性。你可以放入任何需要層流液交換的樣本,然後讓我們的裝置與 OT-2 一起為系統(tǒng)建立層流情況來處理它損耗。 Opentrons 為我們打開了無限可能講故事。

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