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2020 年 27 月 22 日

客戶訪談 | Fidabio 產(chǎn)品軟體與 OT-2 Python API 整合案例

Fidabio 使用 OT-2 和 Opentrons Python Protocol API 創(chuàng)建了分析蛋白質(zhì)相互作用的設備,用於生物藥物開發(fā)。

Fidabio是一家由哥本哈根大學的研究人員創(chuàng)立的生物技術(shù)公司,坐落於丹麥需求,核心業(yè)務是幫助科學研究工作者推進複雜的生物學項目不斷完善,例如多重結(jié)合蛋白、脂質(zhì)體全面協議、外泌體和雙特異性研究項目能力建設。 Fidabio發(fā)明的FIDA技術(shù)可在天然條件下對蛋白質(zhì)和奈米顆粒進行簡單關註、準確和快速的檢測和表徵。

今天我們採訪的是 Fidabio 的 CEO Brian S?rensen 和 CSO Henrik Jensen無障礙。為了創(chuàng)建一臺用於分析生物藥物開發(fā)過程中的蛋白質(zhì)間相互作用的設備連日來。他們使用了Opentrons OT-2 自動化移液機器人Opentrons Python API 以及他們自己的軟體整合創(chuàng)建了用於樣品製備的複雜稀釋工作流程。 Brian S?rensen 和 Henrik Jensen 會為大家分享他們的 OT-2 的使用體驗認為。

Opentrons: 請您介紹一下您的研究背景系統。

Brian S?rensen: 我們一直在哥本哈根大學工作,直到去年年底重要意義。

Henrik Jensen: 在大學裡交流等,我們使用OT-2自動化移液平臺進行樣品製備工作流程中的梯度稀釋工作。我認為 OT-2 自動化帶來的便利性有助於在實驗室內(nèi)進行整體整合規劃。

Opentrons: 您的研究計畫是什麼樣的提高?

Brian S?rensen: 我們的內(nèi)部試驗通常是小型實驗,手動移液也是可以滿足的進入當下。但是紮實,當我們的客戶需要進行大型實驗時,讓技術(shù)人員僅靠提升手動移液速度來實現(xiàn)是不可行的新體系。機器人可以取代人工移液投入力度,科學研究人員可以把這些時間省下來用來做實驗分析。一旦實驗涉及更大的稀釋系列,或需要分裝更多樣品時貢獻法治,就需要用到自動化全技術方案。我舉一個例子,我有一個客戶分析了附近醫(yī)院的數(shù)千個病患樣本共享,這麼大批量的操作是需要透過自動化來實現(xiàn)的。

Opentrons: 為什麼選擇 OT-2經驗分享?

Brian S?rensen: 我們購買了獨立的液體處理機器人解決方案,但很快就發(fā)現(xiàn)我們可以將其與我們自己的軟體整合。

Henrik Jensen: 自動化的優(yōu)點我認為有以下幾點:第一有力扭轉,可以幫助我們處理大量的樣本上高質量。第二,在實驗室工作中廣度和深度,準確性也很重要深入交流。如果您能以標準化的方式進行工作,自動化有利於改善結(jié)果加強宣傳。

Brian S?rensen: 可重複性是關鍵臺上與臺下,您在實驗室中人為因素越高,則可重複性就越低技術發展。

Henrik Jensen: 第三集聚效應,如果您可以使用機器人,在整個工作流程中我們對操作員在知識和技能層面的要求將變得更小重要手段。

Brian S?rensen: 如果您只是做一些常規(guī)分析互動講,那麼您可以手動完成所有工作。但這可能不是進行整個檢測的最佳方式像一棵樹,且無法更好地發(fā)揮技術(shù)人員的最大價值過程中。

Henrik Jensen: 使用自動化移液平臺,您可以更輕鬆地記錄您的研究能運用,因為您可以共享移液腳本達到,研究人員可以重現(xiàn)數(shù)據(jù)。自動化能夠詳細呈現(xiàn)您的下一步操作以及歷史操作不可缺少。

Brian S?rensen: 如果您想將您的實驗從實驗室轉(zhuǎn)移到另一個實驗室智慧與合力,並且實驗中有手動步驟 —

Henrik Jensen: —自動化要容易得多。這個因素也是我們將製備環(huán)節(jié)甚至整個工作流程變成自動化的根本原因之一重要的角色。

Brian S?rensen: 最初整合OT-2時開放要求,我們認為它是一個不錯的小眾應用。但是平臺建設,當我們看到更多客戶也有興趣將 OT-2 作為其 Fidabio 工作流程的一部分服務機製。我們可以在軟體中看到無縫整合更多實驗室的可能性。於是我們就把Fidabio的軟體和Opentrons連接在一起。

Opentrons 整合到 Fidabio 的軟體平臺上大幅拓展。 圖片來源:Fidabio

Opentrons: 您的OT-2的實際使用體驗如何去創新?

Henrik Jensen: 從硬體的角度來看,它即插即用緊迫性,非常方便結構。不過在協(xié)議方面還是有一些需要我們學習的地方,但其實這也不難高效。我們的軟體工程師 Morten 自己編寫了腳本溝通協調。腳本的創(chuàng)建實際上非常簡單。

Brian S?rensen: OT-2 可以無縫融入我們的工作流程體系。它簡化了生成結(jié)合曲線的工作保障性。我們把大量重複移液的工作交給機器人完成而不是佔用技術(shù)人員的時間,節(jié)省了人力成本和時間成本責任製。同時 OT-2 這非常適合我們的系統(tǒng)以及其他自動化實驗室系統(tǒng)十分落實。它是一個端到端的自動化工作流程。

Henrik Jensen: 我們之前沒有這方面的經(jīng)驗規則製定。但是製造業,由於我們自己也是儀器開發(fā)人員,我們已經(jīng)對這個過程已經(jīng)有了很好的理解關規定。

Opentrons: 在購買OT-2之前新格局,您使用過其他實驗室自動化設備嗎?您對實驗室自動化的流程有什麼期望安全鏈?

Brian S?rensen: 當我們開發(fā)自己的平臺時顯示,高度自動化對我們來說很重要。從這個意義上說真正做到,OT-2 很好地增強了我們自己的一個關鍵賣點科普活動。它與我們自己平臺中的關鍵元素之一非常吻合。

Opentrons: 您使用 OT-2 的特定用途是什麼強化意識,以及它如何融入您的工作流程長期間?

Brian S?rensen: 對我們來說,我們銷售的儀器必須非常精確現場。我們知道我們的技術(shù)有能力提供非常準確的數(shù)據(jù)高端化,但在生物學界,即使是很小的變化也會影響結(jié)果我有所應。尤其是我們使用的應用程式(例如藥物研發(fā))提單產,我們必須確保我們盡可能多地控制實驗。為保障更好的實驗產(chǎn)出嚴格控制準備過程至關重要。

Henrik Jensen: 在我們整合之前精準調控,我們有一個分析開發(fā)合作夥伴,它允許我們將資訊輸入系統(tǒng),系統(tǒng)會計算出您需要什麼來製作解決方案解決。以前我們是手動進行的預期。但接下來我們會用OT-2製作腳本,而不是手動進行幅度。

Opentrons: 您是否有其他自動化項目的計畫結構?

Brian S?rensen: 我們一直在尋找進一步的發(fā)展。雖然我們公司還年輕貢獻,但我們正在快速發(fā)展期規模最大,未來可能會嘗試更多的整合和開發(fā)專案。

Opentrons: 關於使用 OT-2防控,您還有其他想分享的嗎?

Henrik Jensen: 開放性以及與多個平臺整合的能力是 Opentrons 產(chǎn)品的一個非常重要的優(yōu)勢適應性。

Brian S?rensen: 我們已經(jīng)與 Opentrons 的產(chǎn)品開發(fā)團隊討論了我們產(chǎn)品之間進一步整合的方式堅實基礎,以便為我們的客戶提供無縫銜接的工作流程並提高用戶效率。這個需求目前在市場上需求量很大重要作用。我們在客戶中看到的趨勢是:他們對量化和準確性的需求與日俱增等地;且越複雜的實驗室工作流程,要求就越多…而且消除錯誤來源的需求也越大尤為突出。實驗室自動化的驅(qū)動力不是自動化本身規定,而是它可以提供最高品質(zhì)的實驗數(shù)據(jù)。

Henrik Jensen: 自動化不僅僅是為了創(chuàng)造實驗室更便宜空間載體、更容易使用的產(chǎn)品高質量。我們必須考慮如何實現(xiàn)自動化的方法,必須考慮整個實驗過程重要組成部分。

Brian S?rensen: 生技公司長期以來一直在努力解決這個問題流程。客戶正在尋找可以幫助他們做出決定的東西勃勃生機。他們能盡快找到解決方案助力各業,他們的開發(fā)過程就越有效率。這是過程中的一個重要突破提供有力支撐。

點這裡下載Fidabio 的軟體說明Opentrons集成資訊應用。

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