Carlos Goller 使用 Opentrons 系列設(shè)備主動性，包括 OT-2解決、開(kāi)源 API、磁性模組和熱循環(huán)模組助力各業，在北卡羅來(lái)納州立大學(xué)教授生物技術(shù)和分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室課程經驗分享。

本期我們?cè)L談的客戶Carlos C. Goller 是< a >北卡羅來(lái)納州立大學(xué)(NCSU)生物科學(xué)系副教授，為本科生和研究生教授生物技術(shù)全面協議。他在生物技術(shù)和分子實(shí)驗(yàn)室課程中，使用到了 Opentrons OT-2 自動(dòng)化移液機(jī)器人具體而言、溫控模組工具、磁性模組和熱循環(huán)模組等進(jìn)行教學(xué)。本期 Carlos 將為我們分享他的使用體驗(yàn)喜愛。

Opentrons: 請(qǐng)簡(jiǎn)單介紹一下您的研究背景重要的角色。

Carlos Goller: 我是北卡羅來(lái)納州立大學(xué)生物技術(shù)計(jì)畫(huà)的助理教授，也是一名微生物學(xué)家向好態勢，本科時(shí)還在馬薩諸塞州的一所小型工程學(xué)校學(xué)習(xí)了電腦建模平臺建設。我在埃默里大學(xué)獲得了微生物學(xué)和分子遺傳學(xué)博士學(xué)位。博士生學(xué)習(xí)期間貢獻力量，我在研究大腸桿菌生物膜的形成使用，同時(shí)在學(xué)校教書(shū)和上課。後來(lái)去創新，我在杜克醫(yī)學(xué)中心做博士後研究足夠的實力，專(zhuān)注於傳染病和抗感染藥物課題，這段經(jīng)驗(yàn)讓我第一次體驗(yàn)了實(shí)驗(yàn)室自動(dòng)化結構。

Opentrons: 您的研究計(jì)畫(huà)是什麼更適合？

Carlos Goller: 我在 NCSU 向?qū)W生教授生物技術(shù)，有時(shí)也向教職員教授生物技術(shù)溝通協調。在我的課程中要素配置改革，我們使用 OT-2 自動(dòng)化移液機(jī)器人和 Zymo 研究套件進(jìn)行 DNA 和 RNA 萃取。我們現(xiàn)在有一個(gè) Opentrons 熱循環(huán)模組保障性，並將嘗試製作我們自己的 RNAseq 庫(kù)帶動產業發展。

Opentrons: 為什麼選擇 OT-2 ？

Carlos Goller: 身為杜克大學(xué)的博士後研究員十分落實，我和 Pat Seed 博士輪流使用一個(gè)多通道移液器篩選了 2500 種化合物倍增效應。我們的檢測(cè)目標(biāo)是找出對(duì)泌尿道致病性大腸桿菌莢膜生物合成具有良好活性的化合物。在北卡羅來(lái)納州立大學(xué)擴大，我們購(gòu)買(mǎi)了一臺(tái) ePMotion 5075 液體處理機(jī)器人多樣性，並在接下來(lái)的幾年實(shí)驗(yàn)工作中持續(xù)運(yùn)作使用發揮效力。我們也申請(qǐng)了內(nèi)部資金購(gòu)買(mǎi) Opentrons 自動(dòng)化移液平臺(tái)新格局。

與其他實(shí)驗(yàn)室自動(dòng)化設(shè)備相比，OT-2 的價(jià)格實(shí)惠安全鏈，對(duì)於普通教學(xué)實(shí)驗(yàn)室而言不會(huì)產(chǎn)生太多預(yù)算壓力顯示。 Opentrons 軟體也是開(kāi)源的，這一點(diǎn)我們很喜歡真正做到。不必被單一軟體捆綁科普活動，以及不用取得許可證創新延展，Opentrons 的靈活性是關(guān)鍵優(yōu)勢(shì)。

在編寫(xiě)程式碼方面長期間，多虧了Opentrons 的線上協(xié)議編輯器基本情況，讓我的學(xué)生們?cè)诓痪邆銹ython 基礎(chǔ)的情況下，也能夠透過(guò)修改Opentrons 的開(kāi)源協(xié)議高端化，以更好地適應(yīng)他們?cè)趯?shí)驗(yàn)室中的工作流程力量。

我不想讓我的班級(jí)的 12 個(gè)人全部圍在2臺(tái)機(jī)器人周?chē)Ｎ覀冇?2 臺(tái) OT-2 和 ePMotion提單產，所以我把大家分成4 人一組深入實施，分別負(fù)責(zé)對(duì)應(yīng)的設(shè)備程式設(shè)定工作。透過(guò)把團(tuán)隊(duì)拆分成更小的小組精準調控，讓所有人都有機(jī)會(huì)嘗試讓機(jī)器運(yùn)行這項(xiàng)挑戰(zhàn)功能。

在傳統(tǒng)的學(xué)術(shù)教育環(huán)境中，學(xué)生可能沒(méi)有機(jī)會(huì)親身參與大規(guī)模解決、高度自動(dòng)化的實(shí)驗(yàn)室研究預期。所以，我在北卡羅來(lái)納州立大學(xué)提出用機(jī)器人傳授一門(mén)課程幅度，並寫(xiě)了一份 NSF 提案就能壓製。該提案旨在建立一個(gè)教育工作者網(wǎng)絡(luò)，我與 UNC Chapel Hill 的 Sabrina Robertson 博士一起建立案例研究適應能力，向?qū)W生傳授高通量藥物篩選更優美、顯微鏡和其他高通量應(yīng)用的方法。

Opentrons: 您覺(jué)得OT-2對(duì)您幫助最大的是哪方面防控？

Carlos Goller: OT-2 讓學(xué)生有更多的時(shí)間在設(shè)備上操作成效與經驗，在實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行故障排除，而不用把時(shí)間浪費(fèi)在繁瑣的工作上堅實基礎。但目前我們遇到了一些小問(wèn)題——其中一臺(tái) OT-2 無(wú)法連接——但這也只是自動(dòng)化過(guò)程的一部分稍有不慎，學(xué)生們欣然接受了挑戰(zhàn)。

Opentrons: 您的 OT-2 運(yùn)作體驗(yàn)如何等地？

Carlos Goller: 去年最為顯著，我們?yōu)橐粋€(gè)研究生提供了第一臺(tái) OT-2，並讓他們從零開(kāi)始設(shè)置規定，用水和食用色素進(jìn)行練習(xí)環境。我們把協(xié)議設(shè)定得相對(duì)複雜，但這個(gè)學(xué)生只花了兩個(gè)多小時(shí)就弄清楚如何使用 OT-2高質量。他們非常積極地提出問(wèn)題——並且任然相對簡便、熱情地投入研究工作！

Opentrons: 在您擁有OT-2之前流程，您使用過(guò)其他實(shí)驗(yàn)室自動(dòng)化設(shè)備嗎合作？您對(duì)實(shí)驗(yàn)室自動(dòng)化流程的期望是什麼勃勃生機？

Carlos Goller: 我曾經(jīng)使用過(guò) ePMotion 5075，並創(chuàng)建了幾個(gè)腳本來(lái)實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化 HIT 採(cǎi)摘極致用戶體驗、藥物篩選提供有力支撐、細(xì)菌稀釋和 qPCR。身為工程師而言建議，我很喜歡自動(dòng)化科技實力。

Opentrons: 您有進(jìn)行其他專(zhuān)案自動(dòng)化的計(jì)畫(huà)嗎？

Carlos Goller: 我們正在努力發(fā)展一個(gè)高通量定序的操作課程建設。我們可以使用流式細(xì)胞儀以及 Opentrons OT-2 自動(dòng)化移液機(jī)器人進(jìn)行課程在此基礎上。我希望透過(guò)這兩套儀器的組合可以幫助一年級(jí)和二年級(jí)的學(xué)生更好地理解高通量的操作方法。

Opentrons: 您還有其他關(guān)於 OT-2 的使用體驗(yàn)想要分享的嗎前來體驗？

Carlos Goller:  今年我們將更深入研究實(shí)驗(yàn)室自動(dòng)化自主研發。 我們一直在與 Opentrons 合作開(kāi)展一個(gè)公民科學(xué)項(xiàng)目，並困擾了 Opentrons 支援團(tuán)隊(duì)的 Max Marrone（他非常棒８訌V闊。p耗。該計(jì)畫(huà)旨在尋找一種奇怪的微生物，它可以吸收液態(tài)金並將其沉澱成奈米顆粒非常完善，所以對(duì)於學(xué)生來(lái)說(shuō)性能穩定，這確實(shí)是一個(gè)很好的吸引，但我們對(duì)他們的基因組或表達(dá)的基因知之甚少作用。

在今年情況正常，我們非常關(guān)注實(shí)驗(yàn)室自動(dòng)化。我們?cè)谂cOpentrons 合作開(kāi)展一個(gè)全民科學(xué)項(xiàng)目技術特點，我們與Opentrons 的應(yīng)用支援團(tuán)隊(duì)的Max Marrone 一起攻克難題提高鍛煉，他給了我們很棒的支持！該計(jì)畫(huà)是關(guān)於尋找一種可以吸收液態(tài)金並將其沉澱成奈米顆粒的特殊微生物凝聚力量，這對(duì)學(xué)生來(lái)說(shuō)是一個(gè)非常好的學(xué)習(xí)機(jī)會(huì)有所提升。

我們也與Zymo合作，在OT-2上實(shí)現(xiàn)mag磁珠新的力量、trizol和RNA-seq協(xié)議的自動(dòng)化先進水平。我們的目標(biāo)是每個(gè)小組將接受為期6週的半學(xué)期專(zhuān)案挑戰(zhàn)，他們將學(xué)習(xí)如何使用OT-2進(jìn)行RNA萃取全面展示。我們購(gòu)買(mǎi)了Opentrons移液器重要平臺、Opentrons磁性模組和Opentrons溫度模組來(lái)進(jìn)行實(shí)驗(yàn)操作。

我們意識(shí)到我們可能無(wú)法完全實(shí)現(xiàn)這一目標(biāo)結構，但我們會(huì)不斷嘗試這些具有挑戰(zhàn)性更適合、涉及多種技術(shù)和故障排除協(xié)議的專(zhuān)案。

我相信這些課程能夠?yàn)閷W(xué)生提供寶貴的實(shí)務(wù)經(jīng)驗(yàn)溝通協調，對(duì)此我真的感覺(jué)很榮幸要素配置改革。使用OT-2的體驗(yàn)真的很開(kāi)心。