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2020 年 37 月 24 日

Opentrons 客戶訪談?| 謝菲爾德大學(xué)的 Oscar Swindley

Oscar Swindley 在謝菲爾德大學(xué)從事單株抗體折疊和組裝工作。他使用 Opentrons OT-2 移液機(jī)器人對(duì)細(xì)胞培養(yǎng)物進(jìn)行滴度測(cè)定製高點項目。

謝菲爾德大學(xué)是英國(guó)極具影響力的研究型大學(xué)之一特征更加明顯,建校歷史悠久設計,在2022 QS 世界大學(xué)排名第95 名。 Oscar Swindley 是雪菲爾大學(xué)化學(xué)與生物工程系博士相貫通,從事單株抗體折疊和組裝工作重要作用。他使用Opentrons OT-2 移液機(jī)器人進(jìn)行滴度測(cè)定以進(jìn)行細(xì)胞培養(yǎng)開(kāi)發(fā)。今天他將為大家分享他對(duì) OT-2 的使用體驗(yàn)溝通協調。

Oscar Swindley 是雪菲爾大學(xué)化學(xué)與生物工程系的博士生要素配置改革,合成生物學(xué)平臺(tái)開(kāi)發(fā)團(tuán)隊(duì)的一員。該實(shí)驗(yàn)室於2019年8月購(gòu)買了首臺(tái) Opentrons OT-2保障性,用於細(xì)胞培養(yǎng)開(kāi)發(fā)的滴度測(cè)定自動(dòng)化帶動產業發展,Oscar 是負(fù)責(zé)操作OT-2 的深度使用者。

Oscar Swindley. 圖片來(lái)源: Oscar Swindley

Opentrons: 請(qǐng)介紹一下您的研究背景十分落實?

Oscar Swindley: 我從事的研究方向是單株抗體折疊和組裝過(guò)程的遺傳及化學(xué)操作倍增效應,以及自動(dòng)化程序的最佳化和整合。我們使用 OT-2 在我們的實(shí)驗(yàn)室中執(zhí)行大量的細(xì)胞培養(yǎng)操作設施。我剛剛完成了我們的第一個(gè)大型篩選項(xiàng)目需求,其中所有細(xì)胞培養(yǎng),轉(zhuǎn)染組合運用,樣品收集和滴度測(cè)定都在 OT-2 上進(jìn)行更讓我明白了。

Opentrons: 如何形容您在實(shí)驗(yàn)室的一天?

OS: 最近我正在處理在 OT-2 上完成的第一次大規(guī)模細(xì)胞培養(yǎng)篩選的結(jié)果競爭力。我一直在使用 OT-2 進(jìn)行滴度測(cè)定充分。 OT-2 支援並簡(jiǎn)化了整個(gè)流程。除此之外集聚,我的常規(guī)日常工作包括在搖瓶和孔板上進(jìn)行常規(guī)的細(xì)胞培養(yǎng)競爭力,以及在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行其他實(shí)驗(yàn)。

Oscar 的 OT-2 甲板佈局狀況。圖片來(lái)源: Oscar Swindley

Opentrons: 為什麼選擇 OT-2機製性梗阻?

OS: 在我們的實(shí)驗(yàn)室引入 OT-2 的目的是提高我們平臺(tái)的可重複性。我們?cè)趯?shí)驗(yàn)室使用 24 孔和 96 孔板進(jìn)行高通量篩選全過程。我們面臨的主要困難是轉(zhuǎn)染集成應用,因?yàn)楫?dāng)我們以非常高的密度重新懸浮細(xì)胞時(shí),溶液會(huì)變得黏稠不負眾望,細(xì)胞會(huì)迅速沉降高效流通。我們需要準(zhǔn)確地把樣本分配到整個(gè)孔板上調解製度,以便在每個(gè)孔中種植相同數(shù)量的細(xì)胞。這是一個(gè)大量重複的過(guò)程功能,且處理的液體體積非常小應用的因素之一。我們面臨的最大問(wèn)題是如何在細(xì)胞隨著時(shí)間推移逐漸沉降的情況下,始終保持液體充分混合並成功種植細(xì)胞預期。

Opentrons: 您具體使用 OT-2 做什麼敢於監督,它如何適應(yīng)您的工作流程?

OS: 我們使用 OT-2 來(lái)設(shè)定和運(yùn)行我們的96孔電轉(zhuǎn)染平臺(tái)結構,從多種培養(yǎng)板格式取樣重要的作用,並執(zhí)行板基測(cè)定。特別是對(duì)於我們的電轉(zhuǎn)染平臺(tái)規模最大,OT-2 將 DNA穩中求進、緩衝液和細(xì)胞結(jié)合在一起,然後將混合物分配到電轉(zhuǎn)染板中最深厚的底氣。轉(zhuǎn)染後適應性,OT-2 進(jìn)行稀釋、混合和為細(xì)胞提供養(yǎng)分便利性,然後將其種入 24 孔培養(yǎng)板中方法。 3 天後我們將用機(jī)器人對(duì)培養(yǎng)物進(jìn)行測(cè)定。這包括混合和從培養(yǎng)板取樣進(jìn)行各種下游測(cè)定提供有力支撐。最後切實把製度,OT-2 能夠?qū)颖炯虞d到玻璃片上,用於我們的高通量細(xì)胞計(jì)數(shù)器自行開發,並收穫上清液進(jìn)行滴度分析進行部署。在最近的一組篩選實(shí)驗(yàn)中,OT-2 幫助我們進(jìn)行了 22 個(gè)電轉(zhuǎn)染板和相關(guān)的取樣應用情況。 OT-2 只需 20 分鐘就能執(zhí)行一次滴度分析保護好,這太棒了。我可以全天讓機(jī)器人持續(xù)運(yùn)作表現。

Opentrons: 用你們的 OT-2 開(kāi)始實(shí)驗(yàn)是什麼感覺(jué)特點?

OS: 我寫第一個(gè)協(xié)議腳本大約花了 2 個(gè)月的時(shí)間。但是腳本一旦完成結論,所有的資訊都在腳本裡和諧共生,我就可以快速地繼續(xù)進(jìn)行更複雜的實(shí)驗(yàn)。我把我的所有腳本都上傳到了我的GitHub 頁(yè)面上適應性強,如果有興趣的話技術交流,大家都可以去看看。

Opentrons: 在使用 OT-2 之前,您是否使用過(guò)其他實(shí)驗(yàn)室自動(dòng)化設(shè)備創造更多?

OS: 沒(méi)有宣講活動。我以前使用過(guò) BioMek,並設(shè)定了 SOP工藝技術。為了更好地對(duì) OT-2 進(jìn)行編程確定性,我在 8 月至 11 月期間學(xué)習(xí)了 Python。

Opentrons: 您還有其他關(guān)於 OT-2 的體會(huì)要跟大家分享的嗎損耗?

OS: 整體來(lái)說(shuō)這是一臺(tái)好設(shè)備,但它沒(méi)有安全保障裝置非常完善,也就是說(shuō)性能穩定,它無(wú)法辨識(shí)障礙物,也無(wú)法意識(shí)到吸頭是否掉落作用。我們現(xiàn)在遇到的問(wèn)題是如能能夠在故障發(fā)生時(shí)追蹤研學體驗。另一個(gè)困難是設(shè)備與 24 孔板的兼容性不強(qiáng),因此我不得不想辦法騙過(guò)它最為突出,方法是每隔一行取出吸頭落實落細。但是如果你知道如何編程控制機(jī)器人,你總是可以找到解決方案的高效化⊙u高點項目?偟膩?lái)說(shuō),我認(rèn)為它非常適合用於研究範圍和領域,在你的每次實(shí)驗(yàn)中你可以根據(jù)你的需求調(diào)整實(shí)驗(yàn)方案有所增加。

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