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2020 年 58 月 24 日

客戶案例 | Zymo Research 使用OT-2進(jìn)行新冠病毒檢測

Zymo Research為從事新冠病毒檢測的研究人員提供生物醫(yī)學(xué)工具和服務(wù)情況正常,包括為Opentrons客戶提供支援。

Zymo Research 是一家為研究人員提供生物醫(yī)學(xué)工具和服務(wù)的企業(yè)有效保障。目前的方法,他們正在幫助各大實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行新冠病毒檢測又進了一步。為此他們創(chuàng)建了一個從樣本收集臺上與臺下、RNA 提取到基於rRT-PCR檢測的完整的新冠病毒檢測工作流程,該工作流程已經(jīng)進(jìn)入FDA的緊急使用授權(quán)前審查狀態(tài)創新延展。 Zymo Research 作為Opentrons 的共同開發(fā)測試系統(tǒng)合作夥伴強化意識,Zymo Research 願意為任何有興趣將該工作流程加載到Opentrons 液體處理機(jī)器人上的組織提供技術(shù)支援。

今天我們邀請到 Zymo 的研究專家 Casey Cruz 為大家分享他們?nèi)绾问褂?OT-2 進(jìn)行新冠檢測,協(xié)助對抗全球疫情現場。

Opentrons: 疫情爆發(fā)前高端化,您的日常生活是怎麼樣的?

Casey Cruz: 在疫情爆發(fā)前我有所應,我們最初購買OT-2 是為了做RNA-Seq 文庫製備的提單產,後期假如我們的工作不再需要用於新冠檢測,我們?nèi)匀环浅F诖cOpentrons合作開展這個計畫至關重要。為此發展空間,我們甚至編寫了一個用於rRT-PCR 設(shè)定的腳本,並希望將其應(yīng)用於Pangea 實(shí)驗(yàn)室的SARA-CoV-2 實(shí)驗(yàn)室開發(fā)的測試(LDT)有所應。身為RiboFree RNA-Seq試劑盒的產(chǎn)品經(jīng)理足了準備,我被OT-2的價格和Opentrons 的開源社群所吸引。在專案初步驗(yàn)證期它的各方面表現(xiàn)都很棒著力提升,但由於疫情爆發(fā)深刻內涵,我不得不暫時改變研究方向,轉(zhuǎn)而投入?yún)f(xié)助新冠病毒檢測專案融合。

Opentrons: 您現(xiàn)在所做的工作與您的日常工作內(nèi)容有什麼不同嗎交流等?

Casey: 我們現(xiàn)在的工作是提交關(guān)於新冠病毒檢測工作流程的 FDA 緊急使用授權(quán)申請。這個計畫工作流程包含從樣本採集到RNA 萃取再到rRT-PCR 檢測各方面,從運(yùn)輸介質(zhì)DNA/RNA 保護(hù)劑開始防控,在樣本收集和運(yùn)送過程中需要把新冠病毒完全滅活,這樣就可以確保RNA 在室溫下能夠最高保存30天適應性。這是在實(shí)際應(yīng)用中一個很好的方法堅實基礎,使生物樣本中的 DNA/RNA 可以在沒有冷鏈的情況下保存,當(dāng)樣本被運(yùn)回實(shí)驗(yàn)室就可以用於自動化樣本處理工作流程重要作用。

接下來等地,我們使用Quick-DNA/RNA Viral MagBead Kit 試劑盒進(jìn)行RNA 萃取,並使用Quick-SARS-CoV-2 rRT-PCR Test Kit 試劑盒完成新冠病毒檢測的工作流程尤為突出。

使用 Quick-DNA/RNA Viral MagBead 試劑盒的 Zymo Research 數(shù)據(jù)規定。圖片來源: Zymo Research

Pangea 實(shí)驗(yàn)室是一家獲得CLIA 認(rèn)證和CAP 認(rèn)證的臨床測試實(shí)驗(yàn)室,這裡的SARA-CoV-2 實(shí)驗(yàn)室開發(fā)測試(LDT) 是從收到樣本開始空間載體,然後他們使用KingFisher 提取RNA高質量,使用Quick-SARS- CoV-2 rRT-PCR 試劑盒檢測新冠病毒。此工作流程使用的試劑是 Zymo Research 目前正在等待美國食藥監(jiān)局(FDA)緊急使用授權(quán)(EUA)的試劑重要組成部分。讓這個系統(tǒng)啟動並運(yùn)行流程,並為申請緊急使用授權(quán)(EUA)進(jìn)行驗(yàn)證實(shí)驗(yàn),是 Pangea 團(tuán)隊(duì)目前正在做的主要工作勃勃生機。

Opentrons: 新冠病毒檢測專案中助力各業,最讓您感到興奮的是什麼極致用戶體驗?

Casey: 最讓我興奮的是,這個計畫在這個關(guān)鍵時刻正在幫助有需要的人應用。很多時候建議,當(dāng)你做研究時,你會感覺與結(jié)果相去甚遠(yuǎn)相貫通,但這次不同用的舒心。透過這個新冠檢測工作流程,我能明顯地感受到我們的技術(shù)正在幫助醫(yī)療專業(yè)人員並幫助阻止疾病的傳播集聚效應,這將關(guān)係到許多人的生命健康集成。我很感激能夠?yàn)榇俗龀鲐暙I(xiàn),這對世界將產(chǎn)生持久的影響並真正發(fā)揮作用互動講。

Opentrons: 關(guān)於這個項(xiàng)目穩定性,您認(rèn)為關(guān)鍵要點(diǎn)是什麼?

Casey: 我認(rèn)為關(guān)鍵在於確保安全運(yùn)輸臨床樣本過程中。 DNA/RNA 保護(hù)劑可確保病毒滅活非常完善,從而確保進(jìn)行診斷測試的人員安全;檢測人員需要做的就是對試管外部進(jìn)行去污處理全面革新,確保樣本就可以安全使用作用。我們非常重視確保從樣本採集開始的診斷全過程安全性和準(zhǔn)確性。

如果您想在自己的實(shí)驗(yàn)室中部署同款 Opentrons 系統(tǒng)行業分類,請聯(lián)絡(luò) [email protected]技術特點。

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