Arianna Morosetti 在卡加利大學研究驅蟲藥抗藥性大幅增加。 她使用 Opentrons OT-2 移液機器人進行了大量 PCR進入當下。

卡加利大學（University of Calgary）是加拿大頂尖大學之一 。 Arianna Morosetti 是一名分子生物學家逐漸完善，在卡加利大學的Gilleard 實驗室研究寄生線蟲的抗藥性。該實驗室於2019年3月購買了第一臺Opentrons OT-2新模式，並希望再另外加夠一臺專門用於PCR應用數據。

Arianna Morosetti 在卡加利大學 Gilleard 實驗室與他們的 OT-2 合影創新的技術，圖片來源：Arianna Morosetti

Opentrons: 請介紹一下您的研究背景。

ARIANNA MOROSETTI: 我是分子生物學家顯著，受聘為卡加利大學 Gilleard 實驗室的博士後研究員快速增長。我在一個大型研究小組工作，我們小組的成員研究背景各不相同占，有從事生物資訊學工作的高質量，也有剛接觸這個學術領域的，甚至還有從未接觸過移液器的激發創作。但是我們最終順利讓每個人都具備做分子生物學實驗的能力逐步改善。

在這個職位之前，我曾在企業(yè)任職提升，所以我知道實驗室自動化的應用。在卡加利大學任職工作中的必然要求，我會使用OT-2來驗證新協(xié)議和簡化我們的標準程序研究成果。

Opentrons: 請問您的研究計畫是？

AM: 我從事擴增子定序工作完善好。我們利用分子遺傳學和基因組學方法來研究含有大量重要病原體的寄生線蟲大面積。我們實驗室的核心計畫是研究驅蟲藥的抗藥性，並研究潛在因果突變在寄生線蟲族群中的產(chǎn)生和傳播問題分析。我們的目標是改進診斷培養，確定新的控制目標，並為抗藥性的永續(xù)管理提供證據(jù)基礎更加完善。

Opentrons: 請問您在實驗室的日常工作是怎麼樣的形式？

AM: 我們用來擴增定序的協(xié)定在非常具體的工作流程中有很多既定元素。我們經(jīng)歷了一個較複雜的 PCR 設定步驟：有時我們會使用 4 塊裝有 96 個樣本的孔板支撐作用，使用 96 種獨特的引子進行組合日漸深入。手動處理這樣的工作非常麻煩，而且非常耗時綜合措施，因此我們把這些手動工序交給OT-2 移液機器人執(zhí)行可靠保障。

Opentrons: 為什麼選擇OT-2？

AM: 我們實驗室已經(jīng)有一臺其他品牌的設備設計標準，我們考慮使用它開展，但用到它的次數(shù)不多，而且該公司在支持請求方面反應不及時發揮重要帶動作用。我們還需要購買一個額外的磁性模組來執(zhí)行我們的方案意向。由於我們在 PCR 前室和PCR 後室分開工作，這意味著我們將不得不購買一臺新的機器人和磁性模組重要方式，這會產(chǎn)生很高的費用開展面對面。 Opentrons OT-2 和磁性模組價格實惠系統，性價比高，能滿足我們所需的實驗功能進一步提升，這是我們在比較多家產(chǎn)品後空間廣闊，最後選擇 OT-2 的重要原因。

Opentrons: 您具體使用OT-2進行哪些工作改革創新？它如何融入您的工作流程知識和技能？

AM: 我們使用 OT-2 來分配少量的引子。我們有一個簡單的方案新模式，是我用 Opentrons Protocol Designer 這個簡單的工具設計的崿F，F(xiàn)在它工作得很好，我們經(jīng)常使用它組織了，但我們一開始就面臨缺少經(jīng)過驗證的濾芯吸頭的問題服務體系。我嘗試使用不同品牌的濾芯吸頭，但這給方案的發(fā)展造成了延誤屪C遇，F(xiàn)在濾芯吸頭已經(jīng)有了分析，問題就解決了。

在我們的擴增子定序工作流程中全面闡釋，我們使用磁珠來清理我們的PCR產(chǎn)物非常激烈，這需要大量時間和手動工作。為了提升清理效率和節(jié)省人力成本引人註目，我們使用了 Opentrons 磁性模組進行自動化磁珠清理工作領域。在我對 Python 進行一些研究之後，創(chuàng)建了我們的自動化協(xié)定好宣講。我們對規(guī)避交叉污染的要求非常嚴格（因為這個環(huán)節(jié)對我們文庫製備環(huán)節(jié)的影響至關重要）管理，但 Opentrons 的支援團隊給了我們很多有用的幫助。我們提出了很多問題生動，但他們很有耐心幫我們解決問題新型儲能。下一步我們將使用 PCR 樣本驗證所有內容。

Opentrons: 您的OT-2運作體驗如何新品技？

AM: 我們的其中一個 P10 移液器出現(xiàn)了漏液問題範圍，但 Opentrons 的客戶支援團隊很快就給我更換了新的移液器，目前一切都很順利紮實做。除此之外空間廣闊，我透過用各種顏色的食用色素對機器人做了很多測試，然後執(zhí)行程式進行調整提供深度撮合服務。我就是這樣做的服務品質，只是透過觀察並根據(jù)我們想要實現(xiàn)的目標調整程序。

Opentrons: 在您使用 OT-2 之前，您是否使用過其他實驗室自動化設備影響？您對實驗室自動化流程的期望是什麼新的動力？

AM: 這是我第一次使用實驗室自動化設備。我原本預計會有一些挫折發展契機，所以當出現(xiàn)問題時廣泛關註，我深吸了一口氣，然後再次嘗試發力。我不害怕新事物優勢領先；通常當有新設備出現(xiàn)時，我會非常樂於嘗試共創美好。

根據(jù)我的經(jīng)驗推動並實現，設定任何移液機器人都需要時間。不管是什麼機器覆蓋範圍，無論它操作軟體有多直觀優化程度，都需要一個人花時間學習他們實驗室機器人的所有功能，並真正了解軟體是如何運作的奮勇向前。

Opentrons: 您的 OT-2 有哪些優(yōu)缺點取得明顯成效？

AM: OT-2 自動化讓我們的生活變得更輕鬆。對於專業(yè)研究員數據，使用 OT-2 有助於節(jié)省實驗時間。

我們實驗室也有很多學生和訪客來學習我們小組使用的技術發揮。我們將 OT-2 整合到我們的實驗室程序中發行速度，學生和訪客只需從冷凍室中取出預先分配好的孔板即可開始他們的實驗。他們學習起來也很方便與時俱進。

Opentrons: 目前的模組是否滿足您的需求性能？您是否考慮新增其他功能模組？

AM: 我們已經(jīng)看過 Opentrons 的熱循環(huán)模組綜合運用，我們認為它將可以與我們的磁珠清理單元很好地整合到一起供給。熱循環(huán)模組是我們計劃內需要的，它可以提供更多功能實事求是，同時可以有效利用甲板空間進行探討。

我認為對於我自己來說，為了運行常規(guī)的 DNA 提取服務水平，我可能需要添加一個溫控模組最新，但限制因素是需要在機器人外執(zhí)行的離心步驟。對我們來說最重要的是處理我們工作流程中最耗時的部分處理方法，即PCR設定和清理步驟重要作用。

Opentrons: 關於機器人自動化，您的感受是怎麼樣的？

AM: 為用戶充足，我希望有更多關於使用API??的教學進展情況。我對 Python 有一點經(jīng)驗，但經(jīng)驗還不夠充分綠色化發展，因為我的應用更著重於使用物件來進行設計和程式設計至關重要。我認為生物學領域的大多數(shù)專家都不精通Python，而且現(xiàn)有的教程沒有有效的幫助左右。我認為網(wǎng)路研討會或影片會更有幫助背景下。

我在使用 OT-2 時還有一個期望，就是能夠使用不同的實驗室器具和材料可靠保障。如果我們使用的產(chǎn)品沒有在 OT-2上進行過測試自然條件，要讓它們運作就有點更成問題了。但我知道你們正在將 Labware Creator 整合進來開展，這將對我們有很大幫助互動互補。特別是我們的濾芯吸頭。

我認為機器人非常有幫助意向。很多人認為你必須在實驗室裡受苦意料之外，但我不同意。我在許多實驗室工作發展空間，它們的資金能力各不相同效果，我經(jīng)常必須手動操作。我很認同刻苦學習研究的精神足了準備，但是隨著科技的進步合作關系，科學研究的工作效率應該提升，自動化技術的發(fā)展也可以讓我們研究過程也變得不那麼乏味深刻內涵。

我認為你不應該花太多時間在重複的步驟上傳遞，這些步驟對你的研究沒有價值。如果你有一種方法可以做到這一點——移液——既乾淨又實用深入闡釋，那麼你應該朝著使用它前進相關性，即使起步要投入的時間和勞動力投資可能很高。