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2019 年 22 月 4 日

開源在生物學中的力量 - DAMP 實驗室的 10,000 美元生物工廠

一個強大的生物工廠不需要數(shù)百萬美元的投資——經(jīng)濟實惠的開源工具讓每個實驗室都有可能實現(xiàn)這些功能。

DAMP 實驗室是波士頓大學生物設計中心內一個新創(chuàng)的生物工廠示範推廣。該實驗室僅使用不到 10,000 美元的開源軟體和硬件適應性強,就為科學界提供了 30 種合成生物學方案(如DNA組裝飛躍、轉化足了準備、測序和質粒純化等),並以此收取服務費顯示。任何科學家都可以透過造訪 DAMP 實驗室的網(wǎng)頁介面遠端指定實驗計劃,其自動化系統(tǒng)能夠設計真正做到、建置和測試該計劃科普活動。

他們是如何做到的呢?

透過整合一系列開源工具習慣,DAMP實驗室能夠快速開發(fā)一個複雜的系統(tǒng)充足,該系統(tǒng)能夠高效且優(yōu)雅地自動化執(zhí)行生物迴路測試。其中一些關鍵的開源工具包括:

  • cello 使用Verilog編程語言實現(xiàn)生物回路的自動化設計的積極性。
  • aquarium 用于實驗室信息管理系統(tǒng)(LIMS)綠色化發展,實現(xiàn)作業(yè)排隊和庫存管理。
  • open TR ONS 的OT-2移液機器人:用于自動化DNA組裝、轉化和其他許多方案用上了。

您可以在 Synbiobeta 部落格上了解更多關於 DAMP 實驗室技術堆疊的資訊提升行動。

為什麼DAMP實驗室的生物工廠和開源技術如此重要?

DAMP實驗室在影片中談到了開源技術和它賦予的能力。

該專案展示了開源軟體和硬體在實驗室中的力量又進了一步。如果手動執(zhí)行所有這些流程設備製造,DAMP實驗室需要一週時間來設計、建造和測試10個基因迴路快速融入。透過在開源技術上投入相對較少的資金,DAMP實驗室的吞吐量提高了10倍系統。

結果就是增強,DAMP實驗室能夠用相同的設施和團隊執(zhí)行10倍的實驗。開源工具提高了生產(chǎn)效率交流等,大大降低了執(zhí)行複雜實驗的成本更加廣闊。

一個強大的生物工廠不需要數(shù)百萬美元的投資——經(jīng)濟實惠的開源工具讓每個實驗室都有可能實現(xiàn)這些功能。

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