冠狀病毒大流行為生命科學(xué)研究人員提供了前所未有的機(jī)會(huì)更高要求。以下 9 種資源可協(xié)助您最大限度地利用這些機(jī)會(huì)支撐作用。冠狀病毒大流行改變了生命科學(xué)的格局全面協議，消耗了近期的大部分研究機(jī)會(huì)形式。但它也為研究人員提供了前所未有的合作拓展基地、創(chuàng)新和創(chuàng)造新知識(shí)的機(jī)會(huì)善於監督。

前所未有的機(jī)會(huì)帶來了前所未有的資源——其中許多資源都是免費(fèi)使用的完成的事情。從 Slack 頻道到 SOP自主研發，這裡有 9 種工具可以幫助任何希望建立測試實(shí)驗(yàn)室、優(yōu)化工作流程或以其他方式參與這個(gè)全球科學(xué)計(jì)畫的研究人員全過程。

全球 Slack 頻道

來自全球各地的 13,000 多名研究人員參加了此次討論集成應用，這是全球關(guān)於擴(kuò)大 COVID-19 測試規(guī)模的最大討論。它充滿了協(xié)作討論不負眾望，涉及從排除 RNA 提取工作流程故障和確定供應(yīng)商到克服樣品和供應(yīng)鏈物流以及向 FDA 申請緊急使用授權(quán)等所有方面高效流通。您也可以加入對話；只需點(diǎn)擊上面的連結(jié)並發(fā)送電子郵件至 [email protected] 即可獲得 24 小時(shí)邀請精準調控。

彈出式偵測實(shí)驗(yàn)室藍(lán)圖

創(chuàng)新基因組學(xué)研究所 (IGI) 提供了有關(guān)如何建立 CLIA 認(rèn)證的 SARS-CoV-2 檢測實(shí)驗(yàn)室的詳盡指南功能。 IGI 是加州大學(xué)柏克萊分校和加州大學(xué)舊金山分校的研究人員團(tuán)隊(duì)，他們組建了一支多元化解決、跨學(xué)科的團(tuán)隊(duì)預期，晝夜不停地工作了 3 週，以擴(kuò)大灣區(qū)的冠狀病毒檢測規(guī)模幅度。他們的指南包括從特定自動(dòng)化工作流程和協(xié)議到人員培訓(xùn)和合規(guī)指南等各方面的提示就能壓製。

學(xué)術(shù)合作診斷實(shí)驗(yàn)室的標(biāo)準(zhǔn)作業(yè)程序 (SOP)

克里克 COVID19 聯(lián)盟提供了有關(guān)他們?nèi)绾卧趯W(xué)術(shù)環(huán)境中與外部合作夥伴一起創(chuàng)建診斷實(shí)驗(yàn)室的逐步指南更合理。克里克 COVID19 聯(lián)盟與倫敦大學(xué)學(xué)院醫(yī)院更優美、健康服務(wù)實(shí)驗(yàn)室 (HSL)各方面、癌癥研究所和弗朗西斯克里克研究所合作，在短短兩週多的時(shí)間內(nèi)創(chuàng)建了這項(xiàng)測試設(shè)定成效與經驗。他們的可下載指南涵蓋了從實(shí)驗(yàn)室安全資訊和 2 類樣本滅活指南到 RNA 萃取方案和製作自製緩衝液的所有內(nèi)容適應性。

臨床研究定序測試平臺(tái)

Broad Institute 開放了有關(guān)其針對 SARS-CoV-2 的臨床研究定序平臺(tái) (CRSP) 的存取權(quán)限。 Broad Institute 是麻省理工學(xué)院 (MIT) 和哈佛大學(xué)研究人員之間的合作稍有不慎，它使用他們的平臺(tái)運(yùn)行即時(shí)逆轉(zhuǎn)錄酶 (RT)-PCR 診斷檢測重要作用。對於任何尋找測試設(shè)施的研究人員，Broad Institute 都開放了他們的設(shè)施最為顯著。他們的說明包括標(biāo)本收集和運(yùn)輸指南尤為突出，以及針對患者和提供者的診斷測試和檢測情況說明書的常見問題解答。

基因組工程工具

Synthego 為基因組學(xué)研究人員提供了一系列工具環境，以提高 COVID-19 診斷和治療的速度和有效性空間載體。這些工具包括用於 RNA 收集的客製化 Cas13 指南和針對與 SARS-CoV-2 蛋白相互作用的 330 個(gè)人類基因的多陣列 CRISPR sgRNA 基因敲除文庫。他們的網(wǎng)站上有所有這些工具的鏈接相對簡便，以及他們用於創(chuàng)建這些工具的已發(fā)布測試數(shù)據(jù)重要組成部分。

SwabSeq 測試概念驗(yàn)證

Octant 的 SwabSeq NGS 診斷工作流程概念驗(yàn)證。 Octant 是一家生物技術(shù)公司合作，使用專有技術(shù)結(jié)合合成生物學(xué)特點、基因組工程、下一代定序和計(jì)算工具結論，創(chuàng)建了一種協(xié)議來擴(kuò)大基於 COVID19 序列的測試和諧共生，該協(xié)議簡單、便宜且靈敏適應性強。 它被稱為 SwabSeq科技實力，他們的實(shí)驗(yàn)室筆記文件包括從協(xié)議和測試程式碼到資料圖表和內(nèi)部筆記本的所有內(nèi)容。

大規(guī)模平行診斷測定概念驗(yàn)證

賓州州立大學(xué)合成生物學(xué)研究員 Howard Salis 的大規(guī)模平行 NGS 診斷測定概念驗(yàn)證建設。 Salis 發(fā)表了一份預(yù)印本，詳細(xì)介紹了大規(guī)模平行診斷測定(MPDA) 如何利用次世代定序在一次測定中同時(shí)進(jìn)行數(shù)千次病毒RNA 測量助力各行，並在每個(gè)工作流程中處理多達(dá)19,200 個(gè)患者樣本前來體驗。他的預(yù)印本詳細(xì)介紹了他的工作流程，結(jié)合了病毒RNA 提取確定性、使用具有獨(dú)特條碼的患者特異性引子的逆轉(zhuǎn)錄酶(RT) 以及單池聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)更加廣闊，然後進(jìn)行下一代測序(NGS)。

行動(dòng)測試實(shí)驗(yàn)室

OpenCell 的大量藍(lán)圖講故事、協(xié)定和其他資源非常完善。 OpenCell 是一家為生物技術(shù)新創(chuàng)公司提供移動(dòng)性能穩定、經(jīng)濟(jì)實(shí)惠的貨櫃實(shí)驗(yàn)室空間的公司，在英國測試領(lǐng)域處於領(lǐng)先地位作用，正在迅速擴(kuò)展高通量測試