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應(yīng)用筆記 · 2024年35月29日
利用甲板上的加熱器搖震模組實(shí)現(xiàn)SARS-CoV-2的中和抗體的自動(dòng)化
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應(yīng)用筆記 · 2024年19月29日
在OT-2上執(zhí)行連續(xù)稀釋
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應(yīng)用筆記 · 2024年9月29日
使用 OT-2 自動(dòng)化移液平臺(tái)進(jìn)行高效能核酸萃取
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Opentrons 的 COVID-19 檢測(cè)系統(tǒng)可以幫助運(yùn)行公共衛(wèi)生監(jiān)測(cè)計(jì)畫的實(shí)驗(yàn)室立即擴(kuò)大規(guī)模技術研究,每天篩檢 2,400 次檢測(cè)製高點項目。 Opentrons 的使命是透過(guò)更廣泛地使用實(shí)驗(yàn)室機(jī)器人來(lái)加速生命科學(xué)的發(fā)展能力和水平。世界現(xiàn)在比以往任何時(shí)候都更需要這種能力非常激烈。大規(guī)模的 COVID-19 檢測(cè)是限制死亡率的最佳方法之一習慣。大規(guī)模檢測(cè)可以快速發(fā)現(xiàn)和隔離感染大部分,限制病毒的傳播並保護(hù)脆弱族群參與水平。為了正確調(diào)查人群順滑地配合,需要處理數(shù)百萬(wàn)個(gè) COVID-19 檢測(cè)試劑盒。世界各地的組織都在努力盡快提高其能力勞動精神。
這就是 Opentrons 為應(yīng)對(duì)這種挑戰(zhàn)而建立的開展攻關合作。
Opentrons 的 COVID-19 檢測(cè)系統(tǒng)是運(yùn)行 COVID-19 公共衛(wèi)生監(jiān)測(cè)計(jì)畫的實(shí)驗(yàn)室的最佳解決方案,這些實(shí)驗(yàn)室需要立即擴(kuò)展到自動(dòng)化操作預下達。 Opentrons 可以在下訂單後的幾天內(nèi)安裝每天自動(dòng)進(jìn)行多達(dá) 2,400 次測(cè)試的系統(tǒng)的有效手段。我們目前正在加州帕洛阿爾託的開(kāi)放醫(yī)學(xué)研究所部署這種監(jiān)測(cè)能力,很快就會(huì)有更多監(jiān)測(cè)計(jì)畫方案。
我們可以與任何試劑供應(yīng)商合作關鍵技術,甚至提供最佳和最實(shí)惠的選擇建議。如果您的實(shí)驗(yàn)室需要擴(kuò)大 COVID-19 監(jiān)測(cè)業(yè)務(wù)深入,請(qǐng)透過(guò) [email protected] 與我們聯(lián)絡(luò)技術研究。
Opentrons 和開(kāi)放醫(yī)學(xué)研究所渴望與當(dāng)?shù)睾吐?lián)邦機(jī)構(gòu)合作,確定該系統(tǒng)是否可在緊急使用授權(quán) (EUA) 下用於臨床診斷開展研究,並提供測(cè)試頻寬以滿足日益增長(zhǎng)的極高需求姿勢。
以下是有關(guān)我們開(kāi)發(fā)的系統(tǒng)以及如何將其部署用於大規(guī)模 COVID-19 測(cè)試的詳細(xì)資訊。
測(cè)試過(guò)程與許多傳染病檢測(cè)一樣首要任務,檢測(cè) COVID-19 病毒的檢測(cè)採(cǎi)用定量聚合酶連鎖反應(yīng) (qPCR) 技術(shù)共享。對(duì)於像 COVID-19 這樣的冠狀病毒聽得進,該檢測(cè)實(shí)際上是一種逆轉(zhuǎn)錄酶 qPCR (RT-qPCR),因?yàn)樗鼫y(cè)量的是 RNA 而不是 DNA。 RT-qPCR 能夠檢測(cè)從患者樣本中純化的 RNA 中目標(biāo) COVID-19 序列的存在和水平引領作用,從而告訴您某人是否被感染,如果被感染製度保障,大約感染了多長(zhǎng)時(shí)間統籌發展。
第一步是收集樣本。收集發(fā)生在醫(yī)生下令進(jìn)行測(cè)試後效率。醫(yī)院規模、實(shí)驗(yàn)室和公共衛(wèi)生機(jī)構(gòu)擦拭患者的鼻子或嘴巴,並立即將測(cè)試拭子放入試管中講道理。然後發展目標奮鬥,這些患者樣本被安全地帶到檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室。
一旦收集管到達(dá)實(shí)驗(yàn)室落地生根,有三個(gè)自動(dòng)化步驟:
1.樣本接種2.RNA 萃取3.qPCR 設(shè)置
每個(gè)步驟都有指定的 OT-2 工作站(檢測(cè)除外的特點,檢測(cè)在實(shí)驗(yàn)室提供的 qPCR 儀器上進(jìn)行)。以下是如何在 Opentrons 上實(shí)現(xiàn)流程自動(dòng)化:
站點(diǎn) A – 樣本鋪板:將 96 個(gè)裝有懸浮在失活緩衝液中的患者樣本的收集管放在第一個(gè) Opentrons 機(jī)器人上有效保障,重新格式化以提取 RNA大數據。機(jī)器人將樣本和陽(yáng)性對(duì)照從管中移液到深孔板中。
站點(diǎn) A 配置:9,050 美元
p20 + p300 單通道移液管溫度模組(主動(dòng)冷卻對(duì)照RNA)4x 管架96 深孔萃取板1x 20ul 架+ 1x 200ul 濾芯吸頭架站點(diǎn)A 的OT-2 甲板佈局站點(diǎn)A 的OT-2 甲板佈局站點(diǎn)A 應(yīng)該位於某種「進(jìn)樣」室講實踐。此網(wǎng)站的主要瓶頸通常不是實(shí)際的重新格式化數字技術,而是為機(jī)器人貼上標(biāo)籤奮戰不懈、記錄、開(kāi)蓋和將收集管裝入架子措施。最好將樣品進(jìn)樣室與進(jìn)行樣品處理的任何空間分開(kāi)大大縮短,以防止污染。一旦樣本和陽(yáng)性對(duì)照 RNA 放入深孔板緊密相關,即可移至 B 站更默契了。
B 站 – RNA 萃取:96 個(gè)深孔板(包含樣本)移至第二個(gè)機(jī)器人培訓,使用磁性微珠進(jìn)行 RNA 萃取不合理波動。這是自動(dòng)化過(guò)程的主要部分,因?yàn)樾枰啻吻逑床襟E才能完全純化 RNA重要工具。
B 站配置:7,750 美元
p300 8 通道移液器磁性模組96 深孔萃取板96 孔洗脫板5 個(gè) 200ul 濾嘴架2 個(gè) 12 通道試劑容器2 個(gè) 1 通道液體廢棄物容器
還應(yīng)該有一個(gè)專門的提取室積極拓展新的領域,用於安置所有 B 站提取機(jī)器人。如果吞吐量需要性能,這個(gè)房間還可以容納一個(gè)試劑填充站多種方式,為 B 站機(jī)器人準(zhǔn)備磁性微珠和緩衝液,以進(jìn)行 RNA 萃取技術創新。如您在上面的甲板圖中所見(jiàn)深入交流研討,此過(guò)程需要大量試劑和吸頭。
C 站 - 檢測(cè)設(shè)定:從樣本中分離出的 RNA(洗脫)隨後被移至第三個(gè)房間廣泛應用,該房間容納 qPCR 儀器關註度,並設(shè)計(jì)為盡可能“乾淨(jìng)”,以最大限度地減少污染哪些領域。將裝有純樣本 RNA 的板子放在 Opentrons 機(jī)器人上敢於挑戰,為 RT-qPCR 檢測(cè)做準(zhǔn)備。
C 站 OT-2 配置:7,500 美元
p20 單通道Opentrons 溫度模組96 孔洗脫板96 孔 PCR 板3x 架 20ul 過(guò)濾吸頭
RT-qPCR 所需的試劑分別放置在溫度模組上進(jìn)行主動(dòng)冷卻建立和完善。這些試劑被組合成母液混合物讓人糾結,然後被分配到板中並與純化的 RNA 結(jié)合。經(jīng)過(guò)此過(guò)程後穩定發展,板就可以放入 qPCR 機(jī)器中並分析是否有 COVID-19基石之一。
吞吐量我們開(kāi)發(fā)了一個(gè)由 8 個(gè)機(jī)器人組成的系統(tǒng)(2 個(gè) A 站、4 個(gè) B 站增持能力、2 個(gè) C 站)共同努力,可以每 12 小時(shí)自動(dòng)準(zhǔn)備 12 個(gè) 96 孔板,或每天大約 2,400 次測(cè)試追求卓越。
8 個(gè)機(jī)器人系統(tǒng)的流程時(shí)間安排如下:
該系統(tǒng)加上備件和實(shí)驗(yàn)室安裝費(fèi)用為 100,000 美元逐漸完善,可用於監(jiān)測(cè)項(xiàng)目。我們可以在 3 月每週安裝 1 次合理需求,然後在 4 月每週安裝 4 次是目前主流。如果我們實(shí)現(xiàn)這一目標(biāo)充分發揮,我們預(yù)計(jì)在 6 月底之前在 Opentrons 系統(tǒng)上自動(dòng)完成 100 萬(wàn)次測(cè)試。
我們目前正在努力在加州帕洛阿爾託的開(kāi)放醫(yī)學(xué)研究所安裝第一個(gè)高通量系統(tǒng)充分發揮,並渴望使用我們的機(jī)器人來(lái)幫助實(shí)驗(yàn)室完成這個(gè)關(guān)鍵項(xiàng)目提高。
如果您有興趣與 Opentrons 合作以擴(kuò)展您的實(shí)驗(yàn)室運(yùn)行 COVID-19 測(cè)試的能力,請(qǐng)聯(lián)絡(luò) [email protected]的特性。
經(jīng)驗(yàn)豐富的服務(wù)團(tuán)隊(duì)和強(qiáng)大的生產(chǎn)支援團(tuán)隊(duì)為客戶提供無(wú)憂的訂單服務(wù)。