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利用甲板上的加熱器搖震模組實(shí)現(xiàn)SARS-CoV-2的中和抗體的自動(dòng)化
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在OT-2上執(zhí)行連續(xù)稀釋
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使用 OT-2 自動(dòng)化移液平臺(tái)進(jìn)行高效能核酸萃取
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簡(jiǎn)介高通量基因組分析是生命科學(xué)研究中不可或缺的重要工具標準,這項(xiàng)技術(shù)在推動(dòng)科研進(jìn)步方面發(fā)揮著至關(guān)重要的作用戰略布局。為了滿足了科學(xué)研究領(lǐng)域?qū)Ω咝С浞职l揮、?zhǔn)確製備方法的迫切需求,seqWell 的 Express Plex?Library Kit 提供了一種專門用於高通量製備質(zhì)粒和擴(kuò)增子文庫(kù)的解決方案發揮重要作用。在傳統(tǒng)的手工製備文庫(kù)方法中,完成 96 個(gè)樣品的製備需要花費(fèi)長(zhǎng)達(dá) 90 分鐘的時(shí)間支撐能力,其中手動(dòng)操作時(shí)間佔(zhàn)據(jù)了 30 分鐘大面積。這種方式不僅效率低下去完善,還容易因?yàn)槿藶橐蛩囟胝`差橋梁作用。為了改善此一狀況,本文比較了兩種文庫(kù)製備方法求索,一種是在 Opentrons Flex? 移液工作站上使用seqWell ExpressPlex? Library Kit 讓人糾結,另一種是手工製備文庫(kù)。透過(guò)結(jié)合 Flex 移液工作站與 seqWell ExpressPlex? Library Kit穩定發展,我們可以大幅縮短文庫(kù)製備時(shí)間基石之一,提高樣本通量。這種自動(dòng)化的解決方案不僅提升了製備效率增持能力,也降低了人為誤差的風(fēng)險(xiǎn)共同努力,為生命科學(xué)研究提供了更可靠、更有效率的工具追求卓越。 材質(zhì)與方法ExpressPlex 工作流程:根據(jù) Express Plex 的工作流程逐漸完善,我們?cè)?Flex 自動(dòng)化移液工作站上進(jìn)行文庫(kù)製備。實(shí)驗(yàn)過(guò)程中合理需求,我們輸入16 ng 的 pUC19 異常狀況,再將所有組分加入反應(yīng)板 , 用 3000 rpm 的轉(zhuǎn)速混勻 90 秒高效,然後進(jìn)行後續(xù)的文庫(kù)製備和混合步驟應用創新。最終的文庫(kù)在 NextSeq 2000 定序儀上進(jìn)行 2X150 bp 定序。
圖1.A ) Express Plex 工作流程包括將index 和DNA 加入反應(yīng)板(已含有酵素等混合物)持續創新,然後進(jìn)行擴(kuò)增緊迫性、混合和MAGwise 磁珠純化;B ) Flex 工作站包括吸頭盒生產能力、模組營造一處、轉(zhuǎn)板抓手和其他配件;C ) Flex 工作站板位設(shè)置實踐者,用於在擴(kuò)增後將4 個(gè)反應(yīng)板進(jìn)行文庫(kù)混合取得明顯成效。
結(jié)果
圖2 . A ) 結(jié)果顯示96 孔板中文庫(kù)數(shù)據(jù)變異係數(shù)( CV )為12.7%; B ) 95% 的文庫(kù)數(shù)據(jù)通過(guò)了數(shù)據(jù)預(yù)處理數據,為高質(zhì)量數(shù)據(jù)創新的技術,且超過(guò)90% 文庫(kù)質(zhì)量得分達(dá)到Q30; C ) 由Flex 製備的文庫(kù)比手動(dòng)製備的文庫(kù)濃度更高顯著。
圖 3 . 利用錯(cuò)開的開始時(shí)間快速增長,可以在 Opentrons FlexTM 上 3 小時(shí)內(nèi)製備 8 個(gè)獨(dú)立的 96 混 1 文庫(kù)。在 Flex 上設(shè)定第一塊反應(yīng)板後占,可以在 24 小時(shí)內(nèi)完成 768 個(gè)文庫(kù)的製備高質量。
結(jié)論在 Flex 移液平臺(tái)上製備的 96 個(gè) pUC19 質(zhì)粒樣本文庫(kù)呈現(xiàn)出了高度均一的質(zhì)量提供了有力支撐,充分證明了 Flex平臺(tái)在自動(dòng)化文庫(kù)製備方面的卓越性能。與手動(dòng)製備相比前景,自動(dòng)化文庫(kù)製備不僅穩(wěn)定性較佳進一步意見,而且文庫(kù)濃度更高。此外共享應用,超過(guò)95%的讀取成功通過(guò)定序儀質(zhì)檢 PF生產能力,這進(jìn)一步驗(yàn)證了自動(dòng)化製備流程的高效率和準(zhǔn)確性。 Flex 移液工作站支援在單次運(yùn)行中處理多達(dá) 384 個(gè)樣本取得了一定進展,大大提高了樣本處理效率完善好。透過(guò)合理安排時(shí)間,我們甚至可以在 24 小時(shí)內(nèi)處理高達(dá) 768 個(gè)樣本積極參與,從而滿足大規(guī)模高通量基因組分析的需求問題分析。在 Flex 平臺(tái)上自動(dòng)化 ExpressPlex? Library Prep Kit 工作流程,我們實(shí)現(xiàn)了從提取的質(zhì)粒/擴(kuò)增子 DNA 到資料生成的全流程自動(dòng)化交流研討。這個(gè)解決方案不僅簡(jiǎn)化了操作步驟更加完善,降低了人為誤差,而且顯著提高了實(shí)驗(yàn)效率和數(shù)據(jù)質(zhì)量建設應用,為生命科學(xué)研究領(lǐng)域的發(fā)展注入了新的動(dòng)力十大行動。
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