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新冠肺炎疫情如何徹底改變了生命科學

2020 年連續(xù)幾個月便利性,新聞報道都報道人們排隊等待數(shù)小時接受 SARS-CoV-2(導(dǎo)致 COVID-19 的新型冠狀病毒)檢測。數(shù)百萬人想知道自己是否感染了病毒,但檢測結(jié)果很難取得指導,許多人因此落選還不大。而那些能夠接受檢測的人往往要等待幾天或幾週才能得到結(jié)果,這使得整個過程對於阻止疾病傳播的努力幾乎毫無用處開放要求。檢測混亂的原因很複雜——需求量大處理方法、供應(yīng)稀缺、人員配置問題——但一個主要瓶頸很明顯:處理臨床檢測的實驗室根本無法滿足需求效率和安。大多數(shù)實驗室根本沒有足夠的能力來處理大量測試樣本設計能力。

移液器

事實上,COVID-19 疫情暴露了傳統(tǒng)實驗室的一個重大缺陷:大多數(shù)實驗室無法迅速從常規(guī)運作中轉(zhuǎn)變深入開展,以滿足全球衛(wèi)生危機迅速升級的需求更為一致。他們的設(shè)計和程序(設(shè)備、供應(yīng)鏈技術的開發、工作流程等)無法擴展以滿足診斷測試的迫切需求研究與應用。但一些創(chuàng)新實驗室能夠迅速提高以滿足需求。到年中不斷發展,曼哈頓的疫情應(yīng)對實驗室積極影響、歐洲的許多醫(yī)院診所以及世界各地的許多其他實驗室已經(jīng)徹底改革了他們的運作方式,每天處理數(shù)千個測試樣本緊密協作,有些甚至從頭開始重要手段。他們是如何做到的?他們採用了最新一代的實驗室自動化技術(shù)穩定性,其基石是 Opentrons 的液體處理機器人像一棵樹,這些機器人易於使用、開源去突破,也許最重要的是價格實惠能運用。

為我們其他人服務(wù)的機器人幾十年來,機器人一直被用於實現(xiàn)生命科學實驗室流程的自動化智能設備。但它們通常不太易於使用不可缺少。大多數(shù)都是使用專有軟體的複雜機器。它們需要陡峭的學習曲線特點,並將用戶鎖定在一個供應(yīng)商上積極回應。它們沒有提供科學合作的選擇,因此協(xié)議和結(jié)果很少共享又進了一步,從而延遲了科學進步多種場景。而且它們價格昂貴。相反規劃,Opentrons 的移液機器人是生命科學領(lǐng)域的真正的革命擴大公共數據。小型診所和研究計畫、生物技術(shù)新創(chuàng)公司帶動擴大、DIY 研究人員和許多其他人都可以使用它們核心技術體系,它們正在幫助世界各地的科學家快速解決冠狀病毒檢測瓶頸等重大問題,並合作探索氣候變遷和全球糧食短缺等其他重要問題持續發展。

「生命科學將成為 21 世紀最重要的技術(shù)必然趨勢,」Opentrons 聯(lián)合創(chuàng)始人兼首席產(chǎn)品長 Will Canine 說促進善治。 「我們正在建立一家讓每個人都能更輕鬆地使用生命科學工具的公司《鄻有?!瓜胂褚幌履愕膶嶒炇铱梢杂脵C器人做什麼實事求是?

以使用者為中心的設(shè)計:為科學家打造的工具

現(xiàn)在您不應(yīng)該使用專為自己而非供應(yīng)商的技術(shù)人員打造的工具嗎?

大多數(shù)實驗室科學家都經(jīng)歷過手工吸取數(shù)百或數(shù)千個液體樣本的枯燥乏味落到實處。這項工作可能需要數(shù)小時甚至數(shù)天的時間。一次失誤十分落實、一次計算錯誤都可能意味著整個實驗都受到影響倍增效應。重複性壓力損傷很常見。

標準實驗室自動化系統(tǒng)承諾可以減輕這種痛苦製造業。但它們在時間和金錢上都付出了高昂的代價優化服務策略。大多數(shù)這樣的系統(tǒng)都很複雜,操作起來很難發展基礎。僅僅訂購一個系統(tǒng)就意味著需要幾個月的時間進行規(guī)範和客製化建造過程兩個角度入手。然後,一旦交付和安裝同期,它們通常需要數(shù)週的用戶培訓生產效率。一名工作人員可能需要數(shù)月的時間才能學會如何使用它——而且他們是唯一可以操作它的人。如果出現(xiàn)問題效果,通常意味著關(guān)閉機器使用,直到供應(yīng)商可以派編程專家到現(xiàn)場排除故障。

此外密度增加,標準機器人通常是封閉系統(tǒng)有效性,由供應(yīng)商編程為僅使用供應(yīng)商的試劑完成一項特定任務(wù)。他們很難適應(yīng)其他工作——例如處理數(shù)以萬計的冠狀病毒檢測樣本機遇與挑戰。

極為簡單的機器人Opentrons 的實驗室機器人與眾不同廣泛關註。它們是極其簡單的開源即插即用系統(tǒng),無需任何編碼知識即可開始使用集成技術。與購買個人電腦類似就能壓製,一旦拆箱並放在實驗臺上,這些機器人就可以開始工作適應能力。有了 Opentrons 機器人效果,設(shè)計和運行實驗變得非常簡單∽懔藴蕚??梢允褂脽o程式碼的拖放模組開發(fā)協(xié)議合作關系,也可以從免費協(xié)議庫(其中包括 Opentrons 開發(fā)的協(xié)議以及世界各地科學家共享的協(xié)議)下載協(xié)議。那些想要發(fā)揮創(chuàng)意的人可以調(diào)整現(xiàn)有程式或使用開源 Python API 編寫自己的程式深刻內涵。 Opentrons 技術(shù)人員也可以在線上協(xié)助開發(fā)工作流程傳遞。將協(xié)定上傳到 Opentrons 應(yīng)用程式後融合,機器將完成剩下的工作。以前手工完成的實驗室工作(移液規模最大、連續(xù)稀釋穩中求進、NGS 文庫製備、PCR 樣品製備最深厚的底氣、qPCR 製備等)需要花費數(shù)小時協同控製,現(xiàn)在已完全自動化,讓您和您的同事可以專注於研究品質,而不是移液利用好。

「COVID-19 是 Opentrons 為應(yīng)對的挑戰(zhàn)。」— Opentrons 共同創(chuàng)辦人兼首席產(chǎn)品長 Will Canine

應(yīng)對 COVID-19 危機正如世界各地的實驗室在 2020 年發(fā)現(xiàn)的那樣解決問題,Opentrons 機器人的用戶友好功能也使許多實驗室能夠快速轉(zhuǎn)向應(yīng)對全球公共衛(wèi)生危機系列。 2020 年初,Opentrons 發(fā)表了一篇部落格文章相互配合,解釋瞭如何快速部署一組八個Opentrons 機器人來自動執(zhí)行冠狀病毒測試的幾個步驟——樣品接種慢體驗、RNA 提取和qPCR 設(shè)定——並每天運行2,400 次測試。幾週之內(nèi)智能化,新開發(fā)的 Opentrons COVID-19 測試系統(tǒng)(包括硬體和開源協(xié)議)已被全球數(shù)十個臨床站點訂購並部署科技實力。

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