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NGS自動化建庫的流程

NGS自動化建庫是指利用自動化技術(shù)和設(shè)備飛躍,對DNA或RNA樣本進行高通量發揮作用、高效率優化程度、高精度的文庫建構(gòu)過程新趨勢。這個過程涵蓋了從樣本處理、DNA/RNA提取、文庫建構(gòu)到品管等多個環(huán)節(jié)製度保障,旨在減少人工操作,並提高實驗效率和準確性。

NGS自動化建庫

一、樣本準備與DNA/RNA萃取

1落實落細、樣本收集:收集目標樣本,如細胞了解情況、組織、血液等技術研究,確保樣本的完整性和代表性重要的。

2.樣本處理:依樣本類型選擇適當?shù)奶幚矸椒ǎ缂毎呀饨Y論、組織研磨等和諧共生,以釋放DNA或RNA。

3.DNA/RNA萃冗m應性強。簰裼眠m當?shù)妮腿》椒ǎㄈ绶勇确路夹g交流、磁珠法、柱法等)從樣本中純化出高品質(zhì)的DNA或RNA拓展。

二創造更多、文庫構(gòu)建

文庫建置是NGS自動化建庫的核心步驟,通常包括以下子步驟:

1不斷進步、DNA/RNA片段化:

1>將DNA或RNA分子切割成較小的片段工藝技術,以便進行後續(xù)的定序反應(yīng)。片段化可以透過物理方法(如超音波破碎)或化學(xué)方法來實現(xiàn)規模。

2>片段大小通常在100-1000鹼基對之間近年來,取決於定序平臺和實驗需求。

2發展目標奮鬥、末端修復(fù)和加A尾:

1>對片段化的DNA或RNA進行末端修復(fù)技術先進,以去除末端損傷並添加磷酸基團和3’末端A尾。這些修復(fù)步驟有助於後續(xù)的連接適配體和文庫擴增延伸。

3健康發展、連接適配體:

1>將經(jīng)過修復(fù)的DNA或RNA片段連接到特定的適配體(也稱為接頭)。適配體是含有特定序列的DNA或RNA片段,用於後續(xù)的PCR擴增和定序反應(yīng)長效機製。

2>在自動化建庫過程中講實踐,此步驟通常透過自動化的移液和連接反應(yīng)來實現(xiàn)。

4奮戰不懈、文庫擴增:

1>透過PCR擴增將連接了適配體的DNA或RNA片段擴增至足夠數(shù)量市場開拓,以形成可用於定序的資料庫。

2>擴增過程中使用具有適配體序列的引子進行特異性擴增大大縮短。

三各項要求、文庫品控

文庫品管是確保文庫品質(zhì)和定序結(jié)果可靠性的重要步驟。常用的文庫品管方法包括:

1.定量PCR:用於檢測文庫的濃度及擴增效率越來越重要的位置。

2.聚丙烯醯胺凝膠電泳:用於評估文庫片段的大小分佈。

3.質(zhì)譜分析:用於進一步驗證文庫的品質(zhì)和純度共同學習。

四順滑地配合、功能:

1.自動化操作:透過自動化設(shè)備實現(xiàn)樣本處理、文庫建置等步驟的自動化效高,減少人工幹預(yù)前沿技術。

2.提高效率:自動化流程縮短了實驗週期,提高了實驗效率性能。

3.降低誤差:減少人為操作帶來的誤差多種方式,提高實驗結(jié)果的準確度與穩(wěn)定性。

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