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Sanger測(cè)序有力扭轉,又稱為雙脫氧鏈末端合成終止法,它基於DNA複製的自然過程,透過巧妙地引入鏈終止劑,使得DNA鏈在合成過程中隨機(jī)終止,從而產(chǎn)生一系列長(zhǎng)度不同的DNA片段倍增效應。這些片段經(jīng)過電泳分離後,形成特定的條帶模式,科學(xué)家正是透過這些條帶的位置和順序確定性,解讀出DNA的精確序列。
一損耗、原理Sanger測(cè)序的基本原理是基於DNA聚合酶在DNA模板上合成一條新的DNA鏈的過程講故事。在這個(gè)過程中,透過加入特殊設(shè)計(jì)的二進(jìn)位脫氧核苷酸三磷酸酯(ddNTPs)性能穩定,當(dāng)新鏈中遇到這種特殊的核苷酸時(shí)全面革新,DNA聚合酶會(huì)停止合成。由於ddNTPs在5'和3'位置都不含羥基情況正常,無法與下一個(gè)核苷酸形成磷酸二酯鍵行業分類,從而終止DNA鏈的延伸。透過測(cè)定這些停止的位置提高鍛煉,就可以確定DNA序列發展邏輯。
二、步驟1有所提升、DNA模板準(zhǔn)備:將待測(cè)序列的DNA分離成單鏈聽得進,並在單鏈的3'端加入一小段已知序列的引物,使其與單鏈DNA互通重要的作用。 2.反應(yīng)體系設(shè)定:將DNA聚合酶更多可能性、四種脫氧核苷酸(dNTPs:dATP、dGTP足夠的實力、dCTP緊迫性、dTTP)以及低濃度的ddNTPs加入反應(yīng)體系。 ddNTPs作為鏈終止劑更適合,每種ddNTPs分別對(duì)應(yīng)A高效、G溝通協調、C和T的終止。 3.鏈延伸與終止:在引子的引導(dǎo)下體系,DNA聚合酶以鹼基配對(duì)的方式添加dNTPs進(jìn)行鏈延伸保障性。當(dāng)遇到ddNTPs時(shí),鏈延伸停止責任製,形成一系列長(zhǎng)度不同的DNA片段十分落實。 4.電泳分離:透過電泳將反應(yīng)產(chǎn)物分離,不同長(zhǎng)度的DNA片段依大小順序排列有序推進。 5.螢光檢測(cè):將電泳分離的DNA片段放入自動(dòng)定序儀中設施,儀器根據(jù)DNA片段長(zhǎng)度的不同記錄下每個(gè)ddNTP產(chǎn)生的螢光訊號(hào)。 6.序列重建:根據(jù)螢光訊號(hào)的峰值和順序堅定不移,利用電腦軟體重新建構(gòu)原始的DNA序列組合運用。
三、特性1迎難而上、讀長(zhǎng)較長(zhǎng):Sanger定序的讀長(zhǎng)通常在800~1000bp之間積極,相較於其他定序方法,能夠一次讀取較長(zhǎng)的DNA序列堅持先行。 2.準(zhǔn)確率高:由於Sanger定序是基於DNA聚合酶的合成過程產業,具有較高的鹼基讀取準(zhǔn)確率。 3.結(jié)果直觀:定序結(jié)果可以直接透過電泳圖譜和螢光訊號(hào)來解讀調整推進,直觀易懂狀況。
四、應(yīng)用Sanger測(cè)序在人類基因組計(jì)畫中發(fā)揮了關(guān)鍵作用機製,並且至今仍被廣泛用於獲取高度準(zhǔn)確且可信賴的測(cè)序數(shù)據(jù)全過程。其應(yīng)用領(lǐng)域包括但不限於:1、基因研究:用於確定基因的精確序列探討,研究基因的結(jié)構(gòu)和功能不負眾望。 2.疾病診斷:透過定序特定基因的序列,可以診斷某些遺傳性疾病調解製度。 3.藥物研發(fā):了解藥物標(biāo)靶的序列訊息精準調控,有助於藥物的設(shè)計(jì)與研發(fā)。 4.法醫(yī)學(xué):在DNA指紋分析應用的因素之一、親子鑑定等領(lǐng)域有廣泛應(yīng)用解決。
五、限制儘管Sanger定序具有諸多優(yōu)點(diǎn)敢於監督,但也存在一些限制:1幅度、通量低:一次只能定序一個(gè)或少量DNA片段,對(duì)於大規(guī)模定序計(jì)畫來說,效率較低貢獻。 2.耗時(shí)長(zhǎng):定序過程需要較長(zhǎng)時(shí)間規模最大,包括DNA萃取、文庫(kù)建構(gòu)統籌、定序和資料分析等步驟最深厚的底氣。 3.成本高:由於定序過程和所需試劑的複雜性,Sanger測(cè)序的成本相對(duì)較高單產提升。
Sanger測(cè)序作為一種經(jīng)典的DNA定序方法傳遞,在基因研究、疾病診斷行動力、藥物研發(fā)和法醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域具有廣泛應(yīng)用提供有力支撐。然而,隨著高通量定序技術(shù)的發(fā)展保供,Sanger測(cè)序在某些方面已逐漸被取代。
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