Stephane Plaisance, VIB的分子生物學(xué)家組合運用，倡導(dǎo)引入自動(dòng)化技術(shù)來改進(jìn)實(shí)驗(yàn)室用於長讀長和短讀長測(cè)序的NGS文庫製備工作流程。

隨著定序服務(wù)的需求量成長迎難而上，實(shí)驗(yàn)室需要尋找能夠大幅提升工作產(chǎn)能的方法積極，而實(shí)驗(yàn)室自動(dòng)化就是簡化和擴(kuò)展定序操作的有效措施。比利時(shí)領(lǐng)先的生命科學(xué)研究所之一VIB Nucleomics的分子生物學(xué)家Stephane Plaisance選擇Opentrons自動(dòng)化移液平臺(tái)堅持先行，用於提升實(shí)驗(yàn)室的NGS 文庫製備工作效率產業。

複雜而乏味的實(shí)驗(yàn)室工作限制了實(shí)驗(yàn)室效率

VIB Nucleomics 是一個(gè)以定序?yàn)楹诵臉I(yè)務(wù)的研究所，致力於為 VIB 研究人員以及研究各種生命科學(xué)學(xué)科的外部學(xué)術(shù)和工業(yè)研究人員提供服務(wù)情況較常見。

VIB 的 NGS 分析專家Stephane Plaisance與其他九名實(shí)驗(yàn)室科學(xué)家一起共同完成實(shí)驗(yàn)工作可持續，包括 NGS 文庫製備、在不同平臺(tái)上進(jìn)行長讀長和短讀長測(cè)序以及全基因組表達(dá)分析體製。幾年前構建，他的團(tuán)隊(duì)面臨了實(shí)驗(yàn)產(chǎn)出效率低的問題。冗長乏味的移液操作限制了他們的工作效率，並給他們的實(shí)驗(yàn)室技術(shù)人員帶來了工作壓力共創輝煌。他們想用自動(dòng)化來改善工作流程具有重要意義，但當(dāng)時(shí)許多大型 NGS 機(jī)器人不具備能夠適應(yīng)實(shí)驗(yàn)室專案多樣性的能力。

「 我們開始關(guān)注大型大部分、更昂貴的機(jī)器人強大的功能，但這些機(jī)器人更適合高吞吐量的日常工作，而我們需要根據(jù)我們承擔(dān)的每個(gè)項(xiàng)目調(diào)整我們的流程解決方案。這是我們最終選擇Opentrons的原因預期，它具備較高的靈活性和性價(jià)比。

–Stephane Plaisance

VIB將實(shí)驗(yàn)室自動(dòng)化整合到定序核心工作流程中

在進(jìn)行了全面的市場分析後幅度，評(píng)估了產(chǎn)品性價(jià)比和使用靈活性，Stephane選擇了 Opentrons OT-2 自動(dòng)化移液機(jī)器人重要的作用，OT-2受到實(shí)驗(yàn)室工作人員的一致好評(píng)貢獻。根據(jù)實(shí)驗(yàn)室的特定應(yīng)用需求，他們逐漸調(diào)整了最適合該實(shí)驗(yàn)室的實(shí)驗(yàn)流程協(xié)議力度。在他們購買了第一臺(tái)OT-2後不到兩年明確了方向，VIB Nucleomics 又購買了四臺(tái)，現(xiàn)在有五臺(tái) OT-2 自動(dòng)化移液機(jī)器人協(xié)助他們完成不同的實(shí)驗(yàn)室任務(wù)勇探新路。其中三臺(tái)用於 Illumina NGS 文庫製備單產提升，負(fù)責(zé)自動(dòng)化PCR前處理和後處理工作。

「 對(duì)於Illumina DNA 文庫準(zhǔn)備試驗，我們?cè)趯Ｓ玫腜CR 前處理實(shí)驗(yàn)室中對(duì)一臺(tái)OT-2進(jìn)行初始樣本操作勞動精神，然後我們將孔板從那個(gè)房間中取出進(jìn)行PCR，然後我們使用第二臺(tái)OT-2進(jìn)行PCR後處理工作製度保障。

–Stephane Plaisance

一臺(tái)OT-2用於研發(fā)預下達，最後一臺(tái)OT-2用於在文庫製備完成後對(duì)樣本進(jìn)行重新混合。 OT-2的靈活性和Opentrons團(tuán)隊(duì)提供的產(chǎn)品支持統籌推進，再加上Plaisance和VIB團(tuán)隊(duì)的創(chuàng)造力方案，使得對(duì)該設(shè)施投資推動(dòng)實(shí)驗(yàn)室自動(dòng)化取得了巨大成功。同時(shí)了解情況，一個(gè)包含1萬個(gè)樣本的宏基因組計(jì)畫已經(jīng)成功使用OT-2管線執(zhí)行深入，更多的大型計(jì)畫即將到來！

了解更多關(guān)於在OT-2上自動(dòng)化NGS文庫製備重要的。