在萬(wàn)聖節(jié)的盛大日子裡傳承,國(guó)際基因工程機(jī)器設(shè)計(jì)競(jìng)賽( iGEM )基金會(huì)於馬薩諸塞州的波士頓舉辦了年度學(xué)生合成生物學(xué)競(jìng)賽表現明顯更佳。這是一場(chǎng)匯聚了世界各地生物學(xué)和工程專業(yè)學(xué)生的盛會(huì)狀態,他們齊心協(xié)力技術節能,展示了幾個(gè)月來(lái)精心打造的項(xiàng)目指導,以展現(xiàn)合成生物學(xué)在社區(qū)和全球範(fàn)圍內(nèi)所產(chǎn)生的深遠(yuǎn)社會(huì)影響力。
Opentrons 非常敬重 iGEM 的使命和承諾,因此連續(xù)第二年為十支 iGEM 團(tuán)隊(duì)提供了 OT-2 移液機(jī)器人以及我們其他開(kāi)源工具的使用權(quán)流動性。這些來(lái)自全球各地的參賽團(tuán)隊(duì)攜手合作鍛造,共同推動(dòng)合成生物學(xué)的發(fā)展,從為亞熱帶氣候地區(qū)提供水淨(jìng)化方案持續創新,到從海洋生物中發(fā)掘新的生物材料改善,他們的努力不斷改變世界。
在 2019 年的 iGEM 競(jìng)賽中協調機製,每個(gè)專案都是團(tuán)隊(duì)合作的成果信息化,團(tuán)隊(duì)成員走出自己的舒適區(qū),共同為科學(xué)進(jìn)步奮鬥實踐者。經(jīng)過(guò)這次獨(dú)特且難忘的學(xué)習(xí)經(jīng)歷取得明顯成效,他們也取得了非凡的成果。
加州大學(xué)戴維斯分校的團(tuán)隊(duì)展開(kāi)了一項(xiàng)了不起的計(jì)畫(huà)數據。他們巧妙地利用 iGEM 競(jìng)賽標(biāo)準(zhǔn)發(fā)放包中的螢光染料和微球體創新的技術,設(shè)計(jì)出一種既適用於手動(dòng)操作又適用於 OT-2 執(zhí)行的梯度稀釋方案。他們將此方案分享給其他七所學(xué)校顯著,並請(qǐng)他們報(bào)告每個(gè)操作版本的結(jié)果快速增長。
「這種方法有效地測(cè)試了 OT-2 的精確度,」加州大學(xué)戴維斯分校的團(tuán)隊(duì)成員占、遺傳學(xué)和基因組學(xué)專業(yè)的學(xué)生Jodi Jacobs 表示高質量。透過(guò)徵求外部回饋,加州大學(xué)戴維斯分校能夠評(píng)估他們對(duì) OT-2 表現(xiàn)的體驗(yàn)與其他學(xué)校相比如何動手能力,從而為他們提供更準(zhǔn)確的評(píng)估標(biāo)準(zhǔn)逐步改善,同時(shí)促進(jìn) iGEM 所倡導(dǎo)的跨學(xué)科合作。此外提升,考慮到其他團(tuán)隊(duì)提供的一致性結(jié)果持續,「這款機(jī)器人的表現(xiàn)相當(dāng)出色,」Jacobs 表示再獲,「我們非常喜歡使用它產品和服務。」她告訴我們體驗區,「我們實(shí)際上正在指導(dǎo)實(shí)驗(yàn)室空間中的一支新團(tuán)隊(duì)使用OT-2 進(jìn)行ELISA 測(cè)定增多。 “他們非常興奮,”Jacobs說(shuō)有望,“擁有一臺(tái) Opentrons 機(jī)器人真的太好了進一步推進。”
其他團(tuán)隊(duì)在實(shí)驗(yàn)執(zhí)行過(guò)程中也學(xué)到了寶貴的經(jīng)驗(yàn)方案,並認(rèn)識(shí)到實(shí)驗(yàn)過(guò)程不僅包括實(shí)驗(yàn)室規(guī)程應用的選擇,還包括其他因素十大行動。例如,ITESO Universidad Jesuita De Guadalajara 團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)了宣傳的重要性背景下。他們的學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)以前從未參加過(guò) iGEM 競(jìng)賽綜合措施,因此為了參賽,他們必須向關(guān)鍵利益相關(guān)者證明其專案的重要性自然條件,以獲得資金和指導(dǎo)老師的支持設計標準。如果沒(méi)有這些支持,他們將無(wú)法參賽互動互補。
在獲得基本的資金支持後發揮重要帶動作用,ITESO 團(tuán)隊(duì)繼續(xù)進(jìn)行他們的計(jì)畫(huà):利用藍(lán)藻淨(jìng)化鹹水,以減少二氧化碳的排放意料之外,並有望減緩氣候變遷重要方式。這是一個(gè)了不起的項(xiàng)目,雖然他們沒(méi)有取得理想的進(jìn)展系統,也沒(méi)有能夠?qū)T-2 完全整合到他們的實(shí)驗(yàn)室設(shè)置中非常重要,但團(tuán)隊(duì)成員仍然與全球同行建立了牢固的聯(lián)繫,並且因此受到啟發(fā)空間廣闊,繼續(xù)在社區(qū)中倡導(dǎo)改變營造一處。
這種精神正是 iGEM 所倡導(dǎo)的。
萊頓大學(xué)同樣團(tuán)結(jié)一致知識和技能,攻克了團(tuán)隊(duì)遇到的挫折與挑戰(zhàn)取得顯著成效。每天早晨,團(tuán)隊(duì)成員會(huì)聚集在一起更加廣闊,討論並分配當(dāng)天的任務(wù)規劃,以及回顧前一天遇到的問(wèn)題。萊頓團(tuán)隊(duì)的主題專注於利用 suckerin 創(chuàng)造新的生物材料來(lái)治療燒傷患者可以使用,這讓他們認(rèn)識(shí)到進入當下,設(shè)定現(xiàn)實(shí)的期望與朝著充滿熱情的願(yuàn)景努力同樣重要。萊頓團(tuán)隊(duì)的科學(xué)研究經(jīng)理 Jo-Anne Verschoor 解釋了過(guò)度自信如何阻礙了他們的克隆工作效高化。萊頓團(tuán)隊(duì)沒(méi)有使用iGEM 競(jìng)賽發(fā)放包中推薦的質(zhì)粒新體系,而是選擇了他們自己的質(zhì)粒,因?yàn)椤?iGEM 的質(zhì)粒非常適合克隆創造,但不適合生產(chǎn)不難發現。」團(tuán)隊(duì)幾週來(lái)一直在努力設備製造,但都沒(méi)有成功發展需要,最後他們回到了最初的質(zhì)粒上,結(jié)果立刻奏效了管理。這花費(fèi)了大量時(shí)間和故障排除工作顯示,讓萊頓團(tuán)隊(duì)幾乎沒(méi)有時(shí)間重新設(shè)計(jì)他們的自動(dòng)化實(shí)驗(yàn)生動。然而,他們成功地參與了加州大學(xué)戴維斯分校的協(xié)作測(cè)量計(jì)畫(huà)創新能力。
在Opentrons贊助的十支團(tuán)隊(duì)中,有七支獲得了獎(jiǎng)牌或賽道獎(jiǎng)範圍,以表彰他們傑出表現(xiàn):
金牌得主:
銀牌得主:
特別獎(jiǎng):
我們?yōu)樗麄兊某删透械津湴燎蟮闷胶?,但更讓我們自豪的是所有團(tuán)隊(duì)的專案都展現(xiàn)出了極高的雄心壯志:
Opentrons 也在 iGEM 的盛大集會(huì)上舉辦了一場(chǎng)實(shí)戰(zhàn)工作坊活動(dòng)又進了一步。策略計(jì)畫(huà)總監(jiān) Kristin Ellis 和高級(jí)軟體經(jīng)理 Toma Morris 帶領(lǐng)參與者了解了高靈活且可客製化的 Opentrons 的 OT-2自動(dòng)化移液平臺(tái)平臺建設。在講解了OT-2 的開(kāi)源程式選項(xiàng)並介紹了其他出色功能(如新的熱循環(huán)模組)後,Ellis 為參與者提供了一個(gè)實(shí)踐開(kāi)源專案的機(jī)會(huì):使用Protocol Designer 建立自訂孔板圖案貢獻力量。 Ellis 問(wèn)了哪些參與者有電腦使用,有 9 隻手舉了起來(lái);學(xué)生們分成小組發行速度,使用 Protocol Designer 學(xué)習(xí)設(shè)計(jì)自動(dòng)化協(xié)議並創(chuàng)建他們可以在當(dāng)天晚些時(shí)候在Opentrons 展位上領(lǐng)取的自定義孔板圖案更加堅強。
我們由衷感謝這些團(tuán)隊(duì)和 iGEM 基金會(huì),激勵(lì)我們繼續(xù)致力於為生物學(xué)家創(chuàng)造低成本實(shí)驗(yàn)室自動(dòng)化解決方案性能。透過(guò)支持合成生物學(xué)及其新興領(lǐng)導(dǎo)者使用可訪問(wèn)的技術(shù)初步建立,我們正在賦予下一代科學(xué)家合作綜合運用、創(chuàng)新和推進(jìn)生物學(xué)前沿的能力。我們期待看到這些學(xué)生接下來(lái)的成就的方法!
如果您想知道自動(dòng)化如何在您的實(shí)驗(yàn)室中發(fā)揮作用實事求是?歡迎向我們諮詢。
所有照片版權(quán)歸於iGEM基金會(huì)和Jacob Knight落到實處。
經(jīng)驗(yàn)豐富的服務(wù)團(tuán)隊(duì)和強(qiáng)大的生產(chǎn)支援團(tuán)隊(duì)為客戶提供無(wú)憂的訂單服務(wù)建強保護。