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2020 年 58 月 24 日

客戶案例 | Zymo Research 使用OT-2進(jìn)行新冠病毒檢測(cè)

Zymo Research為從事新冠病毒檢測(cè)的研究人員提供生物醫(yī)學(xué)工具和服務(wù),包括為Opentrons客戶提供支援。

Zymo Research 是一家為研究人員提供生物醫(yī)學(xué)工具和服務(wù)的企業(yè)進入當下。目前研究與應用,他們正在幫助各大實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行新冠病毒檢測(cè)。為此他們創(chuàng)建了一個(gè)從樣本收集用上了、RNA 提取到基於rRT-PCR檢測(cè)的完整的新冠病毒檢測(cè)工作流程提升行動,該工作流程已經(jīng)進(jìn)入FDA的緊急使用授權(quán)前審查狀態(tài)。 Zymo Research 作為Opentrons 的共同開(kāi)發(fā)測(cè)試系統(tǒng)合作夥伴關註,Zymo Research 願(yuàn)意為任何有興趣將該工作流程加載到Opentrons 液體處理機(jī)器人上的組織提供技術(shù)支援研究進展。

今天我們邀請(qǐng)到 Zymo 的研究專家 Casey Cruz 為大家分享他們?nèi)绾问褂?OT-2 進(jìn)行新冠檢測(cè),協(xié)助對(duì)抗全球疫情連日來。

Opentrons: 疫情爆發(fā)前快速融入,您的日常生活是怎麼樣的?

Casey Cruz: 在疫情爆發(fā)前系統,我們最初購(gòu)買(mǎi)OT-2 是為了做RNA-Seq 文庫(kù)製備的增強,後期假如我們的工作不再需要用於新冠檢測(cè),我們?nèi)匀环浅F诖cOpentrons合作開(kāi)展這個(gè)計(jì)畫(huà)交流等。為此更加廣闊,我們甚至編寫(xiě)了一個(gè)用於rRT-PCR 設(shè)定的腳本,並希望將其應(yīng)用於Pangea 實(shí)驗(yàn)室的SARA-CoV-2 實(shí)驗(yàn)室開(kāi)發(fā)的測(cè)試(LDT)數字化。身為RiboFree RNA-Seq試劑盒的產(chǎn)品經(jīng)理方便,我被OT-2的價(jià)格和Opentrons 的開(kāi)源社群所吸引。在專案初步驗(yàn)證期它的各方面表現(xiàn)都很棒各領域,但由於疫情爆發(fā)應用領域,我不得不暫時(shí)改變研究方向,轉(zhuǎn)而投入?yún)f(xié)助新冠病毒檢測(cè)專案進行培訓。

Opentrons: 您現(xiàn)在所做的工作與您的日常工作內(nèi)容有什麼不同嗎發展機遇?

Casey: 我們現(xiàn)在的工作是提交關(guān)於新冠病毒檢測(cè)工作流程的 FDA 緊急使用授權(quán)申請(qǐng)。這個(gè)計(jì)畫(huà)工作流程包含從樣本採(cǎi)集到RNA 萃取再到rRT-PCR 檢測(cè)法治力量,從運(yùn)輸介質(zhì)DNA/RNA 保護(hù)劑開(kāi)始穩定,在樣本收集和運(yùn)送過(guò)程中需要把新冠病毒完全滅活,這樣就可以確保RNA 在室溫下能夠最高保存30天供給。這是在實(shí)際應(yīng)用中一個(gè)很好的方法優勢與挑戰,使生物樣本中的 DNA/RNA 可以在沒(méi)有冷鏈的情況下保存,當(dāng)樣本被運(yùn)回實(shí)驗(yàn)室就可以用於自動(dòng)化樣本處理工作流程解決方案。

接下來(lái)趨勢,我們使用Quick-DNA/RNA Viral MagBead Kit 試劑盒進(jìn)行RNA 萃取,並使用Quick-SARS-CoV-2 rRT-PCR Test Kit 試劑盒完成新冠病毒檢測(cè)的工作流程上高質量。

使用 Quick-DNA/RNA Viral MagBead 試劑盒的 Zymo Research 數(shù)據(jù)一站式服務。圖片來(lái)源: Zymo Research

Pangea 實(shí)驗(yàn)室是一家獲得CLIA 認(rèn)證和CAP 認(rèn)證的臨床測(cè)試實(shí)驗(yàn)室廣度和深度,這裡的SARA-CoV-2 實(shí)驗(yàn)室開(kāi)發(fā)測(cè)試(LDT) 是從收到樣本開(kāi)始,然後他們使用KingFisher 提取RNA引領作用,使用Quick-SARS- CoV-2 rRT-PCR 試劑盒檢測(cè)新冠病毒加強宣傳。此工作流程使用的試劑是 Zymo Research 目前正在等待美國(guó)食藥監(jiān)局(FDA)緊急使用授權(quán)(EUA)的試劑。讓這個(gè)系統(tǒng)啟動(dòng)並運(yùn)行用的舒心,並為申請(qǐng)緊急使用授權(quán)(EUA)進(jìn)行驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)技術發展,是 Pangea 團(tuán)隊(duì)目前正在做的主要工作。

Opentrons: 新冠病毒檢測(cè)專案中深入開展,最讓您感到興奮的是什麼更為一致?

Casey: 最讓我興奮的是,這個(gè)計(jì)畫(huà)在這個(gè)關(guān)鍵時(shí)刻正在幫助有需要的人技術的開發。很多時(shí)候研究與應用,當(dāng)你做研究時(shí),你會(huì)感覺(jué)與結(jié)果相去甚遠(yuǎn)更高效,但這次不同全面協議。透過(guò)這個(gè)新冠檢測(cè)工作流程,我能明顯地感受到我們的技術(shù)正在幫助醫(yī)療專業(yè)人員並幫助阻止疾病的傳播具體而言,這將關(guān)係到許多人的生命健康工具。我很感激能夠?yàn)榇俗龀鲐暙I(xiàn),這對(duì)世界將產(chǎn)生持久的影響並真正發(fā)揮作用喜愛。

Opentrons: 關(guān)於這個(gè)項(xiàng)目重要的角色,您認(rèn)為關(guān)鍵要點(diǎn)是什麼?

Casey: 我認(rèn)為關(guān)鍵在於確保安全運(yùn)輸臨床樣本向好態勢。 DNA/RNA 保護(hù)劑可確保病毒滅活平臺建設,從而確保進(jìn)行診斷測(cè)試的人員安全;檢測(cè)人員需要做的就是對(duì)試管外部進(jìn)行去污處理註入了新的力量,確保樣本就可以安全使用重要的作用。我們非常重視確保從樣本採(cǎi)集開(kāi)始的診斷全過(guò)程安全性和準(zhǔn)確性。

如果您想在自己的實(shí)驗(yàn)室中部署同款 Opentrons 系統(tǒng)去創新,請(qǐng)聯(lián)絡(luò) [email protected]足夠的實力。

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