Kristin Ellis 最近造訪了位於加州聖拉斐爾的 Biomarin 製藥公司總部解決方案。在那裡，她與 Biomarin 蛋白質(zhì)生物化學(xué)的高級(jí)研究助理 Elaine Phan 進(jìn)行了交談。 Elaine Phan 一直在使用 OT-1 PRO進(jìn)行蛋白質(zhì)定量分析。

（為了提供您更簡(jiǎn)潔易懂的閱讀體驗(yàn)重要作用， 本篇報(bào)導(dǎo)已編輯優(yōu)化）營造一處。

Kristin: 我非常高興聽到Biomarin如何利用 OT-1 PRO追求卓越，那麼集中展示，首先，能否分享一下您使用 Opentrons 的體驗(yàn)？

Elaine: 非常棒的必然要求！你們提供的協(xié)議讓我得以順利執(zhí)行研究成果。目前為止，我主要是根據(jù)你們給我的自動(dòng)化Bradford Assay 的說明進(jìn)行操作完善好，然後在你們的網(wǎng)站上尋找如何寫協(xié)議的細(xì)節(jié)大面積。我想你們有一個(gè)專門的頁面供人學(xué)習(xí)吧？

Kristin: 您是指Opentrons的開源API文件嗎問題分析？

Elaine: 對(duì)培養，還有 Artyom 推薦的 Python 學(xué)習(xí)平臺(tái) SoloLearn。起初更加完善，我是根據(jù) Will 在部落格上分享的 JSON協(xié)議進(jìn)行學(xué)習(xí)的形式，這讓我更容易理解 Python 的相關(guān)內(nèi)容。

Kristin: 哦支撐作用，真的左右？您為什麼這麼認(rèn)為？

Elaine: 因?yàn)橐婚_始綜合措施，我覺得 Python 看起來比較複雜可靠保障。但透過閱讀你們提供的 JSON 說明，我能夠更好地理解並編寫各種命令建言直達。當(dāng)我拿到硬體後多種，我能夠迅速組裝機(jī)器將進一步，並調(diào)整現(xiàn)有的 Bradford Assay 程式碼充分發揮。對(duì)我而言，我已經(jīng)進(jìn)行了十多年的加樣工作成就，這款裝置真的減輕了我手臂的負(fù)擔(dān)重要方式。

Kristin: 你能否簡(jiǎn)單介紹一下你們團(tuán)隊(duì)的工作內(nèi)容？

Elaine: 我們專注於蛋白質(zhì)純化系統，屬於蛋白質(zhì)科學(xué)研究團(tuán)隊(duì)非常重要。我們的工作流程非常龐大，而我還處於研究的初級(jí)階段空間廣闊。我們?nèi)〉迷S多餾分營造一處，並需要確定每個(gè)餾分的純度。這意味著我們需要進(jìn)行凝膠電泳知識和技能、Bradford實(shí)驗(yàn)等操作取得顯著成效，然後集中所有所需的材料。接下來實現，我們要製備足夠的材料不容忽視，用於臨床前樣本，以展示藥物的療效。簡(jiǎn)而言之說服力，我們需要製備足夠的藥物搶抓機遇，以便提供給其他團(tuán)隊(duì)進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。一旦完成這些實(shí)驗(yàn)表示，我們將藥物用於小鼠模型全面闡釋，觀察其效果。擁有 Opentrons 機(jī)器人可以大幅加快這一流程拓展基地，使其更有效率集中展示。

Kristin: 你們測(cè)試的蛋白質(zhì)最初是從哪裡取得的？

Elaine: 我們有另一個(gè)團(tuán)隊(duì)專門進(jìn)行細(xì)胞培養(yǎng)分享。他們?yōu)槲遗囵B(yǎng)所需的細(xì)胞共享。我們使用哺乳動(dòng)物細(xì)胞和 E.coli 兩種細(xì)胞。目前方式之一，我主要研究 E. coli生動，並在其上表達(dá) His-tag。這個(gè)過程相對(duì)簡(jiǎn)單創新能力。透過 His 結(jié)合柱將蛋白質(zhì)結(jié)合新品技，然後洗脫，再放入餾分中求得平衡，就可以觀察到蛋白質(zhì)的位置紮實做。

Kristin: 這樣你們就能觀察到蛋白質(zhì)的表現(xiàn)量了。

Elaine: 是的至關重要，流程大致上是這樣的提供深度撮合服務。首先，進(jìn)行加載步驟的發生，將樣本裝入儀器中組成部分，未與柱子結(jié)合的物質(zhì)會(huì)流出。這樣新的動力，所有不需要的雜質(zhì)都可以被移除的過程中。接下來是洗滌步驟，用於沖洗柱子廣泛關註。然後透過咪唑梯度將材料洗脫出來促進進步，最終只有我想要結(jié)合的物質(zhì)才會(huì)與柱子結(jié)合。將這些與柱子結(jié)合的物質(zhì)收集起來優勢領先，並分成多個(gè)餾分迎來新的篇章。然後透過凝膠電泳分析其純度。我還要進(jìn)行 Bradford 實(shí)驗(yàn)改善，以量化所有蛋白質(zhì)並顯示回收率空白區。之後，可以對(duì)每個(gè)餾分進(jìn)行凝膠電泳，或?qū)讉€(gè)餾分合併後進(jìn)行凝膠電泳形勢，然後透過 Western blot 觀察蛋白質(zhì)的位置實踐者。這就是我們通常所做的工作！

我們最終的目標(biāo)是讓 OT-1 能夠進(jìn)行 ELISAs 實(shí)驗(yàn)約定管轄。我們需要展示活性等數(shù)據(jù)數據。我個(gè)人不從事 ELISAs 方面的工作，但其他人會(huì)進(jìn)行這方面的研究大幅拓展。因此發行速度，一旦他們確定了工作流程，我就可以從他們那裡獲得 ELISAs和其他活性檢測(cè)方法與時俱進，並嘗試將其應(yīng)用於機(jī)器人性能。

Kristin: 是的，這也是我們目前與其他幾個(gè)團(tuán)隊(duì)合作的項(xiàng)目之一——我們希望實(shí)現(xiàn)各種類型的 ELISAs 的自動(dòng)化綜合運用。不僅是單一的 ELISA 供給，還包括 MSD 板、Luminex 等我們可以開發(fā)的任何東西實事求是。這是我們想要進(jìn)入的一個(gè)領(lǐng)域進行探討。

Elaine: 很好！一旦我決定開始這方面的研究服務水平，我將向您諮詢更多問題最新。

Kristin: 當(dāng)然！這就是我們存在的意義處理方法，也是我們建立這個(gè)社群的原因重要作用！

你已經(jīng)使用 OT-1 PRO 一個(gè)半月了。你說你已經(jīng)從事生物學(xué)和手動(dòng)移液工作 10 年了活動上。然後你得到了OT-1 PRO有望，並開始學(xué)習(xí)如何編程和如何圍繞自動(dòng)化建立實(shí)驗(yàn)進一步推進。與手動(dòng)操作相比導向作用，程式設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)對(duì)你的實(shí)驗(yàn)室工作體驗(yàn)有何影響？

Elaine: 這臺(tái)機(jī)器完全顛覆了我的認(rèn)知應用的選擇。我一直從事生物學(xué)和手動(dòng)移液工作 10 年十大行動，從未想過能接觸到這個(gè)全新的領(lǐng)域。現(xiàn)在背景下，這臺(tái)機(jī)器幾乎成了我的實(shí)驗(yàn)助手綜合措施。它幫我處理了很多日常的實(shí)驗(yàn)工作，例如運(yùn)行Bradfords 和其他一些常規(guī)實(shí)驗(yàn)自然條件，這為我節(jié)省了大量時(shí)間≡O計標準，F(xiàn)在，我可以把更多精力投入閱讀文獻(xiàn)、理解實(shí)驗(yàn)原理和改進(jìn)實(shí)驗(yàn)方法發揮重要帶動作用。此外意向，學(xué)會(huì)程式設(shè)計(jì)後，我彷彿打開了新世界的大門至關重要。我現(xiàn)在腦海中充滿了各種想法發展空間，只是還沒有完全表達(dá)出來，因?yàn)檫€有許多東西要學(xué)習(xí)有所應。

而且這臺(tái)機(jī)器有這麼多的可能性——例如使用不同的移液器足了準備。即使你們說這臺(tái)機(jī)器可能無法與Rainin 移液器搭配使用，我還是想試試看著力提升。我不會(huì)輕易放棄深刻內涵，總是想挑戰(zhàn)新事物！

Kristin: 我們當(dāng)然不會(huì)阻止你融合！這也是我們讓 Opentrons 平臺(tái)保持開源的原因之一交流等，這樣當(dāng)我們對(duì)你說「哦，你知道嗎規劃，我們這邊不這麼做」時(shí)提高，你就可以自己解決！

我知道你覺得程式設(shè)計(jì)部分很酷進入當下，而且你已經(jīng)開始調(diào)整硬體了紮實。那麼，你對(duì)硬體模組化以及可以隨意組合東西有什麼看法新體系？

Elaine: 這真是太棒了投入力度，因?yàn)槲铱梢园讶魏螙|西放在平臺(tái)上！我以前甚至沒有考慮過這些好用的東西（指著裝有Beckman Coulter 儲(chǔ)液池的吸頭架）不難發現，因?yàn)槲覀兺ǔＪ褂靡淮涡缘乃苣z吸頭架貢獻法治，但現(xiàn)在我可以想到一百萬種可以放在那裡的液體。

Biomarin 公司已經(jīng)將 Opentrons 的吸頭架重新利用發展需要，改造成了 Beckman Coulter 儲(chǔ)液池的支架攻堅克難。

Elaine: 我還想認(rèn)識(shí)其他從事這方面工作的人，了解他們的想法顯示。我知道你們?cè)?Slack 頻道上有小型的社區(qū)雙向互動，但如果我能與人們見面，解釋我正在做的事情設計能力，同時(shí)他們也向我解釋他們?cè)谧鍪颤N品牌，那麼這些想法真的會(huì)匯聚在一起。

Kristin: 聽起來你對(duì)社區(qū)方面也很有興趣更為一致。作為一個(gè)在科學(xué)領(lǐng)域經(jīng)驗(yàn)豐富的人應用，你認(rèn)為這種社群對(duì)於發(fā)展和建構(gòu)非常重要嗎建議？

Elaine: 我認(rèn)為是的，尤其對(duì)我而言相貫通，因?yàn)楝F(xiàn)在我是公司裡唯一一個(gè)使用它的人用的舒心。所以除了你們，我真的不知道該和誰討論這臺(tái)機(jī)器能做些什麼更廣泛的事集聚效應。例如集成，你今天提到有人在使用磁珠、亞馬遜的 Alexa等互動講。實(shí)際上穩定性，我的程式設(shè)計(jì)等級(jí)還處於初級(jí)階段。我能進(jìn)行多少更多的程式設(shè)計(jì)工作過程中？我該如何開始學(xué)習(xí)去突破？

Kristin: 這就是我們Protocol Library背後的理念。最近我們重新推出了這個(gè)庫達到，我們之所以說“我們與Biomarin 合作開發(fā)了 Bradford Assay”智能設備，部分原因是為了讓人們可以在圖書館中看到這個(gè)方案。然後蓬勃發展，如果他們對(duì)這個(gè)方案有疑問特點，可以進(jìn)入社區(qū)頻道問你們：「嘿大型，你是如何開發(fā)這個(gè)方案的體驗區？」此外產能提升，用戶越多更讓我明白了，我們添加的方案就越多。然後廣泛關註，你可以下載它們查看程式碼並開始理解集聚效應，就像你最初開始時(shí)一樣完成的事情。

Elaine: 是的深度，那將會(huì)非常有幫助帶動擴大。能夠在看到方案後向他們提問，使得 Protocol Library 也成為對(duì)話的起點(diǎn)開拓創新。我們實(shí)際上計(jì)劃引入一個(gè)平臺(tái)持續發展，而我開始意識(shí)到你們可以做他們能做的所有事情。他們有一些很好的想法綜合運用，而他們只是拖放操作供給，這對(duì)於不懂編程的人來說真的很簡(jiǎn)單……但如果我能學(xué)習(xí)編程的方法，我就可以讓OT-1 來完成它體系，而且它的成本非常低廉，這讓我感到非常興奮帶動產業發展。

Kristin: 這個(gè)觀點(diǎn)其實(shí)很有趣責任製！那麼十分落實，如果你回顧一下職涯的起點(diǎn)，假設(shè)你一開始就擁有像 OT-1 這樣的工具規則製定，像是這個(gè)和一臺(tái) 3D 列印機(jī)製造業，那會(huì)帶來哪些可能性呢？

Elaine: 那將會(huì)是太棒了關規定！我現(xiàn)在想想發展基礎，如果當(dāng)時(shí)有這個(gè)工具，我可以用它來寫很多實(shí)驗(yàn)建強保護。很多事情同期，尤其是分離……你知道，有時(shí)候你必須加班到很晚才能完成某些工作使命責任，因?yàn)椴荒艿却Ч?，也不能放入冰箱，否則蛋白質(zhì)會(huì)沉澱合規意識。所以密度增加，你只能完成到某個(gè)階段，然後停下來或冷凍創新內容。在很多這樣的情況下機遇與挑戰，如果有助手幫忙，那就太好了善於監督。

Kristin: 你是如何決定從 Bradford Assay 開始的提單產？這是你們實(shí)驗(yàn)室的迫切需求嗎？

Elaine: 是的至關重要，這是每個(gè)人都要運(yùn)行的實(shí)驗(yàn)發展空間，也是每個(gè)新來的人都要學(xué)習(xí)的基礎(chǔ)知識(shí)，因?yàn)槊總€(gè)人都需要時(shí)時(shí)刻刻知道蛋白質(zhì)的濃度有所應。所以我們想足了準備，如果機(jī)器能運(yùn)行這個(gè) Bradford Assay，那麼它也能運(yùn)行 ELISAs著力提升，可以做凝膠製備深刻內涵，可以做標(biāo)準(zhǔn)曲線。 Bradford Assay 只是每個(gè)人在實(shí)驗(yàn)室開始時(shí)都必須做的基本移液實(shí)驗(yàn)重要的作用。如果你能非常準(zhǔn)確地完成這些貢獻，那麼你可能就能完成我們實(shí)驗(yàn)室所需的所有實(shí)驗(yàn)。

Elaine 最初沒有程式設(shè)計(jì)經(jīng)驗(yàn)穩中求進，但透過學(xué)習(xí)統籌，她現(xiàn)在已經(jīng)成長為 Opentrons 的超級(jí)用戶！她的回饋幫助我們改善了使用者體驗(yàn)協同控製，她對(duì) Protocol Library 的貢獻(xiàn)使科學(xué)對(duì)每個(gè)人來說都更具可重複性振奮起來。