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2021 年 26 月 29 日

Opentrons客戶訪談 | 動(dòng)物健康實(shí)驗(yàn)室Prairie Diagnostic Services Inc的Anatoliy Trokhymchuk和Mengying Liu

本期客戶訪談我們邀請(qǐng)到了動(dòng)物健康實(shí)驗(yàn)室的Anatoliy Trokhymchuk和Mengying Liu更適合,他們將為我們分享他們使用Opentrons OT-2自動(dòng)化移液平臺(tái)進(jìn)行包括MALDI-TOF MS目標(biāo)製備在內(nèi)的質(zhì)譜應(yīng)用互動互補。

Anatoliy Trokhymchuk 是 Prairie Diagnostic Services Inc. (PDS) 的首席科學(xué)家統籌,該公司是薩斯喀徹溫大學(xué) 附屬的地區(qū)動(dòng)物健康實(shí)驗(yàn)室。 Mengying Liu 是PDS 處理流程改善與自動(dòng)化工作流程開發(fā)的自動(dòng)化研究員與時俱進。她的自動(dòng)化開發(fā)案例之一就是使用Opentrons OT-2 自動(dòng)化移液平臺(tái)進(jìn)行質(zhì)譜應(yīng)用,包括MALDI -TOF MS目標(biāo)製備共謀發展。

Opentrons: 請(qǐng)介紹一下您的研究背景堅持先行。

Mengying Liu: 我是 PDS 的研究助理。我在中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)獲得了獸醫(yī)博士學(xué)位拓展,然後來(lái)到薩斯喀徹溫大學(xué)攻讀獸醫(yī)病理學(xué)碩士學(xué)位創造更多。我在一月底開始為 PDS 工作。我對(duì)電腦程式設(shè)計(jì)很感興趣不斷進步,並將其與實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)相結(jié)合工藝技術,我很享受在 PDS 學(xué)習(xí)的時(shí)光。

Opentrons: 你們的研究計(jì)畫是什麼規模?

Anatoliy Trokhymchuk: 我是一名獸醫(yī)近年來,為一家地區(qū)性獸醫(yī)診斷實(shí)驗(yàn)室工作,我日常工作需要與各種客戶和專案打交道發展目標奮鬥。有些項(xiàng)目技術先進,如監(jiān)測(cè)測(cè)試和疫情應(yīng)對(duì),需要進(jìn)行大規(guī)模的檢測(cè)工作延伸。我們?cè)?PDS 有一群優(yōu)秀的人才健康發展,我的工作是激勵(lì)他們,並為他們提供工作必備工具的必要支撐。

Opentrons: 為什麼您會(huì)選擇OT-2長效機製?

Anatoliy Trokhymchuk: 隨著我們工作量的增加和診斷方法的日益改變講實踐,我們需要在實(shí)驗(yàn)室完成更多、更精確的常規(guī)奮戰不懈、重複性任務(wù)市場開拓,我們逐漸意識(shí)到自動(dòng)化才是實(shí)驗(yàn)室未來(lái)的趨勢(shì)。我們實(shí)驗(yàn)室已經(jīng)有了很多不同類型的機(jī)器人大大縮短,我們也正在快速學(xué)習(xí)如何使用 OT-2各項要求。在不久的將來(lái),我們將會(huì)有更多基於基因組的快速診斷工作越來越重要的位置,而自動(dòng)化是完成這些工作的重要部分。

我認(rèn)為人類在實(shí)驗(yàn)室的主要目標(biāo)是探索科學(xué)的邊界共同學習,並不斷嘗試科學(xué)創(chuàng)新順滑地配合。 – Mengying Liu

Opentrons: 你們使用OT-2做了哪些項(xiàng)目,它如何適應(yīng)你們的工作流程效高?

Anatoliy Trokhymchuk: 目前 OT-2 在我們實(shí)驗(yàn)室有兩個(gè)主要用途:一項(xiàng)是用於運(yùn)行 Mengying 正在使用的自動(dòng)化流程前沿技術,另一項(xiàng)是作學(xué)習(xí)工具。我們正在學(xué)習(xí)如何優(yōu)化協(xié)議和提高工作產(chǎn)出性能,以擴(kuò)大我們的業(yè)務(wù)。作為一個(gè)科學(xué)研究工具而言,我們非常喜歡 OT-2開展試點,但我們更它賦予的更大的探索價(jià)值:如何將更大的任務(wù)自動(dòng)化並將其整合到我們的工作流程中了解情況?

Opentrons: 在實(shí)驗(yàn)室裡,您的日常工作是怎麼樣的廣泛應用?您會(huì)使用到哪些檢測(cè)方法關註度?

Mengying Liu: 我的日常工作是致力於不同實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)的自動(dòng)化流程開發(fā)和運(yùn)行,例如 MALDI 目標(biāo)塗層哪些領域。我們的系統(tǒng)使用一個(gè)與製造商無(wú)關(guān)的 96 點(diǎn)靶敢於挑戰。我在我們實(shí)驗(yàn)室使用 OT-2 自動(dòng)化移液平臺(tái)創(chuàng)建了一個(gè)工作流程和協(xié)議。

在我們擁有 OT-2 之前建立和完善,我們的操作員需要手動(dòng)將基質(zhì)滴加到 96 個(gè)孔中提供了遵循,做這個(gè)步驟時(shí)細(xì)菌樣本已經(jīng)取樣到靶上了,這項(xiàng)工作其實(shí)很容易被機(jī)器人取代大型。此外基石之一,因?yàn)槲覀兪窃\斷實(shí)驗(yàn)室,我們必須確保沒有樣本污染能力建設,所以操作員每次操作都需要更換吸頭模樣。 OT-2 可以精確地處理到 0.1 mm 的移液,使我們能夠不接觸樣品就滴加基質(zhì)——我們整個(gè)靶只需要用到 8 個(gè)移液吸頭服務,減少了塑膠廢物很重要。

實(shí)驗(yàn)室不是一個(gè)整天在移液工作上浪費(fèi)時(shí)間的地方能力和水平,實(shí)驗(yàn)工作需要有生產(chǎn)力和創(chuàng)造力。 – Anatoliy Trokhymchuk

此外異常狀況,我們?cè)O(shè)計(jì)的協(xié)議很容易設(shè)定研究。這就是我們使用 OT-2 的原因:技術(shù)嫻熟的技術(shù)人員可以在 5 分鐘內(nèi)手動(dòng)執(zhí)行整套工作流程,OT-2也可以大致以相同的速度完成應用創新。但是 OT-2 的優(yōu)點(diǎn)是不需要高度熟練的技術(shù)人員也可以執(zhí)行相同的流程提高,這讓技術(shù)人員可以騰出時(shí)間做其他事情。我們正在努力在整個(gè)實(shí)驗(yàn)室中標(biāo)準(zhǔn)化這一點(diǎn)的特性。

我透過(guò)使用 Opentrons API 和自訂介面將 OT-2 連結(jié)到我們的 LIMS 系統(tǒng)以產(chǎn)生顯示對(duì)照品和樣品的板圖交流,我可以將其匯出為純文字檔案並上傳為我的協(xié)議。這節(jié)省了很多時(shí)間提供堅實支撐,並且可以輕鬆地與實(shí)驗(yàn)室的其他工具整合還不大。 OT-2 使用起來(lái)很容易,因?yàn)槲抑恍枰陂_始時(shí)校準(zhǔn)機(jī)器人一次信息化技術,每次可以執(zhí)行多達(dá) 8 個(gè)板發揮作用。我正在探索 OT-2 的其他應(yīng)用,讓它可以更輕鬆地投入其他實(shí)驗(yàn)室的工作逐步顯現。

OT-2 具有不同的整合潛力銘記囑托,因此當(dāng)完成 MALDI 工作流程時(shí),我會(huì)用它執(zhí)行其他工作流程自動化裝置。

Opentrons: 在疫情之前示範,您的常規(guī)日常工作是什麼?

Anatoliy Trokhymchuk: 我們現(xiàn)在在做的日常工作與疫情之前完全相同開展攻關合作。然而製度保障,在疫情期間,我們需要在實(shí)驗(yàn)室戴口罩的有效手段,並遵循公共衛(wèi)生部門規(guī)定的所有預(yù)防措施統籌推進。我們認(rèn)為我們的服務(wù)是必不可??少的,儘管我們不知道這裡的疫情會(huì)發(fā)展到什麼程度大大提高,也不知道我們的實(shí)驗(yàn)室是否會(huì)被要求提供檢測(cè)支持的必然要求,但我們的職能和工作沒有改變。我們沒有直接參與疫情應(yīng)對(duì)取得了一定進展,但我們?cè)诩幽么罂笨耸〉貐^(qū)的同行們將他們的動(dòng)物衛(wèi)生實(shí)驗(yàn)室用於新冠病毒檢測(cè)完善好。

Opentrons: 您有其他自動(dòng)化專案的計(jì)畫嗎?

Anatoliy Trokhymchuk: 我希望看到我們實(shí)驗(yàn)室的所有自動(dòng)化工具能夠無(wú)縫地協(xié)同工作積極參與,然後我可以將很多常規(guī)的實(shí)驗(yàn)室任務(wù)交給機(jī)器人去執(zhí)行問題分析,而我們技術(shù)人員則負(fù)責(zé)過(guò)程監(jiān)督、控制和開發(fā)應(yīng)用程式。實(shí)驗(yàn)室不是一個(gè)整天在移液工作上浪費(fèi)時(shí)間的地方更加完善,實(shí)驗(yàn)工作需要有生產(chǎn)力和創(chuàng)造力形式。

Mengying Liu: 那也是我衷心期望希望看到的未來(lái)??!我相信有一天所有這些重複性的工作都將被自動(dòng)化取代支撐作用。我認(rèn)為人類在實(shí)驗(yàn)室的主要目標(biāo)是探索科學(xué)的邊界日漸深入,並不斷嘗試科學(xué)創(chuàng)新。不是把時(shí)間消耗在重複性的工作同時,而是做更多實(shí)驗(yàn)創(chuàng)新等專案互動式宣講。

Opentrons: 關(guān)於OT-2的使用體驗(yàn),您還有什麼想分享給大家的模式?

Anatoliy Trokhymchuk: 關(guān)於實(shí)驗(yàn)的工作流程設(shè)計(jì)自動化,我們需要學(xué)習(xí)的地方還有很多,不只是自動(dòng)化高品質。這是一個(gè)循序漸進(jìn)的過(guò)程落地生根。我們正在逐步學(xué)習(xí),並且優(yōu)先攻克主要項(xiàng)目健康發展。最終,將整個(gè)工作流程交給機(jī)器人平臺(tái)是一個(gè)很好的想法大數據,但我認(rèn)為我們還很遠(yuǎn)長效機製。儘管如此,由於 Opentrons 獨(dú)特的靈活性和開源特質(zhì)數字技術,為我們提供了全流程自動(dòng)化邁進(jìn)的機(jī)會(huì)奮戰不懈。

Mengying Liu: 我真的很喜歡 OT-2 的彈性。有些公司只設(shè)計(jì)用於 MALDI 的機(jī)器措施,但我們?cè)?OT-2 上可以做很多不同的協(xié)議大大縮短。

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