本期客戶訪談將為大家介紹一家正在顛覆自動化染色產(chǎn)業(yè)的生物技術(shù)公司Parhelia Bio持續發展，他們使用Opentrons創(chuàng)造了一臺靈活且價(jià)格實(shí)惠的玻片和蓋玻片染色設(shè)備結構不合理。

生技公司Parhelia Bio 的共同創(chuàng)辦人Nikolay Samusik 和 Yury Goltsev 開發(fā)了一個(gè)插件模組（並已獲得專利）堅實基礎。這個(gè)模組可將任何自動化移液平臺轉(zhuǎn)變?yōu)轱@微鏡樣本的自動染色機(jī)∵^程中，F(xiàn)在取得顯著成效，他們使用Opentrons OT-2 自動化移液平臺和Opentrons Python 協(xié)議API 來自動化常規(guī)免疫螢光體製、Akoya 的CODEX 以及IHC 與FFPE 樣本上的抗原恢復(fù)等染色方案重要的作用。

Opentrons: 你們是如何想到讓 Parhelia 設(shè)備使用液體處理器自動染色載玻片這個(gè)想法的？

Nikolay Samusik:  Parhelia PAR2 設(shè)備的想法和需求源於我們在史丹佛大學(xué) Garry Nolan 實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行的研究調整推進，當(dāng)時(shí)我們正在研究一種名為 CODEX 的超高多重發(fā)現(xiàn)組織染色方案。 CODEX 及其臨床級高通量夥伴OPAL 目前由我們創(chuàng)立的另一家公司－ Akoya Biosciences 進(jìn)行分銷機製性梗阻。

Yury Goltsev: 在開發(fā)CODEX機製、OPAL 和其他先進(jìn)的組織染色方法的過程中，我們了解到像RNA FISH 和多重IHC 這樣的複雜方案雖然對我們這些開發(fā)人員來說很容易集成應用，但對使用者來說卻很困難探討，學(xué)習(xí)曲線可能相當(dāng)高效果。多步驟處理需要花費(fèi)很多時(shí)間，根據(jù)抗體/探針的孵育時(shí)間合規意識，整個(gè)程序很容易需要超過一天的時(shí)間密度增加，而且對於新手學(xué)生和經(jīng)驗(yàn)豐富的技術(shù)人員來說，很難避免手動移液錯誤體製。我們意識到我們需要一種特殊的設(shè)備來自動化染色構建，但是市面上大部分自動化的起始價(jià)超過 15 萬美元，我們實(shí)驗(yàn)室負(fù)擔(dān)不起服務延伸。我們也找不到可以處理蓋玻片的自動染色機(jī)——就是 CODEX 中使用的平面支撐介質(zhì)共創輝煌。

Opentrons: 為什麼組織染色如此困難？

Yury Goltsev: 因?yàn)樵诮M織染色過程中進一步，多步驟的處理和學(xué)習(xí)新的染色方案需要大量的實(shí)踐和努力大部分。要運(yùn)行涉及大量組織樣本處理的調(diào)查項(xiàng)目，您必須擁有一個(gè)專職的技術(shù)人員（或甚至一個(gè)技術(shù)團(tuán)隊(duì)）勤勉地遵循所有步驟進(jìn)行操作實際需求。一個(gè)處理複雜的多色染色的博士後將花費(fèi)大部分時(shí)間在實(shí)驗(yàn)臺上解決方案，沒有時(shí)間閱讀和分析數(shù)據(jù)。這導(dǎo)致了許多不必要的體力勞動善謀新篇，並導(dǎo)致了實(shí)驗(yàn)是否可重複的問題增產，我們認(rèn)為只有透過有效的自動化才能解決這些問題。

Opentrons: 您是如何將 OT-2 整合到您的實(shí)驗(yàn)室中的方法？

Yury Goltsev:  我們沒有花費(fèi)25 萬美元購買市面上的全自動染色機(jī)行動力，而是購買了一臺200 美元的3D 列印機(jī)，它基本上可以完成相同的工作切實把製度，實(shí)現(xiàn)XYZ 工具定位的自動化保供。但是，當(dāng)我們看到 OT-2 時(shí)進行部署，我們認(rèn)為它是我們的理想選擇：它具備我們所需的功能責任，外觀漂亮，性價(jià)比高利用好，而且我們可以將其與我們的設(shè)備整合到一起深入各系統。

Opentrons: 在使用 OT-2 之前，您是否了解其他自動液體處理設(shè)備系列？

Nikolay Samusik:  不是很了解作用，但我們有具備程式設(shè)計(jì)知識，OT-2 平臺具備獨(dú)特的開源性慢體驗，所以我們可以使用Python 輕鬆地與 OT-2 互動和進(jìn)行開發(fā)著力增加。

Opentrons: 您的 OT-2 啟動和運(yùn)作的情況如何？

Yury Goltsev:  對我們來說，OT-2 運(yùn)作體驗(yàn)非常好處理。 OT-2 的優(yōu)點(diǎn)是它能夠支援至少三種方式與它互動技術研究，例如Jupyter notebooks、SSH shell 和 Opentrons Python API 開展研究。而且讓我覺得了不起的一點(diǎn)是姿勢，協(xié)議是在設(shè)備上運(yùn)行的，而不是在電腦上運(yùn)行首要任務，所以如果電腦與機(jī)器人斷開連接或出現(xiàn)問題綠色化，設(shè)備仍然會繼續(xù)運(yùn)行協(xié)議。

Opentrons: 在設(shè)定您的 OT-2 時(shí)發展，您遇到過什麼困難嗎保持穩定？

Yury Goltsev:  我們發(fā)現(xiàn)，根據(jù) Opentrons APP 的韌體版本指引面向，初始校準(zhǔn)的過程可能會有點(diǎn)困難支撐作用。但Opentrons 的客戶支援團(tuán)隊(duì)一直以來都能快速回應(yīng)，幫助我們解決問題建設項目。綜合而言我們認(rèn)為這是一個(gè)非常出色的設(shè)備最為突出，運(yùn)行過程非常順利，我們喜歡它講道理。

Opentrons: 請與我們分享一下關(guān)於使用 OT-2 自動化 FFPE 抗原修復(fù)的情況發展目標奮鬥。

Nikolay Samusik:  到目前為止技術先進，我們最大的成就之一是在 IHC 方案中自動化 FFPE 抗原修復(fù)（一種需要精確高溫處理的抗原表位去掩蔽步驟）更多的合作機會。我們透過使用 Parhelia PAR2 設(shè)備與 Opentrons 溫度模組 實(shí)現(xiàn)了這一點(diǎn)。市面上很少有其他染色機(jī)能夠同時(shí)進(jìn)行熱處理和染色認為，而大型儀器供應(yīng)商對於具備能單一儀器中實(shí)現(xiàn)抗原修復(fù)與抗體染色能力的設(shè)備收取的費(fèi)用會更高服務好。 OT-2 不一樣，它使我們能夠利用機(jī)載溫度模組運(yùn)行溫度控制的實(shí)驗(yàn)反應能力，並為我們打開了全新的協(xié)議範(fàn)圍共謀發展，現(xiàn)在我們可以做高端自動染色機(jī)可以做的一切。

Opentrons: 告訴我們關(guān)於使用 OT-2 對實(shí)驗(yàn)液體進(jìn)行的一系列操作和處理的體驗(yàn)如何結構重塑。

Yury Goltsev:  我們的設(shè)備非常精巧且易於攜帶聽得懂，因此我們能夠?qū)⑺袞|西放入96孔板的板位（SBS板位）中，並使其與所有自動化移液設(shè)備兼容高質量發展。其次全方位，我們希望所有液體都放在盒子裡，因?yàn)檫@有助於保持濕度並防止生物危害洩漏影響力範圍。對於危險(xiǎn)樣本先進技術，它們也完全可以使用我們的設(shè)備進(jìn)行密封，您可以做任何事情，並在需要時(shí)安全地丟棄盒子宣講手段。我們相信這在處理高度傳染性疾仓匾ぞ?。ㄈ鏑OVID-19）方面尤其重要。

Opentrons: 您目前對市場拓展有哪些願景配套設備？

Yury Goltsev:  我們非掣鼉炠|？春冒l(fā)展中國家市場，因?yàn)槲覀兊漠a(chǎn)品比其他自動染色機(jī)便宜很多推進高水平，實(shí)際上便宜了20 倍技術創新。對於非洲或拉丁美洲或任何研究預(yù)算緊湊的地方來說，這是一個(gè)很好的選擇資料。

Opentrons: 關(guān)於使用 OT-2廣泛應用，您還有其他想跟大家分享的嗎？

Nikolay Samusik: OT-2 和 Opentrons 為我們帶來了巨大的啟發(fā)橫向協同。這家公司顛覆了液體處理市場哪些領域，並且與我們想要顛覆自動染色市場的方式不謀而合。大多數(shù)實(shí)驗(yàn)室沒有自動化移液設(shè)備不斷創新，正是因?yàn)樗麄兊念A(yù)算無法負(fù)擔(dān)建立和完善，而且大部分自動化移液設(shè)備都非常複雜且難以使用。但我們使用了 OT-2 之後參與水平，實(shí)際經(jīng)驗(yàn)告訴我們 OT-2 與傳統(tǒng)的自動化移液設(shè)備不一樣大型。

Yury Goltsev: 我們有一個(gè)宏偉的計(jì)劃。坦白說明確相關要求，我們的設(shè)備不只是一個(gè)載玻片染色機(jī)重要意義。我們計(jì)劃將其與顯微鏡結(jié)合使用。例如深化涉外，蓋玻片在染色組織以外的各種研究背景下都有使用體系。我們的設(shè)備可以自動處理排列在玻璃上的蛋白質(zhì)、DNA 或化學(xué)物質(zhì)開展試點。你可以放入任何需要層流液交換的樣本攜手共進，然後讓我們的裝置與 OT-2 一起為系統(tǒng)建立層流情況來處理它。 Opentrons 為我們打開了無限可能推進一步。