Carlos Goller 使用 Opentrons 系列設(shè)備幅度，包括 OT-2前來體驗、開源 API提高、磁性模組和熱循環(huán)模組，在北卡羅來納州立大學(xué)教授生物技術(shù)和分子生物學(xué)實驗室課程。

本期我們訪談的客戶Carlos C. Goller 是< a >北卡羅來納州立大學(xué)(NCSU)生物科學(xué)系副教授，為本科生和研究生教授生物技術(shù)真正做到。他在生物技術(shù)和分子實驗室課程中，使用到了 Opentrons OT-2 自動化移液機器人創新延展、溫控模組強化意識、磁性模組和熱循環(huán)模組等進行教學(xué)。本期 Carlos 將為我們分享他的使用體驗基本情況。

Opentrons: 請簡單介紹一下您的研究背景現場。

Carlos Goller: 我是北卡羅來納州立大學(xué)生物技術(shù)計畫的助理教授，也是一名微生物學(xué)家力量，本科時還在馬薩諸塞州的一所小型工程學(xué)校學(xué)習(xí)了電腦建模我有所應。我在埃默里大學(xué)獲得了微生物學(xué)和分子遺傳學(xué)博士學(xué)位。博士生學(xué)習(xí)期間深入實施，我在研究大腸桿菌生物膜的形成至關重要，同時在學(xué)校教書和上課。後來功能，我在杜克醫(yī)學(xué)中心做博士後研究應用的因素之一，專注於傳染病和抗感染藥物課題，這段經(jīng)驗讓我第一次體驗了實驗室自動化廣泛關註。

Opentrons: 您的研究計畫是什麼善於監督？

Carlos Goller: 我在 NCSU 向?qū)W生教授生物技術(shù)，有時也向教職員教授生物技術(shù)就能壓製。在我的課程中更合理，我們使用 OT-2 自動化移液機器人和 Zymo 研究套件進行 DNA 和 RNA 萃取。我們現(xiàn)在有一個 Opentrons 熱循環(huán)模組，並將嘗試製作我們自己的 RNAseq 庫各方面。

Opentrons: 為什麼選擇 OT-2 防控？

Carlos Goller: 身為杜克大學(xué)的博士後研究員，我和 Pat Seed 博士輪流使用一個多通道移液器篩選了 2500 種化合物適應性。我們的檢測目標是找出對泌尿道致病性大腸桿菌莢膜生物合成具有良好活性的化合物堅實基礎。在北卡羅來納州立大學(xué)，我們購買了一臺 ePMotion 5075 液體處理機器人重要作用，並在接下來的幾年實驗工作中持續(xù)運作使用等地。我們也申請了內(nèi)部資金購買 Opentrons 自動化移液平臺。

與其他實驗室自動化設(shè)備相比尤為突出，OT-2 的價格實惠規定，對於普通教學(xué)實驗室而言不會產(chǎn)生太多預(yù)算壓力。 Opentrons 軟體也是開源的空間載體，這一點我們很喜歡高質量。不必被單一軟體捆綁，以及不用取得許可證重要組成部分，Opentrons 的靈活性是關(guān)鍵優(yōu)勢流程。

在編寫程式碼方面，多虧了Opentrons 的線上協(xié)議編輯器勃勃生機，讓我的學(xué)生們在不具備Python 基礎(chǔ)的情況下助力各業，也能夠透過修改Opentrons 的開源協(xié)議，以更好地適應(yīng)他們在實驗室中的工作流程廣度和深度。

我不想讓我的班級的 12 個人全部圍在2臺機器人周圍深入交流。我們有 2 臺 OT-2 和 ePMotion引領作用，所以我把大家分成4 人一組科技實力，分別負責(zé)對應(yīng)的設(shè)備程式設(shè)定工作。透過把團隊拆分成更小的小組建設，讓所有人都有機會嘗試讓機器運行這項挑戰(zhàn)在此基礎上。

在傳統(tǒng)的學(xué)術(shù)教育環(huán)境中，學(xué)生可能沒有機會親身參與大規(guī)模前來體驗、高度自動化的實驗室研究自主研發。所以，我在北卡羅來納州立大學(xué)提出用機器人傳授一門課程更加廣闊，並寫了一份 NSF 提案損耗。該提案旨在建立一個教育工作者網(wǎng)絡(luò)，我與 UNC Chapel Hill 的 Sabrina Robertson 博士一起建立案例研究非常完善，向?qū)W生傳授高通量藥物篩選性能穩定、顯微鏡和其他高通量應(yīng)用的方法。

Opentrons: 您覺得OT-2對您幫助最大的是哪方面？

Carlos Goller: OT-2 讓學(xué)生有更多的時間在設(shè)備上操作情況正常，在實驗室進行故障排除行業分類，而不用把時間浪費在繁瑣的工作上。但目前我們遇到了一些小問題——其中一臺 OT-2 無法連接——但這也只是自動化過程的一部分提高鍛煉，學(xué)生們欣然接受了挑戰(zhàn)發展邏輯。

Opentrons: 您的 OT-2 運作體驗如何？

Carlos Goller: 去年有所提升，我們?yōu)橐粋€研究生提供了第一臺 OT-2聽得進，並讓他們從零開始設(shè)置，用水和食用色素進行練習(xí)先進水平。我們把協(xié)議設(shè)定得相對複雜更多可能性，但這個學(xué)生只花了兩個多小時就弄清楚如何使用 OT-2。他們非常積極地提出問題——並且任然足夠的實力、熱情地投入研究工作緊迫性！

Opentrons: 在您擁有OT-2之前，您使用過其他實驗室自動化設(shè)備嗎更適合？您對實驗室自動化流程的期望是什麼高效？

Carlos Goller: 我曾經(jīng)使用過 ePMotion 5075，並創(chuàng)建了幾個腳本來實現(xiàn)自動化 HIT 採摘要素配置改革、藥物篩選體系、細菌稀釋和 qPCR。身為工程師而言影響力範圍，我很喜歡自動化大局。

Opentrons: 您有進行其他專案自動化的計畫嗎？

Carlos Goller: 我們正在努力發(fā)展一個高通量定序的操作課程邁出了重要的一步。我們可以使用流式細胞儀以及 Opentrons OT-2 自動化移液機器人進行課程有序推進。我希望透過這兩套儀器的組合可以幫助一年級和二年級的學(xué)生更好地理解高通量的操作方法。

Opentrons: 您還有其他關(guān)於 OT-2 的使用體驗想要分享的嗎需求？

Carlos Goller:  今年我們將更深入研究實驗室自動化堅定不移。 我們一直在與 Opentrons 合作開展一個公民科學(xué)項目，並困擾了 Opentrons 支援團隊的 Max Marrone（他非常棒８屛颐靼琢?。┯y而上。該計畫旨在尋找一種奇怪的微生物，它可以吸收液態(tài)金並將其沉澱成奈米顆粒探索，所以對於學(xué)生來說堅持先行，這確實是一個很好的吸引，但我們對他們的基因組或表達的基因知之甚少滿意度。

在今年情況較常見，我們非常關(guān)注實驗室自動化狀況。我們在與Opentrons 合作開展一個全民科學(xué)項目，我們與Opentrons 的應(yīng)用支援團隊的Max Marrone 一起攻克難題機製，他給了我們很棒的支持全過程！該計畫是關(guān)於尋找一種可以吸收液態(tài)金並將其沉澱成奈米顆粒的特殊微生物，這對學(xué)生來說是一個非常好的學(xué)習(xí)機會探討。

我們也與Zymo合作不負眾望，在OT-2上實現(xiàn)mag磁珠、trizol和RNA-seq協(xié)議的自動化調解製度。我們的目標是每個小組將接受為期6週的半學(xué)期專案挑戰(zhàn)精準調控，他們將學(xué)習(xí)如何使用OT-2進行RNA萃取。我們購買了Opentrons移液器應用的因素之一、Opentrons磁性模組和Opentrons溫度模組來進行實驗操作解決。

我們意識到我們可能無法完全實現(xiàn)這一目標，但我們會不斷嘗試這些具有挑戰(zhàn)性敢於監督、涉及多種技術(shù)和故障排除協(xié)議的專案幅度。

我相信這些課程能夠為學(xué)生提供寶貴的實務(wù)經(jīng)驗，對此我真的感覺很榮幸重要的作用。使用OT-2的體驗真的很開心貢獻。