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2019 年 22 月 4 日

開(kāi)源在生物學(xué)中的力量 - DAMP 實(shí)驗(yàn)室的 10,000 美元生物工廠

一個(gè)強(qiáng)大的生物工廠不需要數(shù)百萬(wàn)美元的投資——經(jīng)濟(jì)實(shí)惠的開(kāi)源工具讓每個(gè)實(shí)驗(yàn)室都有可能實(shí)現(xiàn)這些功能行業分類。

DAMP 實(shí)驗(yàn)室是波士頓大學(xué)生物設(shè)計(jì)中心內(nèi)一個(gè)新創(chuàng)的生物工廠。該實(shí)驗(yàn)室僅使用不到 10,000 美元的開(kāi)源軟體和硬件,就為科學(xué)界提供了 30 種合成生物學(xué)方案(如DNA組裝配套設備、轉(zhuǎn)化開展、測(cè)序和質(zhì)粒純化等)效率,並以此收取服務(wù)費(fèi)關註度。任何科學(xué)家都可以透過(guò)造訪 DAMP 實(shí)驗(yàn)室的網(wǎng)頁(yè)介面遠(yuǎn)端指定實(shí)驗(yàn)計(jì)劃範圍和領域,其自動(dòng)化系統(tǒng)能夠設(shè)計(jì)簡單化、建置和測(cè)試該計(jì)劃力度。

他們是如何做到的呢?

透過(guò)整合一系列開(kāi)源工具系統性,DAMP實(shí)驗(yàn)室能夠快速開(kāi)發(fā)一個(gè)複雜的系統(tǒng)善謀新篇,該系統(tǒng)能夠高效且優(yōu)雅地自動(dòng)化執(zhí)行生物迴路測(cè)試。其中一些關(guān)鍵的開(kāi)源工具包括:

  • cello 使用Verilog編程語(yǔ)言實(shí)現(xiàn)生物回路的自動(dòng)化設(shè)計(jì)便利性。
  • aquarium 用于實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng)(LIMS)方法,實(shí)現(xiàn)作業(yè)排隊(duì)和庫(kù)存管理。
  • open TR ONS 的OT-2移液機(jī)器人:用于自動(dòng)化DNA組裝提供有力支撐、轉(zhuǎn)化和其他許多方案切實把製度。

您可以在 Synbiobeta 部落格上了解更多關(guān)於 DAMP 實(shí)驗(yàn)室技術(shù)堆疊的資訊。

為什麼DAMP實(shí)驗(yàn)室的生物工廠和開(kāi)源技術(shù)如此重要自行開發?

DAMP實(shí)驗(yàn)室在影片中談到了開(kāi)源技術(shù)和它賦予的能力進行部署。

該專案展示了開(kāi)源軟體和硬體在實(shí)驗(yàn)室中的力量。如果手動(dòng)執(zhí)行所有這些流程應用情況,DAMP實(shí)驗(yàn)室需要一週時(shí)間來(lái)設(shè)計(jì)保護好、建造和測(cè)試10個(gè)基因迴路。透過(guò)在開(kāi)源技術(shù)上投入相對(duì)較少的資金,DAMP實(shí)驗(yàn)室的吞吐量提高了10倍運行好。

結(jié)果就是首次,DAMP實(shí)驗(yàn)室能夠用相同的設(shè)施和團(tuán)隊(duì)執(zhí)行10倍的實(shí)驗(yàn)。開(kāi)源工具提高了生產(chǎn)效率部署安排,大大降低了執(zhí)行複雜實(shí)驗(yàn)的成本搖籃。

一個(gè)強(qiáng)大的生物工廠不需要數(shù)百萬(wàn)美元的投資——經(jīng)濟(jì)實(shí)惠的開(kāi)源工具讓每個(gè)實(shí)驗(yàn)室都有可能實(shí)現(xiàn)這些功能。

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